समाचार

ट्रान्सपोजेबल एलिमेन्ट (TE) एम्प्लीफिकेशनलाई जीनोम साइज विस्तार र विकासको मध्यस्थता गर्ने ड्राइभिङ फोर्सको रूपमा मान्यता दिइएको छ, तर थ्रीडी जीनोमिक आर्किटेक्चरलाई आकार दिने परिणामहरू बिरुवाहरूमा धेरै हदसम्म अज्ञात छन्।यहाँ, हामी जिनोम साइजमा तीन गुणा हुने कपासका तीन प्रजातिका लागि सन्दर्भ-ग्रेड जिनोम एसेम्बलीहरू रिपोर्ट गर्छौं, अर्थात्गॉसिपियम रोटन्डिफोलियम(K2),G. arboreum(A2), रजी रेमन्डी(D5), Oxford Nanopore Technologies प्रयोग गर्दै।तुलनात्मक जीनोम विश्लेषणले वंश-विशिष्ट TE एम्प्लीफिकेशनको विवरणलाई ठूलो जीनोम साइज भिन्नता (K2, 2.44 Gb; A2, 1.62 Gb; D5, 750.19 Mb) मा योगदान पुर्‍याउँछ, र तुलनात्मक रूपमा संरक्षित जीन सामग्री र जीनोमहरू बीच सिन्टेनी सम्बन्धहरू संकेत गर्दछ।हामीले फेला पारेका छौं कि लगभग 17% सिन्टेनिक जीनहरूले सक्रिय ("A") र निष्क्रिय ("B") कम्पार्टमेन्टहरू बीच क्रोमाटिन स्थिति परिवर्तन प्रदर्शन गर्दछ, र TE प्रवर्धन जीन क्षेत्रहरूमा A कम्पार्टमेन्टको अनुपातको वृद्धिसँग सम्बन्धित थियो (~ 7,000 जीनहरू। ) K2 र A2 मा D5 सापेक्ष।केवल 42% टोपोलोजिकल रूपमा सम्बद्ध डोमेन (TAD) सीमाहरू तीन जीनोमहरू बीच संरक्षित गरिएको थियो।हाम्रो डेटाले वंश-विशिष्ट TAD सीमाहरूको गठन पछि TEs को हालैको प्रवर्धनलाई समावेश गर्दछ।यस अध्ययनले बिरुवाहरूमा उच्च-क्रम क्रोमाटिन संरचनाको विकासमा ट्रान्सपोसन-मध्यस्थ जीनोम विस्तारको भूमिकामा प्रकाश पार्छ।