हीटम्याप ड्रयर ताप नक्सा रेखाचित्रको लागि प्रयोग गरिन्छ, जसले म्याट्रिक्स डेटा फिल्टर, सामान्य र क्लस्टर गर्न सक्छ। यो प्राय: विभिन्न नमूनाहरू बीच जीन अभिव्यक्ति स्तरको क्लस्टर विश्लेषणको लागि प्रयोग गरिन्छ।
NR, KEGG, COG, SwissProt, TrEMBL, KOG, Pfam लगायत डाटाबेसमा अनुक्रमहरू पङ्क्तिबद्ध गरेर FASTA फाइलमा अनुक्रमहरूमा जैविक कार्यहरू संलग्न गर्दै।
BLAST (आधारभूत स्थानीय पङ्क्तिबद्ध खोज उपकरण) एक एल्गोरिथ्म र समान जैविक अनुक्रमहरू भएका क्षेत्रहरू फेला पार्ने कार्यक्रम हो।यसले यी अनुक्रमहरूलाई अनुक्रम डाटाबेसहरूसँग तुलना गर्दछ र सांख्यिकीय महत्त्व गणना गर्दछ।BLAST मा अनुक्रम प्रकारको आधारमा चार प्रकारका उपकरणहरू हुन्छन्: blastn, lastp, blastx र tblastn।