-
एकल न्यूक्लियस आरएनए अनुक्रमण
एकल सेल क्याप्चरिङ र व्यक्तिगत पुस्तकालय निर्माण प्रविधिमा अग्रिम उच्च-थ्रुपुट अनुक्रमको साथ संयोजनले सेल-द्वारा-सेल आधारमा जीन अभिव्यक्ति अध्ययन गर्न अनुमति दिन्छ।यसले जटिल सेल आबादीहरूमा गहिरो र पूर्ण प्रणाली विश्लेषणलाई सक्षम बनाउँछ, जसमा यसले सबै कक्षहरूको औसत लिएर तिनीहरूको विषमताको मास्किङलाई ठूलो मात्रामा बेवास्ता गर्छ।
यद्यपि, केही कोशिकाहरू एकल-कोशिका निलम्बनमा बनाउन उपयुक्त छैनन्, त्यसैले अन्य नमूना तयारी विधिहरू - तन्तुहरूबाट न्यूक्लियस निकासी आवश्यक छ, त्यो हो, न्यूक्लियसलाई तन्तु वा कोशिकाबाट सीधै निकालिन्छ र एकल-न्युक्लियस निलम्बनमा तयार गरिन्छ। सेल अनुक्रम।
BMK ले 10× Genomics ChromiumTM आधारित एकल-सेल RNA अनुक्रमण सेवा प्रदान गर्दछ।यो सेवा रोगसँग सम्बन्धित अध्ययनहरूमा व्यापक रूपमा प्रयोग गरिएको छ, जस्तै प्रतिरक्षा कोशिका भिन्नता, ट्युमर विषमता, ऊतक विकास, आदि।
स्पेसियल ट्रान्सक्रिप्टोम चिप: १० × जीनोमिक्स
प्लेटफर्म: Illumina NovaSeq प्लेटफर्म
-
बिरुवा / पशु सम्पूर्ण जीनोम अनुक्रमण
सम्पूर्ण जीनोम पुन: अनुक्रमण, WGS को रूपमा पनि चिनिन्छ, सिंगल न्यूक्लियोटाइड पोलिमोर्फिज्म (SNP), इन्सर्सन डिलिसन (InDel), संरचना भिन्नता (SV), र प्रतिलिपि संख्या भिन्नता (CNV) सहित सम्पूर्ण जीनोममा दुबै सामान्य र दुर्लभ उत्परिवर्तनहरू प्रकट गर्न सक्षम गर्दछ। )।SVs ले SNPs भन्दा भिन्नता आधारको ठूलो भाग बनाउँछ र जीनोममा ठूलो प्रभाव पार्छ, जसले जीवित जीवहरूमा महत्त्वपूर्ण प्रभाव पार्छ।लामो-पढ्ने रिस्वेन्सिङले ठूला टुक्राहरू र जटिल भिन्नताहरूको थप सटीक पहिचानको लागि अनुमति दिन्छ किनभने लामो पढाइले टेन्डम दोहोरिने, GC/AT- धनी क्षेत्रहरू, र हाइपर-चर क्षेत्रहरू जस्ता जटिल क्षेत्रहरूमा क्रोमोसोमल क्रसिङ गर्न धेरै सजिलो बनाउँछ।
प्लेटफर्म: Illumina, PacBio, Nanopore
-
BMKMANU S1000 स्थानिय ट्रान्सक्रिप्टोम
स्पेसियल ट्रान्सक्रिप्टोमिक्स वैज्ञानिक नवाचारको अग्रपंक्तिमा उभिएको छ, अनुसन्धानकर्ताहरूलाई तिनीहरूको स्थानिय सन्दर्भको संरक्षण गर्दै टिस्युहरू भित्रको जटिल जीन अभिव्यक्ति ढाँचाहरूमा अन्वेषण गर्न सशक्त बनाउँछ।विभिन्न प्लेटफर्महरूका बीचमा, BMKGene ले BMKManu S1000 Spatial ट्रान्सक्रिप्टोम चिप विकास गरेको छ।परिष्कृत संकल्प5µM को, सबसेलुलर दायरामा पुग्दै, र सक्षम गर्दैबहु-स्तरीय संकल्प सेटिङहरू।S1000 चिप, लगभग 2 मिलियन स्पटहरू फिचर गर्दै, स्प्याटली बारकोड गरिएको क्याप्चर प्रोबहरूले भरिएको मोतीले तहमा राखिएको माइक्रोवेलहरू प्रयोग गर्दछ।एक cDNA पुस्तकालय, स्थानिय बारकोडहरु संग समृद्ध, S1000 चिप बाट तयार छ र पछि Illumina NovaSeq प्लेटफर्म मा क्रमबद्ध छ।स्थानिय बारकोड गरिएका नमूनाहरू र UMIs को संयोजनले उत्पन्न डाटाको शुद्धता र विशिष्टता सुनिश्चित गर्दछ।BMKManu S1000 चिपको अद्वितीय विशेषता यसको बहुमुखी प्रतिभामा निहित छ, यसले बहु-स्तरीय रिजोल्युसन सेटिङहरू प्रदान गर्दछ जुन विभिन्न तन्तुहरू र विवरणहरूको स्तरहरूमा राम्रोसँग ट्युन गर्न सकिन्छ।यो अनुकूलनताले चिपलाई विभिन्न स्थानिय ट्रान्सक्रिप्टोमिक्स अध्ययनहरूको लागि उत्कृष्ट विकल्पको रूपमा राख्छ, न्यूनतम आवाजको साथ सटीक स्थानिय क्लस्टरिङ सुनिश्चित गर्दै।
BMKManu S1000 चिप र अन्य स्थानिय ट्रान्सक्रिप्टोमिक्स टेक्नोलोजीहरू प्रयोग गरेर, अनुसन्धानकर्ताहरूले कोशिकाहरूको स्थानिय संगठन र तन्तुहरू भित्र हुने जटिल आणविक अन्तरक्रियाहरूको राम्रोसँग बुझ्न सक्छन्, क्षेत्रहरूको विस्तृत दायरामा जैविक प्रक्रियाहरू अन्तर्निहित संयन्त्रहरूमा अमूल्य अन्तर्दृष्टि प्रदान गर्दछ। ओन्कोलोजी, न्यूरोसाइन्स, विकास जीवविज्ञान, इम्युनोलोजी र वनस्पति अध्ययन।
प्लेटफर्म: BMKManu S1000 चिप र Illumina NovaSeq
-
10x जेनोमिक्स भिजियम स्पेसियल ट्रान्सक्रिप्टोम
स्पेसियल ट्रान्सक्रिप्टोमिक्स एक अत्याधुनिक प्रविधि हो जसले अनुसन्धानकर्ताहरूलाई तिनीहरूको स्थानिय सन्दर्भलाई सुरक्षित राख्दै टिस्युहरू भित्र जीन अभिव्यक्ति ढाँचाहरू अनुसन्धान गर्न अनुमति दिन्छ।यस डोमेनको एउटा शक्तिशाली प्लेटफर्म 10x जेनोमिक्स भिजियम हो जसमा इलुमिना सिक्वेन्सिङ छ।10X भिजियम को सिद्धान्त एक निर्दिष्ट क्याप्चर क्षेत्र संग एक विशेष चिप मा छ जहाँ टिश्यु खण्डहरू राखिएको छ।यो क्याप्चर क्षेत्रले बारकोड गरिएको स्पटहरू समावेश गर्दछ, प्रत्येक ऊतक भित्रको एक अद्वितीय स्थानिय स्थानसँग सम्बन्धित छ।टिस्युबाट कब्जा गरिएका आरएनए अणुहरूलाई रिभर्स ट्रान्सक्रिप्शन प्रक्रियाको क्रममा अद्वितीय आणविक पहिचानकर्ता (UMIs) ले लेबल लगाइन्छ।यी बारकोड गरिएका स्पटहरू र UMIs ले एकल-सेल रिजोल्युसनमा जीन अभिव्यक्तिको सटीक स्थानिक म्यापिङ र परिमाणीकरण सक्षम पार्छ।स्थानिय बारकोड गरिएका नमूनाहरू र UMIs को संयोजनले उत्पन्न डाटाको शुद्धता र विशिष्टता सुनिश्चित गर्दछ।यस स्थानिय ट्रान्सक्रिप्टोमिक्स टेक्नोलोजी प्रयोग गरेर, अन्वेषकहरूले कोशिकाहरूको स्थानिक संगठन र ऊतक भित्र हुने जटिल आणविक अन्तरक्रियाहरूको गहिरो बुझाइ प्राप्त गर्न सक्छन्, ओन्कोलोजी, न्यूरोसाइन्स, विकास जीवविज्ञान, इम्युनोलोजी सहित बहु क्षेत्रहरूमा जैविक प्रक्रियाहरू अन्तर्निहित संयन्त्रहरूमा अमूल्य अन्तर्दृष्टि प्रदान गर्दै। , र वनस्पति अध्ययन।
प्लेटफर्म: 10X जेनोमिक्स भिजियम र Illumina NovaSeq
-
पूर्ण-लम्बाइ mRNA अनुक्रमण-नानोपोर
जबकि NGS-आधारित mRNA अनुक्रमले जीन अभिव्यक्ति परिमाणीकरणको लागि बहुमुखी उपकरणको रूपमा कार्य गर्दछ, छोटो पढाइमा यसको निर्भरताले जटिल ट्रान्सक्रिप्टोमिक विश्लेषणहरूमा यसको प्रभावकारितालाई सीमित गर्दछ।अर्कोतर्फ, नानोपोर अनुक्रमणिकाले लामो-पढ्ने प्रविधि प्रयोग गर्दछ, पूर्ण-लम्बाइ mRNA ट्रान्सक्रिप्टहरूको अनुक्रम सक्षम पार्दै।यो दृष्टिकोणले वैकल्पिक स्प्लिसिङ, जीन फ्युजन, पोली-एडेनिलेसन, र mRNA आइसोफर्महरूको परिमाणीकरणको विस्तृत अन्वेषणको सुविधा दिन्छ।
नानोपोर अनुक्रम nanopore एकल-अणु वास्तविक-समय विद्युतीय संकेतहरूमा निर्भर गर्दछ।मोटर प्रोटिनहरूद्वारा निर्देशित, डबल-स्ट्र्यान्ड डीएनए बायोफिल्ममा इम्बेड गरिएको नानोपोर प्रोटिनहरूसँग बाँध्छ, यो भोल्टेज भिन्नता अन्तर्गत नानोपोर च्यानलबाट गुज्र्दा अनवाइन्ड हुन्छ।DNA स्ट्र्यान्डमा विभिन्न आधारहरू द्वारा उत्पन्न विशिष्ट विद्युतीय संकेतहरू वास्तविक समयमा पत्ता लगाइन्छ र वर्गीकृत गरिन्छ, सही र निरन्तर न्यूक्लियोटाइड अनुक्रमणको सुविधा दिन्छ।यो अभिनव दृष्टिकोणले छोटो-पढ्ने सीमितताहरू पार गर्दछ र जटिल जीनोमिक विश्लेषणको लागि गतिशील प्लेटफर्म प्रदान गर्दछ, जटिल ट्रान्सक्रिप्टोमिक अध्ययनहरू समावेश गर्दछ।
प्लेटफर्म: Nanopore Promethion P48
-
पूर्ण-लम्बाइ mRNA अनुक्रमण - PacBio
जबकि NGS-आधारित mRNA अनुक्रमण जीन अभिव्यक्ति मापन गर्न को लागी एक बहुमुखी उपकरण हो, छोटो पठन मा यसको निर्भरता जटिल ट्रान्सक्रिप्टोमिक विश्लेषण मा यसको प्रयोग प्रतिबन्धित गर्दछ।PacBio अनुक्रमणिका (Iso-Seq), अर्कोतर्फ, लामो-पढ्ने प्रविधि प्रयोग गर्दछ, पूर्ण-लम्बाइ mRNA ट्रान्सक्रिप्टहरूको अनुक्रम सक्षम पार्दै।यो दृष्टिकोणले वैकल्पिक स्प्लिसिङ, जीन फ्युजन र पोली-एडेनिलेसनको विस्तृत अन्वेषणलाई सहज बनाउँछ, यद्यपि यो जीन अभिव्यक्ति परिमाणीकरणको लागि प्राथमिक विकल्प होइन, डाटाको उच्च मात्राको कारणले गर्दा।
PacBio सिक्वेन्सिङ टेक्नोलोजी सिंगल-मोलिक्युल, रियल-टाइम (SMRT) सिक्वेन्सिङमा निर्भर छ, जसले पूर्ण-लम्बाइ mRNA ट्रान्सक्रिप्टहरू क्याप्चर गर्नमा छुट्टै फाइदा प्रदान गर्दछ।यो अभिनव दृष्टिकोणमा शून्य-मोड वेभगाइडहरू (ZMWs), माइक्रोफ्याब्रिकेटेड कुवाहरूको प्रयोग समावेश छ जसले अनुक्रमणको क्रममा DNA पोलिमरेज गतिविधिको वास्तविक-समय अवलोकन सक्षम गर्दछ।यी ZMWs भित्र, PacBio को DNA पोलिमरेजले DNA को एक पूरक स्ट्र्यान्ड संश्लेषण गर्दछ, लामो पढाइहरू उत्पन्न गर्दछ जुन सम्पूर्ण mRNA ट्रान्सक्रिप्टहरू फैलिन्छ।सर्कुलर कन्सेन्सस सिक्वेन्सिङ (CCS) मोडमा PacBio सञ्चालनले एउटै अणुलाई बारम्बार क्रमबद्ध गरेर शुद्धता बढाउँछ।उत्पन्न गरिएको HiFi रीडहरूमा NGS सँग तुलनात्मक सटीकता छ, थप जटिल ट्रान्सक्रिप्टोमिक सुविधाहरूको विस्तृत र भरपर्दो विश्लेषणमा योगदान पुर्याउँछ।प्लेटफर्म: PacBio सिक्वेल II
-
Eukaryotic mRNA अनुक्रमण-Illumina
mRNA अनुक्रमणले विशेष परिस्थितिहरूमा कक्षहरू भित्र सबै mRNA ट्रान्सक्रिप्टहरूको व्यापक प्रोफाइलिङलाई सशक्त बनाउँछ।यो अत्याधुनिक प्रविधिले एक शक्तिशाली उपकरणको रूपमा कार्य गर्दछ, जटिल जीन अभिव्यक्ति प्रोफाइलहरू, जीन संरचनाहरू, र विविध जैविक प्रक्रियाहरूसँग सम्बन्धित आणविक संयन्त्रहरू अनावरण गर्दछ।मौलिक अनुसन्धान, क्लिनिकल डायग्नोस्टिक्स, र औषधि विकासमा व्यापक रूपमा अपनाईएको, mRNA अनुक्रमले सेलुलर गतिशीलता र आनुवंशिक नियमनका जटिलताहरूमा अन्तर्दृष्टि प्रदान गर्दछ।
प्लेटफर्म: Illumina NovaSeq X
-
गैर-सन्दर्भ आधारित mRNA अनुक्रमण-Illumina
mRNA अनुक्रमणले विशेष परिस्थितिहरूमा कक्षहरू भित्र सबै mRNA ट्रान्सक्रिप्टहरूको व्यापक प्रोफाइलिङलाई सशक्त बनाउँछ।यो अत्याधुनिक प्रविधिले एक शक्तिशाली उपकरणको रूपमा कार्य गर्दछ, जटिल जीन अभिव्यक्ति प्रोफाइलहरू, जीन संरचनाहरू, र विविध जैविक प्रक्रियाहरूसँग सम्बन्धित आणविक संयन्त्रहरू अनावरण गर्दछ।मौलिक अनुसन्धान, क्लिनिकल डायग्नोस्टिक्स, र औषधि विकासमा व्यापक रूपमा अपनाईएको, mRNA अनुक्रमले सेलुलर गतिशीलता र आनुवंशिक नियमनका जटिलताहरूमा अन्तर्दृष्टि प्रदान गर्दछ।
प्लेटफर्म: Illumina NovaSeq X
-
लामो गैर-कोडिङ अनुक्रम-Illumina
लामो गैर-कोडिङ RNAs (lncRNAs) 200 nucleotides भन्दा लामो RNA हरू हुन् जसमा न्यूनतम कोडिङ क्षमता हुन्छ र गैर-कोडिङ RNA भित्र मुख्य तत्वहरू हुन्छन्।न्यूक्लियस र साइटोप्लाज्ममा पाइने, यी आरएनएहरूले एपिजेनेटिक, ट्रान्सक्रिप्शनल, र पोस्ट-ट्रान्सक्रिप्शनल नियमनमा महत्त्वपूर्ण भूमिका खेल्छन्, जसले सेलुलर र आणविक प्रक्रियाहरूलाई आकार दिन तिनीहरूको महत्त्वलाई जोड दिन्छ।LncRNA अनुक्रमणिका सेल भिन्नता, ओन्टोजेनेसिस, र मानव रोगहरूमा एक शक्तिशाली उपकरण हो।
प्लेटफर्म: Illumina NovaSeq
-
सानो आरएनए अनुक्रमण - Illumina
साना RNA (sRNA) अणुहरू, सामान्यतया 200 न्यूक्लियोटाइड लम्बाइमा, माइक्रोआरएनए (miRNAs), सानो हस्तक्षेप गर्ने RNAs (siRNAs), र piwi-interacting RNAs (piRNAs) समावेश गर्दछ।यी मध्ये, miRNAs, लगभग 20-24 न्यूक्लियोटाइड लामो, विभिन्न सेलुलर प्रक्रियाहरूमा तिनीहरूको निर्णायक नियामक भूमिकाहरूको लागि विशेष रूपमा उल्लेखनीय छन्।टिश्यु-विशिष्ट र चरण-विशिष्ट अभिव्यक्ति ढाँचाहरूको साथ, miRNAs ले विभिन्न प्रजातिहरूमा उच्च संरक्षण प्रदर्शन गर्दछ।
प्लेटफर्म: Illumina NovaSeq
-
circRNA अनुक्रमण-Illumina
सर्कुलर आरएनए सिक्वेन्सिङ (circRNA-seq) भनेको गोलाकार RNAs प्रोफाइल र विश्लेषण गर्नु हो, RNA अणुहरूको एक वर्ग जसले गैर-क्यानोनिकल स्प्लिसिङ घटनाहरूको कारण बन्द लूपहरू बनाउँछ, यी RNA लाई बढ्दो स्थिरता प्रदान गर्दछ।जबकि केहि circRNAs लाई microRNA स्पन्जको रूपमा काम गर्न देखाइएको छ, microRNAs पृथक गर्दै र तिनीहरूलाई उनीहरूको लक्षित mRNA हरू विनियमित गर्नबाट रोक्छ, अन्य circRNA ले प्रोटीनसँग अन्तरक्रिया गर्न सक्छ, जीन अभिव्यक्ति परिमार्जन गर्न सक्छ, वा सेलुलर प्रक्रियाहरूमा भूमिका खेल्न सक्छ।circRNA अभिव्यक्ति विश्लेषणले यी अणुहरूको नियामक भूमिकाहरू र विभिन्न सेलुलर प्रक्रियाहरू, विकास चरणहरू, र रोग अवस्थाहरूमा तिनीहरूको महत्त्वमा अन्तर्दृष्टि प्रदान गर्दछ, जीन अभिव्यक्तिको सन्दर्भमा RNA नियमनको जटिलताको गहिरो समझमा योगदान पुर्याउँछ।
-
सम्पूर्ण ट्रान्सक्रिप्टोम अनुक्रम - इलुमिना
सम्पूर्ण ट्रान्सक्रिप्टोम सिक्वेन्सिङले कोडिङ (mRNA) र गैर-कोडिङ RNAs (lncRNA, circRNA, र miRNA) दुवैलाई समेटेर, विविध RNA अणुहरू प्रोफाइल गर्नको लागि व्यापक दृष्टिकोण प्रदान गर्दछ।सेलुलर प्रक्रियाहरूको समग्र समझको लागि अनुमति दिँदै, यो प्रविधिले दिइएको क्षणमा विशिष्ट कक्षहरूको पूर्ण ट्रान्सक्रिप्टोम कब्जा गर्छ।"कुल आरएनए अनुक्रमण" को रूपमा पनि चिनिन्छ, यसले ट्रान्सक्रिप्टोम स्तरमा जटिल नियामक सञ्जालहरू अनावरण गर्ने लक्ष्य राख्छ, प्रतिस्पर्धात्मक अन्तर्जात आरएनए (ceRNA) र संयुक्त आरएनए विश्लेषण जस्ता गहन विश्लेषणलाई सक्षम पार्दै।यसले विशेष गरी circRNA-miRNA-mRNA-आधारित ceRNA अन्तर्क्रियाहरू समावेश गर्ने नियामक सञ्जालहरू उजागर गर्न कार्यात्मक चरित्रीकरणतर्फ प्रारम्भिक चरण चिन्ह लगाउँछ।
