उत्पादनहरू

*यहाँ देखाइएका डेमो परिणामहरू सबै बायोमार्कर टेक्नोलोजीहरूसँग प्रकाशित जीनोमहरूबाट हुन्

1.LTR सम्मिलित समय अनुमान: चित्रले अन्य प्रजातिहरूको तुलनामा, Weining राई जीनोममा LTR-RTs सम्मिलित समयहरूमा एक अद्वितीय बिमोडल वितरण देखाएको छ।सबैभन्दा भर्खरको शिखर लगभग 0.5 मिलियन वर्ष पहिले देखा पर्‍यो।

ली गुआंग एट अल।,प्रकृति जेनेटिक्स, २०२१

2. च्यायोटे (सेचियम एड्युल) मा फाइलोजेनी र जीन परिवार विश्लेषण : जीन परिवारमा चायोटे र अन्य 13 सम्बन्धित प्रजातिहरूको विश्लेषण गर्दा, चायोटे सर्प (ट्राइकोस्यान्थेस एन्गुइना) सँग सबैभन्दा नजिकको सम्बन्ध भएको पाइयो।27-45 म्याको आसपासमा सर्पबाट व्युत्पन्न भएको चायोटे र 25±4 म्यामा चायोटेमा सम्पूर्ण जीनोम नक्कल (WGD) देखियो, जुन कुकुबिटासीमा तेस्रो WGD घटना हो।

फु ए एट अल।,बागवानी अनुसन्धान, २०२१

3. सिन्टेनी विश्लेषण: फलफूलको विकासमा फाइटोहर्मोन्ससँग सम्बन्धित केही जीनहरू चायोटे, सर्प र स्क्वासमा पाइयो।चायोटे र स्क्वैस बीचको सम्बन्ध चायोटे र सर्पको बीचको भन्दा अलि बढी छ।

फु ए एट अल।,बागवानी अनुसन्धान, २०२१

4.Gene परिवार विश्लेषण: G.thurberi र G.davidsonii जीनोमहरूमा जीन परिवार विस्तार र संकुचनमा KEGG संवर्धनले स्टेरोइड बायोसिन्थेसिस र ब्रासिनोस्टेरोइड बायोसिन्थेसिस सम्बन्धित जीनहरू विस्तार गरिएको देखाएको छ।

याङ जेड एट अल।,BMC जीवविज्ञान, २०२१

5. सम्पूर्ण जीनोम डुप्लिकेशन विश्लेषण: 4DTV र Ks वितरण विश्लेषणले सम्पूर्ण जीनोम नक्कल घटना देखाइएको छ।intraspecies को शिखरहरु नक्कल घटनाहरु देखाइएको छ।अन्तरप्रजातिहरूको शिखरहरूले विशिष्टता घटनाहरू देखाइयो।विश्लेषणले संकेत गर्‍यो कि अन्य तीन नजिकका प्रजातिहरूसँग तुलना गर्दा, O. Europaea ले हालसालै ठूलो मात्रामा जीन डुप्लिकेशनबाट गुज्र्यो।

राव जी एट अल।,बागवानी अनुसन्धान, २०२१

BMK केस

काँटा बिनाको गुलाब: नमी अनुकूलनसँग जोडिएको जीनोमिक अन्तर्दृष्टि

प्रकाशित: राष्ट्रिय विज्ञान समीक्षा, २०२१

अनुक्रम रणनीति:

'बासीकोकाँडारहित' (आर।विचुरैननजीनोम:
लगभग।93 X PacBio + लगभग।90 X Nanopore + 267 X Illumina

प्रमुख परिणामहरू

1. उच्च गुणस्तरको R.wichuraiana जीनोम लामो-पढ्ने क्रमबद्ध प्रविधिहरू प्रयोग गरेर निर्माण गरिएको थियो, जसले 530.07 Mb को एसेम्बली दिन्छ (अनुमानित जीनोम आकार लगभग 525.9 Mb प्रवाह cytometry द्वारा र 525.5 जीनोम सर्वेक्षण द्वारा थियो; लगभग 3% heterozy थियो)।BUSCO अनुमानित स्कोर 93.9% थियो।"पुरानो ब्लश" (haploOB) सँग तुलना गर्दा, यस जीनोमको गुणस्तर र पूर्णता आधार एकल-आधार सटीकता र LTR असेंबली सूचकांक (LAI=20.03) द्वारा पुष्टि गरिएको थियो।R.wichuraiana जीनोममा 32,674 प्रोटीन कोडिङ जीनहरू छन्।

2. बहु-ओमिक्स संयुक्त विश्लेषण, तुलनात्मक जीनोमिक्स, ट्रान्सक्रिप्टोमिक्स, आनुवंशिक जनसंख्याको QTL विश्लेषण, R. wichuraiana र Rosa chinensis बीचको महत्वपूर्ण विशिष्टता प्रकट भयो।साथै, QTL मा सम्बन्धित जीनको अभिव्यक्ति भिन्नता स्टेम प्रिकल ढाँचासँग सम्बन्धित हुन सक्छ।

सिन्टेनी विश्लेषण, जीन परिवार क्लस्टर, विस्तार र संकुचन विश्लेषण सहित Basye;s Thornless र Rosa chinensis बीचको तुलनात्मक जीनोमिक्स विश्लेषणले धेरै संख्यामा भिन्नताहरू प्रकट गर्यो, जुन गुलाबमा महत्त्वपूर्ण विशेषताहरूसँग सम्बन्धित छ।NAC र FAR1/FRS जीन परिवारमा भएको अनौठो विस्तार ब्ल्याक स्पटको प्रतिरोधसँग सम्बन्धित हुने सम्भावना धेरै थियो।

Zhong, M., et al।"चोटा बिनाको गुलाब: आर्द्रता अनुकूलनसँग जोडिएको जीनोमिक अन्तर्दृष्टि"राष्ट्रिय विज्ञान समीक्षा, 2021;, nwab092।