BMKCloud Log in
条形 ब्यानर-03

उत्पादनहरू

स्पेसिफिक-लोकस एम्प्लीफाइड फ्र्याग्मेन्ट सिक्वेन्सिङ (SLAF-Seq)

उच्च-थ्रुपुट जीनोटाइपिङ, विशेष गरी ठूलो मात्रामा जनसंख्यामा, आनुवंशिक एसोसिएशन अध्ययनहरूमा एक आधारभूत चरण हो, जसले कार्यात्मक जीन खोज, विकासवादी विश्लेषण, इत्यादिको लागि आनुवंशिक आधार प्रदान गर्दछ। गहिरो सम्पूर्ण जीनोम पुन: अनुक्रमणको सट्टा, कम प्रतिनिधित्व जीनोम अनुक्रमण (RGS)। ) प्रति नमूना अनुक्रम लागत कम गर्न को लागी पेश गरिएको छ, जबकि आनुवंशिक मार्कर खोज मा उचित दक्षता कायम राख्दै।यो सामान्यतया दिइएको साइज दायरा भित्र प्रतिबन्ध टुक्रा निकालेर प्राप्त गरिन्छ, जसलाई कम प्रतिनिधित्व पुस्तकालय (RRL) नाम दिइएको छ।स्पेसिफिक-लोकस एम्प्लीफाइड फ्र्याग्मेन्ट सिक्वेन्सिङ (SLAF-Seq) एक सन्दर्भ जीनोमको साथ वा बिना SNP जीनोटाइपिङको लागि एक आत्म-विकसित रणनीति हो।
प्लेटफर्म: Illumina NovaSeq प्लेटफर्म


सेवा विवरण

डेमो परिणामहरू

विशेष प्रकाशनहरू

सेवा विवरण

प्राविधिक योजना

१११

कार्य प्रवाह

流程图

सेवा लाभहरू

उच्च मार्कर खोज दक्षता- उच्च-थ्रुपुट अनुक्रमण प्रविधिले SLAF-Seq लाई सम्पूर्ण जीनोम भित्र सयौं हजारौं ट्यागहरू पत्ता लगाउन मद्दत गर्दछ।

जीनोममा कम निर्भरता- यो एक सन्दर्भ जीनोम संग वा बिना प्रजाति मा लागू गर्न सकिन्छ।

लचिलो योजना डिजाइन- एकल-इन्जाइम, डुअल-इन्जाइम, बहु-इन्जाइम पाचन र विभिन्न प्रकारका इन्जाइमहरू, सबै फरक अनुसन्धान लक्ष्य वा प्रजातिहरू पूरा गर्न चयन गर्न सकिन्छ।सिलिकोमा पूर्व-मूल्याङ्कन इष्टतम इन्जाइम डिजाइन सुनिश्चित गर्न प्रयोग गरिन्छ।

कुशल इन्जाइमेटिक पाचन- पूर्व-प्रयोग सर्तहरूलाई अनुकूलन गर्नको लागि गरिएको थियो, जसले औपचारिक प्रयोगलाई स्थिर र भरपर्दो बनाउँछ।टुक्रा संग्रह दक्षता 95% भन्दा बढी हासिल गर्न सक्छ।

समान रूपमा वितरित SLAF ट्यागहरू- SLAF ट्यागहरू सबै क्रोमोजोमहरूमा समान रूपमा वितरित हुन्छन्, औसत 1 SLAF प्रति 4 kb प्राप्त गर्दै।

दोहोरिने प्रभावकारी बेवास्ता- SLAF-Seq डेटामा दोहोरिने क्रम 5% भन्दा कममा घटाइएको छ, विशेष गरी उच्च स्तरको दोहोर्याउने प्रजातिहरूमा, जस्तै गहुँ, मकै, आदि।

व्यापक अनुभव- बिरुवा, स्तनपायी, चराचुरुङ्गी, कीरा, एक्वा-अर्गनिज्म, इत्यादिलाई समेट्ने सयौं प्रजातिहरूमा 2000 भन्दा बढी बन्द SLAF-Seq परियोजनाहरू।

आत्म-विकसित जैव सूचनात्मक कार्यप्रवाह- अन्तिम आउटपुटको विश्वसनीयता र शुद्धता सुनिश्चित गर्न BMKGENE द्वारा SLAF-Seq को लागि एक एकीकृत जैव सूचनात्मक कार्यप्रवाह विकसित गरिएको थियो।

 

सेवा विशिष्टताहरू

 

प्लेटफर्म

Conc.(ng/gl)

कुल (ug)

OD260/280

Illumina NovaSeq

>३5

>१.६(भोलम> 15μl)

१.६-२.५

नोट: तीनवटा नमूनाहरू, प्रत्येक तीन इन्जाइम योजनाहरूसँग, पूर्व-प्रयोगको लागि प्रदर्शन गरिनेछ।

सिफारिस गरिएको अनुक्रम रणनीति

अनुक्रम गहिराई: 10X/ट्याग

जीनोम आकार

SLAF Tags सिफारिस गर्नुभयो

< 500 Mb

100K वा WGS

500 Mb- 1 Gb

१०० के

1 Gb - 2 Gb

२०० K

विशाल वा जटिल जीनोमहरू

300 - 400K

 

अनुप्रयोगहरू

 

सिफारिस गर्नुभयो

जनसंख्या स्केल

 

अनुक्रम रणनीति र गहिराई

 

गहिराई

 

ट्याग नम्बर

 

GWAS

 

नमूना नम्बर ≥ २००

 

10X

 

 

 

 

 

यस अनुसार

जीनोम आकार

 

आनुवंशिक विकास

 

प्रत्येकका व्यक्तिहरू

उपसमूह ≥ १०;

कुल नमूनाहरू ≥ 30

 

10X

 

सिफारिस गरिएको नमूना वितरण

कन्टेनर: 2 एमएल सेन्ट्रीफ्यूज ट्यूब

धेरैजसो नमूनाहरूको लागि, हामी इथानोलमा सुरक्षित नगर्न सिफारिस गर्छौं।

नमूना लेबलिङ: नमूनाहरू स्पष्ट रूपमा लेबल गरिएको र नमूना जानकारी फारम पेश गर्न समान हुनुपर्छ।

ढुवानी: ड्राई-बरफ: नमूनाहरू पहिले झोलामा प्याक गर्न आवश्यक छ र ड्राई-बरफमा गाडिनु पर्छ।

सेवा कार्यप्रवाह

नमूना QC
पायलट प्रयोग
SLAF प्रयोग
पुस्तकालय तयारी
अनुक्रम
डाटा विश्लेषण
बिक्री पछि सेवाहरू

नमूना QC

पायलट प्रयोग

SLAF-प्रयोग

पुस्तकालय तयारी

अनुक्रम

डाटा विश्लेषण

बिक्री पछि सेवाहरू


  • अघिल्लो:
  • अर्को:

  • 1. नक्सा परिणाम को तथ्याङ्क

    छवि १

    A1

    2. SLAF मार्कर विकास

    A2

    3. भिन्नता एनोटेशन

    A3

    वर्ष

    जर्नल

    IF

    शीर्षक

    अनुप्रयोगहरू

    २०२२

    प्रकृति संचार

    १७.६९४

    गिगा-क्रोमोजोम र ट्री पेनीको गिगा-जीनोमको जीनोमिक आधार

    Paeonia ostii

    SLAF-GWAS

    २०१५

    नयाँ फिटोलोजिस्ट

    ७.४३३

    घरेलु पदचिह्नले कृषि सम्बन्धी महत्वका जीनोमिक क्षेत्रहरूलाई लंगर दिन्छ

    सोयाबीन

    SLAF-GWAS

    २०२२

    उन्नत अनुसन्धान को जर्नल

    १२.८२२

    G. hirsutum मा Gossypium barbadense को जीनोम-वाइड कृत्रिम घुसपैठ

    कपास फाइबर गुणस्तर र उपज को एक साथ सुधार को लागी उच्च लोकी प्रकट गर्नुहोस्

    विशेषताहरू

    SLAF - विकासवादी आनुवंशिकी

    २०१९

    आणविक बिरुवा

    १०.८१

    जनसंख्या जीनोमिक विश्लेषण र डे नोवो सभाले वीडीको उत्पत्ति प्रकट गर्दछ

    एक विकासवादी खेल को रूप मा चावल

    SLAF - विकासवादी आनुवंशिकी

    २०१९

    प्रकृति जेनेटिक्स

    ३१.६१६

    सामान्य कार्पको जीनोम अनुक्रम र आनुवंशिक विविधता, साइप्रिनस कार्पियो

    SLAF-लिङ्केज नक्शा

    २०१४

    प्रकृति जेनेटिक्स

    २५.४५५

    खेती गरिएको मूंगफलीको जीनोमले लेग्युम क्यारियोटाइप, पोलीप्लोइडमा अन्तरदृष्टि प्रदान गर्दछ

    विकास र बाली घरेलुपन।

    SLAF-लिङ्केज नक्शा

    २०२२

    प्लान्ट बायोटेक्नोलोजी जर्नल

    ९.८०३

    ST1 को पहिचानले बीउ मोर्फोलोजीको हिचहाइकिंग समावेश चयनलाई प्रकट गर्दछ

    र सोयाबीन घरपालुवा समयमा तेल सामग्री

    SLAF-मार्कर विकास

    २०२२

    आणविक विज्ञान को अन्तर्राष्ट्रिय जर्नल

    ६.२०८

    गहुँ-लेमस मोलिस 2Ns (2D) को लागि पहिचान र DNA मार्कर विकास

    डिसोमिक क्रोमोजोम प्रतिस्थापन

    SLAF-मार्कर विकास

    एक उद्धरण प्राप्त

    यहाँ आफ्नो सन्देश लेख्नुहोस् र हामीलाई पठाउनुहोस्

    हामीलाई आफ्नो सन्देश पठाउनुहोस्: