Producten

BMKMANU S1000 Ruimtelijk transcriptoom

De ruimtelijke organisatie van cellen speelt een cruciale rol in verschillende biologische processen, zoals immuuninfiltratie, embryo-ontwikkeling, enz. Ruimtelijke transcriptoomsequencing, die genexpressieprofilering aangeeft terwijl informatie over de ruimtelijke positie behouden blijft, heeft geweldige inzichten opgeleverd in de weefselarchitectuur op transcriptoomniveau.Met de ontwikkeling van technologie moeten de ultraheldere weefselmorfologie en het echte structurele verschil in ruimtelijke moleculaire expressie met een hogere resolutie worden bestudeerd.BMKGENE biedt uitgebreide, one-stop-service voor ruimtelijke transcriptoomsequencing, van monsters tot biologische inzichten.

Ruimtelijke transcriptomics-technologieën hebben nieuwe perspectieven in diverse onderzoeksarena mogelijk gemaakt door het genexpressieprofiel op te lossen met ruimtelijke inhoud in heterogene monsters.

Ruimtelijke transcriptoomchip: BMKMANU S1000

Platform: Illumina NovaSeq-platform

Neem contact met ons op

Servicedetails

Bio-informatica

Demoresultaten

BMKMANU S1000 Ruimtelijk transcriptoom technisch schema

Voordelen van BMKMANU S1000

1) Subcellulaire resolutie: elk opnamegebied bevatte >2 miljoen ruimtelijke streepjescodevlekken met een diameter van 2,5 µm en een afstand van 5 µm tussen de vlekcentra, waardoor ruimtelijke transcriptoomanalyse met subcellulaire resolutie (5 µm) mogelijk werd.

2) Analyse op meerdere niveaus: Flexibele analyse op meerdere niveaus, variërend van 100 μm tot 5 μm, om diverse weefselkenmerken met optimale resolutie op te lossen.

3) Uitgebreide transcriptoomprofilering: transcripties die van het gehele weefselglaasje zijn vastgelegd, kunnen worden geanalyseerd, zonder beperking op het aantal doelgenen en het doelgebied.

Servicespecificaties

Bibliotheek	Sequentiestrategie	Gegevensuitvoer aanbevolen
S1000 cDNA-bibliotheek	BMKMANU S1000-Illumina PE150	60 Gb/monster

Voorbeeldvereisten

Steekproef	Nummer	Maat	RNA-kwaliteit
OCT ingebed weefselblok	2-3 blokken/monster	Ongeveer.6,8x6,8x6,8 mm³	RIN≥7

Voor meer informatie over begeleiding bij monstervoorbereiding en serviceworkflow kunt u gerust contact opnemen met eenBMKGENE-expert

Servicewerkstroom

Experimentontwerp

Levering van monsters

Experimenteer vooraf

Ruimtelijke barcodes

Bouw van bibliotheek

Volgorde aanbrengen in

Gegevensanalyse

After-sales diensten

Vorig: 10x Genomics Visium ruimtelijk transcriptoom

Volgende: Sequencing van het hele genoom van planten en dieren

De door BMKMANU S1000 gegenereerde gegevens worden geanalyseerd met behulp van de software “BSTMatrix”, die onafhankelijk is ontworpen door BMKGENE, waaronder:

1) Generatie van genexpressiematrixen
2) HE-beeldverwerking
3) Compatibel met downstream software van derden voor analyse
4) Online “BSTViewer” helpt bij het verkrijgen van visualisatieresultaten met verschillende resoluties.

1. Spotclustering

s1000 (4)