Producten

DNA/RNA-sequencing – Illumina-sequencer

DNA/RNA-sequencing – Uitgelichte afbeelding Illumina Sequencer

Illumina-sequencingtechnologie, sequencing by synthese (SBS), is wereldwijd een algemeen aanvaarde next-generation sequencing-technologie (NGS), die verantwoordelijk is voor het genereren van meer dan 90% van 's werelds sequencing-gegevens.Een fluorescent gelabelde omkeerbare terminator wordt afgebeeld terwijl elke dNTP wordt toegevoegd, en vervolgens gesplitst om opname van de volgende base mogelijk te maken.Omdat alle vier de omkeerbare terminator-gebonden dNTP's aanwezig zijn tijdens elke sequencingcyclus, minimaliseert natuurlijke concurrentie de incorporatiebias.De methode elimineert vrijwel alle fouten en gemiste oproepen die verband houden met reeksen herhaalde nucleotiden (homopolymeren).Illumina-sequencing door synthesetechnologie ondersteunt zowel single-read als paired-end bibliotheken.SBS-technologie biedt een mogelijkheid tot paired-end met korte inserts voor genoomsequencing met hoge resolutie, evenals reads met gepaarde uiteinden met lange inserts voor efficiënte sequentie-assemblage, de novo-sequencing en meer.De combinatie van korte inserts en langere reads vergroot het vermogen om elk genoom volledig te karakteriseren.

Neem contact met ons op

Servicedetails

Demoresultaat

Servicedetails Kenmerken

Platform

Sequencing-modus

Toepassingen

Illumina Nova-systeem

SE50

PE50

PE150

PE250

1. Sequentieer snel hele genomen

2. Zoom in om doelgebieden diepgaand te sequencen

3. Gebruik RNA-sequencing (RNA-Seq) om nieuwe RNA-varianten en splitsingsplaatsen te ontdekken, of mRNA's te kwantificeren voor analyse van genexpressie

4. Analyseer epigenetische factoren zoals genoombrede DNA-methylatie en DNA-eiwitinteracties

5. Sequentie van kankermonsters om zeldzame somatische varianten, tumorsubklonen en meer te bestuderen. Bestudeer de microbiële diversiteit bij mensen of in het milieu

Servicevoordelen

● Uitgebreide ervaring op het Illumina-sequencingplatform met duizenden gesloten projecten met verschillende soorten.
● Volwassen sequencingproces met korte doorlooptijd.
● Volledige downstream bio-informatica-analysediensten.
● Strikt kwaliteitscontrolesysteem: strikte QC-standaard voor sequencing-gegevens.

Voorbeeldvereisten*

Sequentieplatform & Sequentiestrategie	Gegevenshoeveelheid	Concentratie (Thermo Life Qubit 3.0)	Volume	Hoeveelheid	QC-resultaat
Novaseq-systeem, gepaarde uiteinde 150bp	X≤30Gb	≥1ng/μl	≥20 μl	≥20ng	Gekwalificeerd
	30 Gb < X≤100 Gb	≥1ng/μl	≥25 μl	≥30ng
	X>100Gb	≥2ng/μl	≥25 μl	≥50ng

Opmerking:

Naast concentratie en totale hoeveelheid is ook een geschikt piekpatroon vereist.

Enkele rijstrook (Illumina)

Platform	Concentratie (qPCR nM)	Volume	QC-resultaat
HiseqXten	≥2,5 nM	≥20μL	Gekwalificeerd
NovaSeq 6000 S4	≥2nM	≥30μL
Nova Seg 6000 SP	≥2nM	≥30μL

Neem contact met ons op als uw monsters niet voldoen aan de uitgangsmateriaalvereisten.

Neem contact met ons op

Serviceworkflow

Kwaliteitscontrole van de bibliotheek

Volgorde aanbrengen in

Controle van de gegevenskwaliteit

Projectoplevering

Vorig: DNA/RNA-sequencing -PacBio-sequencer

Volgende: DNA/RNA-sequencing – Nanopore-sequencer

Gegevenskwaliteitsbeoordeling van RNA-monster

Tabel 1. Statistieken over sequentiegegevens.

Monster-ID	BMKID	Rauw leest	Ruwe gegevens (bp)	Schone metingen (%)	Q20(%)	Q30(%)	GC(%)
C_01	BMK_01	22.870.120	6.861.036.000	96.48	99.14	94,85	36.67
C_02	BMK_02	14.717.867	4.415.360.100	96.00 uur	98,95	93,89	37.08