-
Single- nucleus RNA Sequencing
ဆဲလ်တစ်ခုတည်း ဖမ်းယူခြင်းနှင့် တစ်ဦးချင်း စာကြည့်တိုက်တည်ဆောက်မှုနည်းပညာတွင် မြင့်မားသော ဆင့်ကဲဆင့်ကဲမှုဖြင့် ပေါင်းစပ်ခြင်းဖြင့် ဗီဇဖော်ပြမှုကို ဆဲလ်တစ်ခုချင်းအလိုက် ဆဲလ်အလိုက် လေ့လာမှုများကို ခွင့်ပြုသည်။၎င်းသည် ဆဲလ်အားလုံး၏ ပျမ်းမျှအားယူခြင်းဖြင့် ၎င်းတို့၏ မျိုးရိုးဗီဇကို ဖုံးကွယ်ထားခြင်းကို ရှောင်ရှားနိုင်စေမည့် ရှုပ်ထွေးသောဆဲလ်လူဦးရေအပေါ် ပိုမိုနက်နဲပြီး ပြီးပြည့်စုံသော စနစ်ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှုကို လုပ်ဆောင်နိုင်စေပါသည်။
သို့သော်လည်း အချို့သောဆဲလ်များသည် ဆဲလ်တစ်ခုတည်း ဆိုင်းငံ့ခြင်းအဖြစ် ပြုလုပ်ရန် မသင့်လျော်သောကြောင့် အခြားနမူနာပြင်ဆင်မှုနည်းလမ်းများ - တစ်ရှူးများမှ နျူကလိယကို ထုတ်ယူရန် လိုအပ်သည်၊ ဆိုလိုသည်မှာ နျူကလိယအား တစ်ရှူးများ သို့မဟုတ် ဆဲလ်များမှ တိုက်ရိုက်ထုတ်ယူပြီး single-nucleus suspension အဖြစ် ပြင်ဆင်သည်။ ဆဲလ် စီစစ်ခြင်း။
BMK သည် 10× Genomics ChromiumTM အခြေပြု ဆဲလ်တစ်ခုတည်း RNA စီစစ်ခြင်းဝန်ဆောင်မှုကို ပံ့ပိုးပေးပါသည်။ဤဝန်ဆောင်မှုကို ခုခံအားဆဲလ်များ ကွဲပြားခြင်း၊ အကျိတ်များ ကွဲပြားခြင်း၊ တစ်သျှူးများ ဖွံ့ဖြိုးခြင်းစသည့် ရောဂါဆိုင်ရာ လေ့လာမှုများတွင် ကျယ်ကျယ်ပြန့်ပြန့် အသုံးပြုခဲ့သည်။
Spatial transcriptome ချစ်ပ်- 10× Genomics
ပလပ်ဖောင်း- Illumina NovaSeq ပလပ်ဖောင်း
-
BMKMANU S1000 Spatial စာသားမှတ်တမ်း
Spatial transcriptomics သည် သိပ္ပံနည်းကျ ဆန်းသစ်တီထွင်မှု၏ ရှေ့တန်းမှ ရပ်တည်နေပြီး ၎င်းတို့၏ spatial context ကို ထိန်းသိမ်းထားစဉ် တစ်ရှူးများအတွင်း ရှုပ်ထွေးသော မျိုးဗီဇဖော်ပြမှုပုံစံများကို သုတေသီများအား စူးစမ်းလေ့လာရန် စွမ်းဆောင်နိုင်စေပါသည်။အမျိုးမျိုးသောပလက်ဖောင်းများကြားတွင် BMKGene သည် BMKManu S1000 Spatial Transcriptome Chip ကို ကြွားလုံးထုတ်ခဲ့ပြီး၊ပိုမိုကောင်းမွန်သော resolution5µM ၏ subcellular အကွာအဝေးသို့ရောက်ရှိခြင်းနှင့်ဖွင့်ခြင်း။အဆင့်ပေါင်းများစွာ ကြည်လင်ပြတ်သားမှု ဆက်တင်များ.S1000 ချစ်ပ်သည် အစက်အပြောက် ၂ သန်းခန့်ပါရှိသော နေရာအလိုက် ဘားကုဒ်ဖမ်းယူစစ်ဆေးသည့်ပစ္စတင်များပါရှိသော ပုတီးစေ့များပါသည့် microwells များကို အသုံးပြုထားသည်။spatial barcodes များဖြင့် ကြွယ်ဝသော cDNA စာကြည့်တိုက်ကို S1000 ချစ်ပ်မှ ပြင်ဆင်ပြီး နောက်ပိုင်းတွင် Illumina NovaSeq ပလပ်ဖောင်းပေါ်တွင် စီစစ်ထားသည်။နေရာဒေသအလိုက် ဘားကုဒ်လုပ်ထားသော နမူနာများနှင့် UMI များ ပေါင်းစပ်ခြင်းသည် ထုတ်လုပ်လိုက်သော ဒေတာများ၏ တိကျမှုနှင့် တိကျမှုကို သေချာစေသည်။BMKManu S1000 ချစ်ပ်၏ထူးခြားသောအရည်အချင်းမှာ ၎င်း၏ဘက်စုံအသုံးပြုနိုင်မှုတွင်ရှိပြီး မတူညီသောတစ်ရှူးများနှင့်အသေးစိတ်အဆင့်များအထိ ကောင်းစွာချိန်ညှိနိုင်သည့် Multi-level resolution ဆက်တင်များကို ပေးဆောင်သည်။ဤလိုက်လျောညီထွေရှိမှုသည် ချစ်ပ်အား ကွဲပြားသော spatial transcriptomics လေ့လာမှုများအတွက် ထူးထူးခြားခြားရွေးချယ်မှုတစ်ခုအဖြစ် သတ်မှတ်ပေးထားပြီး တိကျသော spatial clustering ကို ဆူညံသံအနည်းငယ်ဖြင့် သေချာစေသည်။
BMKManu S1000 ချစ်ပ်နှင့် အခြားသော spatial transcriptomics နည်းပညာများကို အသုံးပြု၍ သုတေသီများသည် ဆဲလ်များ၏ spatial အဖွဲ့အစည်းနှင့် တစ်ရှူးများအတွင်း ဖြစ်ပေါ်သည့် ရှုပ်ထွေးသော မော်လီကျူး အပြန်အလှန်တုံ့ပြန်မှုများကို သုတေသီများက ပိုမိုနားလည်သဘောပေါက်နိုင်ပြီး နယ်ပယ်များစွာတွင် ဇီဝဗေဒဆိုင်ရာ လုပ်ငန်းစဉ်များဆိုင်ရာ ယန္တရားများအကြောင်း တန်ဖိုးမဖြတ်နိုင်သော ထိုးထွင်းသိမြင်မှုများကို ပံ့ပိုးပေးပါသည်။ ကင်ဆာဗေဒ၊ အာရုံကြောသိပ္ပံ၊ ဖွံ့ဖြိုးမှုဆိုင်ရာ ဇီဝဗေဒ၊ ကိုယ်ခံစွမ်းအားနှင့် ရုက္ခဗေဒလေ့လာမှုများ။
ပလပ်ဖောင်း- BMKManu S1000 ချစ်ပ်နှင့် Illumina NovaSeq
-
10x Genomics Visium Spatial စာသားမှတ်တမ်း
Spatial transcriptomics သည် သုတေသီများအား ၎င်းတို့၏ spatial context ကို ထိန်းသိမ်းထားစဉ် တစ်ရှူးများအတွင်း မျိုးဗီဇဖော်ပြမှုပုံစံများကို စုံစမ်းစစ်ဆေးရန် ခွင့်ပြုသည့် နောက်ဆုံးပေါ်နည်းပညာတစ်ခုဖြစ်သည်။ဤဒိုမိန်းရှိ အားကောင်းသည့် ပလပ်ဖောင်းတစ်ခုသည် Illumina စီစစ်ခြင်းနှင့်အတူ 10x Genomics Visium ဖြစ်သည်။10X Visium ၏ နိယာမသည် တစ်ရှူးအပိုင်းများ ထားရှိရာ သတ်မှတ်ထားသော ဖမ်းယူဧရိယာပါသော အထူးပြု ချစ်ပ်ပေါ်တွင် တည်ရှိသည်။ဤဖမ်းယူမှုဧရိယာတွင် တစ်ရှူးအတွင်း ထူးခြားသော အာကာသတည်နေရာတစ်ခုစီနှင့် သက်ဆိုင်သည့် ဘားကုဒ်လုပ်ထားသော အစက်အပြောက်များ ပါဝင်ပါသည်။ထို့နောက် တစ်ရှူးမှ ဖမ်းယူထားသော RNA မော်လီကျူးများကို ပြောင်းပြန် ကူးယူခြင်း လုပ်ငန်းစဉ်အတွင်း ထူးခြားသော မော်လီကျူး အမှတ်အသားများ (UMIs) ဖြင့် တံဆိပ်တပ်ထားသည်။ဤဘားကုဒ်လုပ်ထားသော အစက်အပြောက်များနှင့် UMI များသည် ဆဲလ်တစ်ခုတည်း ကြည်လင်ပြတ်သားမှုတွင် မျိုးဗီဇဖော်ပြမှု၏ တိကျသော spatial mapping နှင့် quantification တို့ကို လုပ်ဆောင်ပေးပါသည်။နေရာဒေသအလိုက် ဘားကုဒ်လုပ်ထားသော နမူနာများနှင့် UMI များ ပေါင်းစပ်ခြင်းသည် ထုတ်လုပ်လိုက်သော ဒေတာများ၏ တိကျမှုနှင့် တိကျမှုကို သေချာစေသည်။ဤ Spatial Transcriptomics နည်းပညာကို အသုံးပြုခြင်းဖြင့် သုတေသီများသည် ကင်ဆာဗေဒ၊ အာရုံကြောသိပ္ပံ၊ ဖွံ့ဖြိုးမှုဆိုင်ရာ ဇီဝဗေဒဆိုင်ရာ ဇီဝဗေဒ၊ ကိုယ်ခံစွမ်းအားဆိုင်ရာ နယ်ပယ်ပေါင်းစုံရှိ နယ်ပယ်ပေါင်းစုံရှိ ဇီဝဗေဒဆိုင်ရာ ယန္တရားများအကြောင်း တန်ဖိုးမဖြတ်နိုင်သော ထိုးထွင်းသိမြင်မှုများကို ပေးစွမ်းနိုင်သည် နှင့် ရုက္ခဗေဒလေ့လာမှုများ။
ပလပ်ဖောင်း- 10X Genomics Visium နှင့် Illumina NovaSeq
-
အရှည်အပြည့် mRNA Sequencing-Nanopore
NGS-based mRNA sequencing သည် gene expression quantification အတွက် စွယ်စုံသုံးကိရိယာအဖြစ် လုပ်ဆောင်သော်လည်း၊ အတိုချုံးဖတ်ခြင်းအပေါ် ၎င်း၏ မှီခိုအားထားမှုသည် ရှုပ်ထွေးသော transscriptomic ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှုတွင် ၎င်း၏ ထိရောက်မှုကို ကန့်သတ်ထားသည်။အခြားတစ်ဖက်တွင်၊ Nanopore sequencing သည် ရှည်လျားသောဖတ်နည်းပညာကိုအသုံးပြုထားပြီး mRNA စာသားမှတ်တမ်းများကို စီစီခြင်းကိုလုပ်ဆောင်နိုင်စေပါသည်။ဤချဉ်းကပ်မှုသည် အစားထိုးပေါင်းစပ်ခြင်း၊ မျိုးဗီဇပေါင်းစပ်မှုများ၊ poly-adenylation နှင့် mRNA isoforms များ၏ အရေအတွက်ကို ကျယ်ကျယ်ပြန့်ပြန့်ရှာဖွေရန် ကူညီပေးသည်။
Nanopore စီစစ်ခြင်းသည် နာနိုပရီ မော်လီကျူး တစ်ခုတည်း မော်လီကျူးများကို အချိန်နှင့်တပြေးညီ လျှပ်စစ်အချက်ပြမှုများအပေါ် မူတည်သည်။မော်တာပရိုတိန်းများဖြင့် လမ်းညွှန်ထားသော၊ ကြိုးနှစ်ထပ် DNA သည် ဇီဝဖလင်တွင် ထည့်သွင်းထားသော နာနိုပရိုတင်းများနှင့် ချိတ်တွဲကာ ဗို့အားကွာခြားမှုအောက်တွင် နာနိုပရီချန်နယ်ကို ဖြတ်သွားသည့်အခါ ပြေလျော့သွားသည်။DNA ကြိုးမျှင်ပေါ်ရှိ မတူညီသောအခြေခံများမှထုတ်ပေးသော ထူးခြားသောလျှပ်စစ်အချက်ပြမှုများကို အချိန်နှင့်တပြေးညီခွဲခြားသိရှိနိုင်ပြီး တိကျပြီး စဉ်ဆက်မပြတ် နျူကလီးအိုတိုက်စီစီခြင်းကို လွယ်ကူချောမွေ့စေသည်။ဤဆန်းသစ်တီထွင်သောချဉ်းကပ်မှုတွင် တိုတောင်းသောစာဖတ်ခြင်းကန့်သတ်ချက်များကို ကျော်လွှားပြီး ရှုပ်ထွေးသော မျိုးရိုးဗီဇခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှုအတွက် ရှုပ်ထွေးသော စာသားမှတ်တမ်းလေ့လာမှုများ ပါဝင်သည်။
ပလပ်ဖောင်း- Nanopore Promethion P48
-
အစအဆုံး mRNA စီစစ်ခြင်း -PacBio
NGS-based mRNA sequencing သည် gene expression ကို quantify လုပ်ရန် စွယ်စုံသုံးကိရိယာတစ်ခုဖြစ်သော်လည်း၊ တိုတောင်းသော reads များအပေါ် မှီခိုအားထားမှုသည် ရှုပ်ထွေးသော transcriptomic ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှုတွင် ၎င်း၏အသုံးပြုမှုကို ကန့်သတ်ထားသည်။အခြားတစ်ဖက်တွင် PacBio sequencing (Iso-Seq) သည် အရှည်လျားဖတ်ထားသောနည်းပညာကို အသုံးပြုထားပြီး mRNA စာသားမှတ်တမ်းများကို စီစီခြင်းကိုလုပ်ဆောင်နိုင်စေပါသည်။ဤချဉ်းကပ်မှုသည် ဒေတာပမာဏများစွာလိုအပ်သောကြောင့် gene expression quantification အတွက် အဓိကရွေးချယ်မှုမဟုတ်သော်လည်း အစားထိုးပေါင်းစပ်ခြင်း၊ မျိုးဗီဇပေါင်းစပ်မှုများနှင့် poly-adenylation တို့ကို ကျယ်ကျယ်ပြန့်ပြန့်ရှာဖွေရေးတွင် လွယ်ကူချောမွေ့စေသည်။
PacBio sequencing နည်းပညာသည် single-molecule၊ real-time (SMRT) sequencing ပေါ်တွင် မူတည်ပြီး အစအဆုံး mRNA စာသားမှတ်တမ်းများကို ဖမ်းယူရာတွင် ထူးခြားသောအားသာချက်ကိုပေးစွမ်းသည်။ဤဆန်းသစ်သောချဉ်းကပ်မှုတွင် စီတန်းစဉ်အတွင်း DNA polymerase လုပ်ဆောင်ချက်ကို အချိန်နှင့်တစ်ပြေးညီ ကြည့်ရှုနိုင်စေမည့် သုညမုဒ်လှိုင်းလမ်းညွှန်များ (ZMWs)၊ မိုက်ခရိုဖန်တီးထားသော ရေတွင်းများကို အသုံးပြုခြင်း ပါဝင်သည်။ဤ ZMWs အတွင်းတွင်၊ PacBio ၏ DNA polymerase သည် ပေါင်းစပ် DNA ကြိုးမျှင်ကို ပေါင်းစပ်ပြီး mRNA မှတ်တမ်းများ တစ်ခုလုံးကို ရှည်လျားသော ဖတ်ရှုမှုကို ဖန်တီးပေးသည်။Circular Consensus sequencing (CCS) မုဒ်တွင် PacBio လုပ်ဆောင်ချက်သည် တူညီသော မော်လီကျူးကို ထပ်ခါတလဲလဲ စီစစ်ခြင်းဖြင့် တိကျမှုကို မြှင့်တင်ပေးပါသည်။ထုတ်လုပ်လိုက်သော HiFi ဖတ်များသည် NGS နှင့် နှိုင်းယှဉ်နိုင်သော တိကျမှုရှိပြီး ရှုပ်ထွေးသော စာသားမှတ်တမ်းအင်္ဂါရပ်များကို ကျယ်ကျယ်ပြန့်ပြန့်နှင့် ယုံကြည်စိတ်ချရသော ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှုတွင် အထောက်အကူပြုပါသည်။ပလပ်ဖောင်း- PacBio Sequel II
-
Eukaryotic mRNA Sequencing-Illumina
mRNA sequencing သည် သီးခြားအခြေအနေများအောက်တွင် ဆဲလ်အတွင်းရှိ mRNA မှတ်တမ်းများအားလုံးကို ကျယ်ကျယ်ပြန့်ပြန့် ပရိုဖိုင်ပြုလုပ်ခြင်းကို အားကောင်းစေသည်။ဤခေတ်မီနည်းပညာသည် အစွမ်းထက်သောကိရိယာတစ်ခုဖြစ်ပြီး ရှုပ်ထွေးရှုပ်ထွေးသော ဗီဇဖော်ပြချက်ပရိုဖိုင်များ၊ မျိုးရိုးဗီဇဖွဲ့စည်းပုံများနှင့် ကွဲပြားသောဇီဝဖြစ်စဉ်များနှင့်ဆက်စပ်နေသော မော်လီကျူးယန္တရားများကို ထုတ်ဖော်ပြသပေးပါသည်။အခြေခံသုတေသန၊ လက်တွေ့ရောဂါရှာဖွေခြင်းနှင့် ဆေးဝါးဖွံ့ဖြိုးတိုးတက်မှုတွင် ကျယ်ကျယ်ပြန့်ပြန့် လက်ခံကျင့်သုံးသော mRNA သည် ဆယ်လူလာဒိုင်းနမစ်များနှင့် မျိုးရိုးဗီဇဆိုင်ရာ စည်းမျဥ်းများဆိုင်ရာ ရှုပ်ထွေးနက်နဲသော ထိုးထွင်းဉာဏ်ကို ပေးပါသည်။
ပလပ်ဖောင်း- Illumina NovaSeq X
-
အကိုးအကားမဟုတ်သော mRNA Sequencing-Illumina
mRNA sequencing သည် သီးခြားအခြေအနေများအောက်တွင် ဆဲလ်အတွင်းရှိ mRNA မှတ်တမ်းများအားလုံးကို ကျယ်ကျယ်ပြန့်ပြန့် ပရိုဖိုင်ပြုလုပ်ခြင်းကို အားကောင်းစေသည်။ဤခေတ်မီနည်းပညာသည် အစွမ်းထက်သောကိရိယာတစ်ခုဖြစ်ပြီး ရှုပ်ထွေးရှုပ်ထွေးသော ဗီဇဖော်ပြချက်ပရိုဖိုင်များ၊ မျိုးရိုးဗီဇဖွဲ့စည်းပုံများနှင့် ကွဲပြားသောဇီဝဖြစ်စဉ်များနှင့်ဆက်စပ်နေသော မော်လီကျူးယန္တရားများကို ထုတ်ဖော်ပြသပေးပါသည်။အခြေခံသုတေသန၊ လက်တွေ့ရောဂါရှာဖွေခြင်းနှင့် ဆေးဝါးဖွံ့ဖြိုးတိုးတက်မှုတွင် ကျယ်ကျယ်ပြန့်ပြန့် လက်ခံကျင့်သုံးသော mRNA သည် ဆယ်လူလာဒိုင်းနမစ်များနှင့် မျိုးရိုးဗီဇဆိုင်ရာ စည်းမျဥ်းများဆိုင်ရာ ရှုပ်ထွေးနက်နဲသော ထိုးထွင်းဉာဏ်ကို ပေးပါသည်။
ပလပ်ဖောင်း- Illumina NovaSeq X
-
ရှည်လျားသော coding sequencing-Illumina
ရှည်လျားသော coding မဟုတ်သော RNAs (lncRNAs) များသည် ကုဒ်မဟုတ်သော RNA အတွင်းရှိ အဓိကဒြပ်စင်များဖြစ်သည့် 200 nucleotides ထက် ပိုရှည်သော RNA များဖြစ်သည်။နျူကလီးယပ်စ်နှင့် ဆိုက်တိုပလပ်စမ်များတွင်တွေ့ရှိရသည်၊ ဤ RNA များသည် ဆဲလ်လူလာနှင့် မော်လီကျူးဖြစ်စဉ်များကိုပုံဖော်ရာတွင် ၎င်းတို့၏အရေးပါမှုကို အလေးပေးဖော်ပြသည့် epigenetic၊ transcriptional နှင့် post-transcriptional regulation တွင် အရေးပါသောအခန်းကဏ္ဍမှပါဝင်သည်။LncRNA sequencing သည် ဆဲလ်ကွဲပြားမှု၊ Ontogenesis နှင့် လူသားရောဂါများအတွက် အစွမ်းထက်သောကိရိယာတစ်ခုဖြစ်သည်။
ပလပ်ဖောင်း- Illumina NovaSeq
-
သေးငယ်သော RNA sequencing-Illumina
သေးငယ်သော RNA (sRNA) မော်လီကျူးများသည် ပုံမှန်အားဖြင့် အရှည် 200 ရှိသော နျူကလီးအိုရိုက်များအောက်တွင် microRNAs (miRNAs)၊ အသေးစား interfering RNAs (siRNAs) နှင့် piwi-interacting RNAs (piRNAs) ပါဝင်သည်။ယင်းတို့အထဲတွင် miRNAs သည် 20-24 nucleotides ရှည်လျားသော ဆဲလ်လူလာ လုပ်ငန်းစဉ်များတွင် ၎င်းတို့၏ အဓိက ထိန်းကျောင်းမှုအခန်းကဏ္ဍအတွက် အထူးမှတ်သားဖွယ် မှတ်သားဖွယ်ကောင်းသည်။တစ်ရှူး သီးသန့်နှင့် အဆင့်အလိုက် ဖော်ပြမှုပုံစံများဖြင့် miRNA များသည် မတူညီသောမျိုးစိတ်များတစ်လျှောက် မြင့်မားသောထိန်းသိမ်းမှုကို ပြသသည်။
ပလပ်ဖောင်း- Illumina NovaSeq
-
circRNA sequencing-Illumina
Circular RNA sequencing (circRNA-seq) သည် အဝိုင်းပုံစံ RNA များကို ပရိုဖိုင်းနှင့် ပိုင်းခြားစိတ်ဖြာရန်ဖြစ်ပြီး၊ ဤ RNA များကို တိုးမြှင့်တည်ငြိမ်မှုပေးစွမ်းနိုင်သော အပိတ်အဝိုင်းများကို ဖွဲ့စည်းပေးသည့် RNA မော်လီကျူးအတန်းအစား၊အချို့သော circRNA များသည် microRNA ရေမြှုပ်များအဖြစ် လုပ်ဆောင်ရန်၊ microRNA များကို စုဆောင်းပြီး ၎င်းတို့၏ပစ်မှတ် mRNAs များကို ထိန်းညှိခြင်းမှ တားဆီးထားသော်လည်း၊ အခြားသော circRNA များသည် ပရိုတင်းများနှင့် ဓါတ်ပြုမှုများ၊ မျိုးရိုးဗီဇဖော်ပြမှုကို ပြုပြင်ခြင်း သို့မဟုတ် ဆဲလ်လူလာလုပ်ငန်းစဉ်များတွင် အခန်းကဏ္ဍများပါရှိသည်။circRNA စကားအသုံးအနှုန်းခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှုသည် ဤမော်လီကျူးများ၏ စည်းမျဉ်းဆိုင်ရာအခန်းကဏ္ဍများနှင့် အမျိုးမျိုးသောဆယ်လူလာလုပ်ငန်းစဉ်များ၊ ဖွံ့ဖြိုးတိုးတက်မှုအဆင့်များနှင့် ရောဂါအခြေအနေများတွင် ၎င်းတို့၏အရေးပါမှုကို ထိုးထွင်းသိမြင်စေကာ မျိုးရိုးဗီဇဖော်ပြမှုတွင် RNA စည်းမျဥ်း၏ ရှုပ်ထွေးနက်နဲမှုကို ပိုမိုနားလည်သဘောပေါက်စေရန် ပံ့ပိုးပေးပါသည်။
-
စာသားမှတ်တမ်းတစ်ခုလုံး - Illumina
စာသားမှတ်တမ်းအစီအစဥ်တစ်ခုလုံးသည် ကွဲပြားသော RNA မော်လီကျူးများကို ပရိုဖိုင်ပြုလုပ်ခြင်းအတွက် ကျယ်ကျယ်ပြန့်ပြန့်ချဉ်းကပ်မှုတစ်ခုဖြစ်ပြီး coding (mRNA) နှင့် non-coding RNAs (lncRNA၊ circRNA နှင့် miRNA) နှစ်ခုလုံးကို လွှမ်းခြုံထားသည်။ဤနည်းပညာသည် သတ်မှတ်ထားသောအခိုက်အတန့်တွင် ဆဲလ်များ၏ မှတ်တမ်းမှတ်ရာအပြည့်အစုံကို ဖမ်းယူနိုင်ပြီး ဆဲလ်လူလာဖြစ်စဉ်များကို အလုံးစုံနားလည်နိုင်စေပါသည်။“total RNA sequencing” ဟုလည်းသိကြပြီး၊ ၎င်းသည် ယှဉ်ပြိုင်နေသော endogenous RNA (ceRNA) နှင့် ပူးတွဲ RNA ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာခြင်းကဲ့သို့သော အတွင်းကျကျခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှုကို ပံ့ပိုးပေးသည့် ရှုပ်ထွေးသော စည်းမျဉ်းစည်းကမ်းကွန်ရက်များကို ထုတ်ဖော်ပြသရန် ရည်ရွယ်သည်။အထူးသဖြင့် circRNA-miRNA-mRNA-based ceRNA အပြန်အလှန်တုံ့ပြန်မှုများပါ၀င်သည့် စည်းမျဉ်းကွန်ရက်များကို ခွဲထုတ်ရာတွင် လုပ်ဆောင်ချက်ဆိုင်ရာ လက္ခဏာအသွင်ဆောင်ခြင်းဆီသို့ ကနဦးခြေလှမ်းကို အမှတ်အသားပြုပါသည်။
-
Prokaryotic mRNA စီစစ်ခြင်း။
mRNA sequencing သည် သီးခြားအခြေအနေများအောက်တွင် ဆဲလ်အတွင်းရှိ mRNA မှတ်တမ်းများအားလုံးကို ကျယ်ကျယ်ပြန့်ပြန့် ပရိုဖိုင်ပြုလုပ်ခြင်းကို အားကောင်းစေသည်။ဤခေတ်မီနည်းပညာသည် အစွမ်းထက်သောကိရိယာတစ်ခုဖြစ်ပြီး ရှုပ်ထွေးရှုပ်ထွေးသော ဗီဇဖော်ပြချက်ပရိုဖိုင်များ၊ မျိုးရိုးဗီဇဖွဲ့စည်းပုံများနှင့် ကွဲပြားသောဇီဝဖြစ်စဉ်များနှင့်ဆက်စပ်နေသော မော်လီကျူးယန္တရားများကို ထုတ်ဖော်ပြသပေးပါသည်။အခြေခံသုတေသန၊ လက်တွေ့ရောဂါရှာဖွေခြင်းနှင့် ဆေးဝါးဖွံ့ဖြိုးတိုးတက်မှုတွင် ကျယ်ကျယ်ပြန့်ပြန့် လက်ခံကျင့်သုံးသော mRNA သည် ဆယ်လူလာဒိုင်းနမစ်များနှင့် မျိုးရိုးဗီဇဆိုင်ရာ စည်းမျဥ်းများဆိုင်ရာ ရှုပ်ထွေးနက်နဲသော ထိုးထွင်းဉာဏ်ကို ပေးပါသည်။ကျွန်ုပ်တို့၏ prokaryotic mRNAနမူနာလုပ်ဆောင်ခြင်းကို rRNA လျော့နည်းခြင်းနှင့် လမ်းညွှန်စာကြည့်တိုက်ပြင်ဆင်မှုတို့ပါ၀င်သော prokaryotic စာသားမှတ်တမ်းများအတွက် အံဝင်ခွင်ကျဖြစ်စေပါသည်။
ပလပ်ဖောင်း- Illumina NovaSeq X
