BMKCloud Log in
条形banner-၀၃

ထုတ်ကုန်များ

Prokaryotic RNA စီစစ်ခြင်း။

Prokaryotic RNA sequencing သည် ပြောင်းလဲနေသော cellular transcriptome ကိုခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာခြင်းဖြင့် RNA ၏တည်ရှိမှုနှင့် အရေအတွက်ကို ဖော်ပြရန်အတွက် နောက်မျိုးဆက် sequencing (NGS) ကိုအသုံးပြုသည်။ကျွန်ုပ်တို့၏ကုမ္ပဏီ၏ prokaryotic RNA စည်းမျဥ်းသည် အထူးသဖြင့် သင့်အား ကိုးကားထားသော ဂျီနိုမ်များပါသည့် ပရိုကရီအိုတီများကို ရည်ညွှန်းသည်၊ သင့်အား transcriptome profileing၊ gene structure analysis စသည်တို့ကို ပံ့ပိုးပေးပါသည်။ ၎င်းကို အခြေခံသိပ္ပံသုတေသန၊ ဆေးဝါးသုတေသနနှင့် ဖွံ့ဖြိုးတိုးတက်ရေးနှင့် အခြားအရာများတွင် ကျယ်ကျယ်ပြန့်ပြန့် အသုံးပြုထားသည်။

ပလပ်ဖောင်း- Illumina NovaSeq ပလပ်ဖောင်း


ဝန်ဆောင်မှုအသေးစိတ်

ဝန်ဆောင်မှုသတ်မှတ်ချက်များ

ပလပ်ဖောင်း- Illumina NovaSeq ပလပ်ဖောင်း၊ PE150

စာကြည့်တိုက် အမျိုးအစား- 350bp cDNA စာကြည့်တိုက်ကို ထည့်သွင်းပါ (အမြင့်မားဆုံး ဖြန့်ဖြူးမှုအပေါ် မူတည်သည်)

ပေါင်းစပ်နည်းဗျူဟာ- Paired-End 150 bp

အကြံပြုထားသည့် ဒေတာပမာဏ- 2 Gb ကုန်ကြမ်းဒေတာ/နမူနာ

ဇီဝအချက်အလက်

(1) ဒေတာအရည်အသွေးထိန်းချုပ်မှုကို စီစစ်ခြင်း- နူကလီးအိုတိုက်ဖြန့်ဖြူးမှု၊ အခြေခံအရည်အသွေးဖြန့်ဖြူးမှု၊ rRNA အချိုးအဆ၊

(2) Sequence alignment analysis- Alignment ရလဒ်စာရင်းဇယား၊ sequencing ၏ ရွှဲ၊ sequencing ၏လွှမ်းခြုံမှု၊

(၃) အကိုးအကား ဂျီနိုမ်မှတ်စာ (NR၊ Swiss-Prot၊ Pfam၊ COG၊ GO၊ KEGG);

(4) ဖော်ပြမှု ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာခြင်း- ဖော်ပြချက် ဖြန့်ဖြူးမှု (နမူနာ နှစ်ခု သို့မဟုတ် ထို့ထက်ပိုသော နမူနာများ)၊ နမူနာများကြား ထုတ်ဖော်ပြောဆိုမှုကို ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာခြင်း (Venn ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှု၊ ဆက်စပ်မှု ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှု၊ PCA ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှု)၊

(5) ကွဲပြားသောအသုံးအနှုန်းခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှု (နမူနာနှစ်ခု သို့မဟုတ် ထို့ထက်ပိုသော နမူနာများဖြင့်)

(၆) မျိုးရိုးဗီဇခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှု- Venn ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှု၊ အစုအဝေးခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှု၊ လုပ်ဆောင်ချက် မှတ်ချက်ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှု (COG၊ GO၊ KEGG)၊ လုပ်ဆောင်ချက် ကြွယ်ဝမှုခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှု (GO၊ KEGG)၊ လုပ်ဆောင်ချက် ကြွယ်ဝမှု chordal ဂရပ်၊ Ipath ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာချက်၊

(7) sRNA ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှု- sRNA ခန့်မှန်းချက်၊ sRNA မှတ်စာ (Blast၊ sRNAMap၊ sRNATarBase၊ SIPHT၊ Rfam)၊ sRNA အလယ်တန်းဖွဲ့စည်းပုံ ခန့်မှန်းချက်၊ sRNA ပစ်မှတ်မျိုးရိုးဗီဇ ခန့်မှန်းချက်၊

(8) Transcript တည်ဆောက်ပုံ ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာခြင်း- Operon ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှု၊ စာသားမှတ်တမ်း အစနှင့် အဆုံးဆိုက်များ ခန့်မှန်းချက်၊ UTR မှတ်ချက်နှင့် ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှု၊ မြှင့်တင်သူ အတွဲလိုက် ခန့်မှန်းမှု၊ SNP/InDel ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှု (SNP/InDel မှတ်ချက်၊ SNP/InDel ဒေသဆိုင်ရာ ဖြန့်ဖြူးမှု၊ SNP စာရင်းအင်း)။

Service Work Flow

နမူနာပေးပို့ခြင်း။

နမူနာပေးပို့ခြင်း။

စာကြည့်တိုက်ပြင်ဆင်ခြင်း။

စာကြည့်တိုက်တည်ဆောက်ရေး

Sequencing

Sequencing

ဒေတာခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာ

ဒေတာခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာ

ရောင်းချပြီးနောက်ဝန်ဆောင်မှုများ

ရောင်းချပြီးနောက်ဝန်ဆောင်မှုများ


  • ယခင်-
  • နောက်တစ်ခု:

  • ကိုးကားရယူပါ။

    သင့်စာကို ဤနေရာတွင် ရေးပြီး ကျွန်ုပ်တို့ထံ ပေးပို့ပါ။

    သင့်ထံ မက်ဆေ့ချ်ပို့ပါ-