प्लेटफर्म | पुस्तकालय आकार | सैद्धान्तिक डेटा उपज (प्रति सेल) | एकल-आधार शुद्धता | अनुप्रयोगहरू |
नानोपोर | 8Kb, 10kb, 20kb, Ultralong, cDNA-PCR | 70-90Gb/सेल | ८५-९२% | SV कलिङ, डे नोवो, पूर्ण-लम्बाइ अनुक्रमण, Iso-Seq, जीन एनोटेशन, DNA मेथिलेसनको पहिचान |
● PacBio सिक्वेन्सिङ प्लेटफर्ममा विभिन्न प्रजातिका हजारौं बन्द परियोजनाहरूसँग 5 वर्षभन्दा बढीको अनुभव।
● BMKGENE दोहोरो प्लेटफर्म RNA/DNA प्रमाणीकरणको साथ Oxford Nanopore को आधिकारिक साझेदार हो।
● त्यहाँ पूर्ण उपकरण र पर्याप्त सिक्वेन्सिङ थ्रुपुटको साथ सिक्वेन्सरहरूको मुख्यधारा मोडेलहरू छन्।
● नानोपोर प्लेटफर्ममा आधारित, 10 भन्दा बढी जनावर र वनस्पति Denovo अनुसन्धानहरू अन्तर्राष्ट्रिय प्रसिद्ध जर्नलहरूमा प्रकाशित भएका छन्।
नमूना प्रकार | रकम | एकाग्रता (Qubit ®) | भोल्युम | शुद्धता | अरू |
जीनोमिक डीएनए | डाटा आवश्यकता मा निर्भर गर्दछ | ≥20ng/μl | ≥15μl | OD260/280=1.7-2.2; OD260/230≥1.5; 260 nm मा पीक खाली गर्नुहोस्, कुनै प्रदुषण छैन | एकाग्रता Qubit र Qubit/Nanopore ≤ 2 द्वारा मापन गर्न आवश्यक छ |
कुल आरएनए | ≥1.2μg | ≥100μg/μl | ≥15μl | OD260/280=1.7-2.5; OD260/230=0.5-2.5;कुनै प्रदुषण छैन | RIN मान ≥7.5 |
DNA नमूनाको डाटा गुणस्तर मूल्याङ्कन
तालिका 1. सफा डाटा मा तथ्याङ्क।
BMKID | rawSeqNum | rawSumBase | cleanSeqNum | सफा सुमबेस | cleanN50Len | cleanN90Len | cleanMeanLen | सफा मैक्सलेन | सफाMeanQual |
DNA_BMK01 | १,२१८,२३९ | २६.३७ | 1,121,736 | २५.९० | २८,०१४ | १५,७६४ | २३,०९० | १४३,१८१ | 9 |
आरएनए नमूनाको डाटा गुणस्तर मूल्याङ्कन
तालिका 1. सफा डाटा मा तथ्याङ्क।
फाइलनाम | ग्राहक आईडी | पढ्ने संख्या | BaseNum | N50 | मीन लम्बाइ | अधिकतम लम्बाइ | MeanQscore |
RNA_BMK001 | C2 | ८,९४७,७०८ | ४,०४७,२३०,०८३ | ३९८ | ४५२ | १२९,२२७ | Q12 |
चित्र १. लम्बाइ वितरण पढ्नुहोस्
चित्र २. सफा डाटाको गुणस्तर स्कोर वितरण
चित्र 3. सफा डाटाको लम्बाइ र गुणस्तर स्कोर वितरण