उच्च मार्कर खोज दक्षता- उच्च-थ्रुपुट अनुक्रमण प्रविधिले SLAF-Seq लाई सम्पूर्ण जीनोम भित्र सयौं हजारौं ट्यागहरू पत्ता लगाउन मद्दत गर्दछ।
जीनोममा कम निर्भरता- यो एक सन्दर्भ जीनोम संग वा बिना प्रजाति मा लागू गर्न सकिन्छ।
लचिलो योजना डिजाइन- एकल-इन्जाइम, डुअल-इन्जाइम, बहु-इन्जाइम पाचन र विभिन्न प्रकारका इन्जाइमहरू, सबै फरक अनुसन्धान लक्ष्य वा प्रजातिहरू पूरा गर्न चयन गर्न सकिन्छ।सिलिकोमा पूर्व-मूल्याङ्कन इष्टतम इन्जाइम डिजाइन सुनिश्चित गर्न प्रयोग गरिन्छ।
कुशल इन्जाइमेटिक पाचन- पूर्व-प्रयोग सर्तहरूलाई अनुकूलन गर्नको लागि गरिएको थियो, जसले औपचारिक प्रयोगलाई स्थिर र भरपर्दो बनाउँछ।टुक्रा संग्रह दक्षता 95% भन्दा बढी हासिल गर्न सक्छ।
समान रूपमा वितरित SLAF ट्यागहरू- SLAF ट्यागहरू सबै क्रोमोजोमहरूमा समान रूपमा वितरित हुन्छन्, औसत 1 SLAF प्रति 4 kb प्राप्त गर्दै।
दोहोरिने प्रभावकारी बेवास्ता- SLAF-Seq डेटामा दोहोरिने क्रम 5% भन्दा कममा घटाइएको छ, विशेष गरी उच्च स्तरको दोहोर्याउने प्रजातिहरूमा, जस्तै गहुँ, मकै, आदि।
व्यापक अनुभव- बिरुवा, स्तनपायी, चराचुरुङ्गी, कीरा, एक्वा-अर्गनिज्म, इत्यादिलाई समेट्ने सयौं प्रजातिहरूमा 2000 भन्दा बढी बन्द SLAF-Seq परियोजनाहरू।
आत्म-विकसित जैव सूचनात्मक कार्यप्रवाह- अन्तिम आउटपुटको विश्वसनीयता र शुद्धता सुनिश्चित गर्न BMKGENE द्वारा SLAF-Seq को लागि एक एकीकृत जैव सूचनात्मक कार्यप्रवाह विकसित गरिएको थियो।
प्लेटफर्म | Conc.(ng/gl) | कुल (ug) | OD260/280 |
Illumina NovaSeq | >३5 | >१.६(भोलम> 15μl) | १.६-२.५ |
अनुक्रम गहिराई: 10X/ट्याग
जीनोम आकार | SLAF Tags सिफारिस गर्नुभयो |
< 500 Mb | 100K वा WGS |
500 Mb- 1 Gb | १०० के |
1 Gb - 2 Gb | २०० K |
विशाल वा जटिल जीनोमहरू | 300 - 400K |
अनुप्रयोगहरू
| सिफारिस गर्नुभयो जनसंख्या स्केल
| अनुक्रम रणनीति र गहिराई
| |
गहिराई
| ट्याग नम्बर
| ||
GWAS
| नमूना नम्बर ≥ २००
| 10X
|
यस अनुसार जीनोम आकार
|
आनुवंशिक विकास
| प्रत्येकका व्यक्तिहरू उपसमूह ≥ १०; कुल नमूनाहरू ≥ 30
| 10X
|
कन्टेनर: 2 एमएल सेन्ट्रीफ्यूज ट्यूब
धेरैजसो नमूनाहरूको लागि, हामी इथानोलमा सुरक्षित नगर्न सिफारिस गर्छौं।
नमूना लेबलिङ: नमूनाहरू स्पष्ट रूपमा लेबल गरिएको र नमूना जानकारी फारम पेश गर्न समान हुनुपर्छ।
ढुवानी: ड्राई-बरफ: नमूनाहरू पहिले झोलामा प्याक गर्न आवश्यक छ र ड्राई-बरफमा गाडिनु पर्छ।
1. नक्सा परिणाम को तथ्याङ्क
2. SLAF मार्कर विकास
3. भिन्नता एनोटेशन
वर्ष | जर्नल | IF | शीर्षक | अनुप्रयोगहरू |
२०२२ | प्रकृति संचार | १७.६९४ | गिगा-क्रोमोजोम र ट्री पेनीको गिगा-जीनोमको जीनोमिक आधार Paeonia ostii | SLAF-GWAS |
२०१५ | नयाँ फिटोलोजिस्ट | ७.४३३ | घरेलु पदचिह्नले कृषि सम्बन्धी महत्वका जीनोमिक क्षेत्रहरूलाई लंगर दिन्छ सोयाबीन | SLAF-GWAS |
२०२२ | उन्नत अनुसन्धान को जर्नल | १२.८२२ | G. hirsutum मा Gossypium barbadense को जीनोम-वाइड कृत्रिम घुसपैठ कपास फाइबर गुणस्तर र उपज को एक साथ सुधार को लागी उच्च लोकी प्रकट गर्नुहोस् विशेषताहरू | SLAF - विकासवादी आनुवंशिकी |
२०१९ | आणविक बिरुवा | १०.८१ | जनसंख्या जीनोमिक विश्लेषण र डे नोवो सभाले वीडीको उत्पत्ति प्रकट गर्दछ एक विकासवादी खेल को रूप मा चावल | SLAF - विकासवादी आनुवंशिकी |
२०१९ | प्रकृति जेनेटिक्स | ३१.६१६ | सामान्य कार्पको जीनोम अनुक्रम र आनुवंशिक विविधता, साइप्रिनस कार्पियो | SLAF-लिङ्केज नक्शा |
२०१४ | प्रकृति जेनेटिक्स | २५.४५५ | खेती गरिएको मूंगफलीको जीनोमले लेग्युम क्यारियोटाइप, पोलीप्लोइडमा अन्तरदृष्टि प्रदान गर्दछ विकास र बाली घरेलुपन। | SLAF-लिङ्केज नक्शा |
२०२२ | प्लान्ट बायोटेक्नोलोजी जर्नल | ९.८०३ | ST1 को पहिचानले बीउ मोर्फोलोजीको हिचहाइकिंग समावेश चयनलाई प्रकट गर्दछ र सोयाबीन घरपालुवा समयमा तेल सामग्री | SLAF-मार्कर विकास |
२०२२ | आणविक विज्ञान को अन्तर्राष्ट्रिय जर्नल | ६.२०८ | गहुँ-लेमस मोलिस 2Ns (2D) को लागि पहिचान र DNA मार्कर विकास डिसोमिक क्रोमोजोम प्रतिस्थापन | SLAF-मार्कर विकास |