उत्पादनहरू

1. उम्मेद्वार क्षेत्र पहिचान गर्न युक्लिडियन दूरी (ED) मा एसोसिएशन विश्लेषण आधार।निम्न चित्रमा

X-अक्ष: क्रोमोजोम संख्या;प्रत्येक डटले SNP को ED मान प्रतिनिधित्व गर्दछ।कालो रेखा फिट गरिएको ED मानसँग मेल खान्छ।उच्च ईडी मानले साइट र फेनोटाइप बीचको अधिक महत्त्वपूर्ण सम्बन्धलाई संकेत गर्दछ।रातो ड्यास रेखाले महत्त्वपूर्ण सम्बन्धको थ्रेसहोल्ड प्रतिनिधित्व गर्दछ।

2. कुनै SNP-सूचकाङ्कमा आधारित एसोसिएशन विश्लेषण

X-अक्ष: क्रोमोजोम संख्या;प्रत्येक थोप्लाले SNP-सूचकांक मानलाई प्रतिनिधित्व गर्दछ।कालो रेखा फिट गरिएको SNP-सूचकांक मानको लागि खडा हुन्छ।जति ठूलो मूल्य हुन्छ, त्यति नै महत्त्वपूर्ण संघ हुन्छ।

BMK केस

प्रमुख-प्रभाव मात्रात्मक विशेषता लोकस Fnl7.1 ले काकडीमा फलफूलको घाँटी लम्बाइसँग सम्बन्धित ढिलो भ्रूण उत्पन्न प्रचुर मात्रामा प्रोटिनलाई एन्कोड गर्छ।

प्रकाशित: प्लान्ट बायोटेक्नोलोजी जर्नल, २०२०

अनुक्रम रणनीति:

अभिभावक (Jin5-508, YN): 34× र 20× को लागि सम्पूर्ण जीनोम रिक्वेन्सिङ।

DNA पूलहरू (50 लामो घाँटी र 50 छोटो घाँटी): 61x र 52x को लागि अनुकरण

प्रमुख परिणामहरू

यस अध्ययनमा, पृथक जनसंख्या (F2 र F2:3) लामो घाँटी काकम्बर लाइन Jin5-508 र छोटो घाँटी YN क्रस गरेर उत्पन्न गरिएको थियो।दुईवटा डीएनए पोखरी ५० चरम लामो घाँटी भएका व्यक्ति र ५० चरम छोटो घाँटी भएका व्यक्तिहरूद्वारा निर्माण गरिएका थिए।प्रमुख-प्रभाव QTL Chr07 मा BSA विश्लेषण र परम्परागत QTL म्यापिङ द्वारा पहिचान गरिएको थियो।उम्मेदवार क्षेत्रलाई फाइन-म्यापिङ, जीन एक्सप्रेशन क्वान्टिफिकेशन र ट्रान्सजेनिक प्रयोगहरूद्वारा थप संकुचित गरिएको थियो, जसले गर्दन-लम्बाइ, CsFnl7.1 नियन्त्रण गर्ने मुख्य जीन प्रकट गर्‍यो।थप रूपमा, CsFnl7.1 प्रवर्तक क्षेत्रमा बहुरूपता सम्बन्धित अभिव्यक्तिसँग सम्बन्धित भएको पाइयो।थप फाइलोजेनेटिक विश्लेषणले सुझाव दियो कि Fnl7.1 लोकस भारतबाट उत्पन्न भएको धेरै सम्भावना छ।

ककम्बर घाँटी लम्बाइसँग सम्बन्धित उम्मेद्वार क्षेत्र पहिचान गर्न BSA विश्लेषणमा QTL- म्यापिङ

काकडी नेक-लम्बाइ QTL को LOD प्रोफाइलहरू Chr07 मा पहिचान गरियो