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条形 ब्यानर-03

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प्रोकारियोटिक आरएनए अनुक्रमण

प्रोकारियोटिक आरएनए अनुक्रमणले परिवर्तनशील सेलुलर ट्रान्सक्रिप्टोमको विश्लेषण गरेर, कुनै निश्चित क्षणमा आरएनएको उपस्थिति र मात्रा प्रकट गर्न नेक्स्ट जेनरेशन सिक्वेन्सिङ (एनजीएस) प्रयोग गर्दछ।हाम्रो कम्पनीको प्रोकारियोटिक आरएनए अनुक्रमणिका, विशेष गरी सन्दर्भ जीनोमहरू सहित प्रोकारियोटहरूमा लक्ष्य राख्छ, तपाईंलाई ट्रान्सक्रिप्टोम प्रोफाइलिङ, जीन संरचना विश्लेषण, इत्यादि प्रदान गर्दछ। यसलाई आधारभूत विज्ञान अनुसन्धान, औषधि अनुसन्धान र विकास, र थपमा व्यापक रूपमा लागू गरिएको छ।

प्लेटफर्म: Illumina NovaSeq प्लेटफर्म


सेवा विवरण

सेवा विशिष्टताहरू

प्लेटफर्म: Illumina NovaSeq प्लेटफर्म, PE150

पुस्तकालय प्रकार: 350bp सम्मिलित cDNA पुस्तकालय (चरम वितरण मा निर्भर गर्दछ)

अनुक्रम रणनीति: जोडी-अन्त 150 bp

डेटा रकम सिफारिस गर्नुहोस्: 2 Gb कच्चा डाटा/नमूना

बायोइन्फर्मेटिक्स

(1) अनुक्रमण डेटा गुणस्तर नियन्त्रण: न्यूक्लियोटाइड वितरण, आधार गुणस्तर वितरण, rRNA अनुपात मूल्याङ्कन;

(2) अनुक्रम पङ्क्तिबद्ध विश्लेषण: पङ्क्तिबद्ध परिणाम तथ्याङ्क, अनुक्रम को संतृप्ति, अनुक्रम को कवरेज;

(3) सन्दर्भ जीनोम एनोटेसन (NR, Swiss-Prot, Pfam, COG, GO, KEGG);

(4) अभिव्यक्ति विश्लेषण: अभिव्यक्ति वितरण (दुई वा बढी नमूनाहरूसँग), नमूनाहरू बीच अभिव्यक्तिको विश्लेषण (भेन विश्लेषण, सहसंबंध विश्लेषण, PCA विश्लेषण);

(5) भिन्न अभिव्यक्ति विश्लेषण (दुई वा बढी नमूनाहरूको साथ);

(6) जीन सेट विश्लेषण: भेन विश्लेषण, क्लस्टर विश्लेषण, प्रकार्य एनोटेशन विश्लेषण (COG, GO, KEGG), प्रकार्य संवर्धन विश्लेषण (GO, KEGG), प्रकार्य संवर्धन कोरडल ग्राफ, Ipath विश्लेषण;

(7) sRNA विश्लेषण: sRNA भविष्यवाणी, sRNA एनोटेशन (ब्लास्ट, sRNAMap, sRNATarBase, SIPHT, Rfam), sRNA माध्यमिक संरचना भविष्यवाणी, sRNA लक्ष्य जीन भविष्यवाणी;

(8) ट्रान्सक्रिप्ट संरचना विश्लेषण: Operon विश्लेषण, ट्रान्सक्रिप्शन सुरु र अन्त्य साइट भविष्यवाणी, UTR एनोटेसन र विश्लेषण, प्रमोटर अनुक्रम भविष्यवाणी, SNP/InDel विश्लेषण (SNP/InDel एनोटेशन, SNP/InDel क्षेत्रीय वितरण, SNP तथ्याङ्क)।

सेवा कार्य प्रवाह

नमूना वितरण

नमूना वितरण

पुस्तकालय तयारी

पुस्तकालय निर्माण

अनुक्रम

अनुक्रम

डाटा विश्लेषण

डाटा विश्लेषण

बिक्री पछि सेवाहरू

बिक्री पछि सेवाहरू


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