हीटम्याप
म्याट्रिक्स डेटा फाइल ताप नक्सा रेखाचित्रको लागि प्रयोग गरिन्छ, जसले म्याट्रिक्स डेटा फिल्टर, सामान्य र क्लस्टर गर्न सक्छ।यो प्रायः विभिन्न नमूनाहरू बीच जीन अभिव्यक्ति स्तरको क्लस्टर विश्लेषणको लागि प्रयोग गरिन्छ।
जीन एनोटेसन
जीन प्रकार्य एनोटेशन विभिन्न डाटाबेस विरुद्ध FASTA फाइलमा म्यापिङ अनुक्रम द्वारा प्रदर्शन गरिन्छ।
जीन एनोटेसन
आधारभूत स्थानीय पङ्क्तिबद्ध खोज उपकरण
CDS_UTR_पूर्वानुमान
यो उपकरण ज्ञात प्रोटीन डाटाबेस र ORF भविष्यवाणी विरुद्ध ब्लास्टिङको आधारमा दिइएको ट्रान्सक्रिप्ट अनुक्रमहरूमा कोडिङ क्षेत्रहरू (CDS) र गैर-कोडिङ क्षेत्रहरू (UTR) भविष्यवाणी गर्न डिजाइन गरिएको हो।
म्यानहट्टन प्लट
म्यानहट्टन प्लटले डेटा बिन्दुहरूको ठूलो संख्याको साथ डेटाको प्रदर्शन सक्षम गर्दछ।यो सामान्यतया जीनोम-वाइड एसोसिएशन अध्ययन (GWAS) मा प्रयोग गरिन्छ।
सर्कोस
CIRCOS रेखाचित्रले जीनोममा SNP, InDeL, SV, CNV वितरणको प्रत्यक्ष प्रस्तुति सक्षम गर्दछ।
GO_Enrichment
TopGO कार्यात्मक संवर्धनको लागि डिजाइन गरिएको उपकरण हो।TopGO-Bioconductor प्याकेजले भिन्न अभिव्यक्ति विश्लेषण, GO संवर्धन विश्लेषण र परिणामहरूको दृश्य समावेश गर्दछ।यसले "ग्राफ" नामक आउटपुटको साथ फोल्डर उत्पन्न गर्नेछ, जसमा topGO_BP, topGO_CC र topGO_MF का परिणामहरू छन्।
WGCNA
WGCNA जीन सह-अभिव्यक्ति मोड्युलहरू पत्ता लगाउनको लागि व्यापक रूपमा प्रयोग हुने डाटा माइनिङ विधि हो।यो माइक्रोएरे डेटा र अर्को पुस्ताको अनुक्रमणबाट उत्पन्न भएको जीन अभिव्यक्ति डेटा सहित विभिन्न अभिव्यक्ति डेटासेटहरूमा लागू हुन्छ।
InterProScan
InterPro प्रोटीन अनुक्रम विश्लेषण र वर्गीकरण
GO_KEGG_Enrichment
यो उपकरण प्रदान गरिएको जीन सेट र सम्बन्धित एनोटेसनमा आधारित GO संवर्धन हिस्टोग्राम, KEGG संवर्धन हिस्टोग्राम र KEGG संवर्धन मार्ग उत्पन्न गर्न डिजाइन गरिएको हो।