-
Single- nucleus RNA Sequencing
ဆဲလ်တစ်ခုတည်း ဖမ်းယူခြင်းနှင့် တစ်ဦးချင်း စာကြည့်တိုက်တည်ဆောက်မှုနည်းပညာတွင် မြင့်မားသော ဆင့်ကဲဆင့်ကဲမှုဖြင့် ပေါင်းစပ်ခြင်းဖြင့် ဗီဇဖော်ပြမှုကို ဆဲလ်တစ်ခုချင်းအလိုက် ဆဲလ်အလိုက် လေ့လာမှုများကို ခွင့်ပြုသည်။၎င်းသည် ဆဲလ်အားလုံး၏ ပျမ်းမျှအားယူခြင်းဖြင့် ၎င်းတို့၏ မျိုးရိုးဗီဇကို ဖုံးကွယ်ထားခြင်းကို ရှောင်ရှားနိုင်စေမည့် ရှုပ်ထွေးသောဆဲလ်လူဦးရေအပေါ် ပိုမိုနက်နဲပြီး ပြီးပြည့်စုံသော စနစ်ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှုကို လုပ်ဆောင်နိုင်စေပါသည်။
သို့သော်လည်း အချို့သောဆဲလ်များသည် ဆဲလ်တစ်ခုတည်း ဆိုင်းငံ့ခြင်းအဖြစ် ပြုလုပ်ရန် မသင့်လျော်သောကြောင့် အခြားနမူနာပြင်ဆင်မှုနည်းလမ်းများ - တစ်ရှူးများမှ နျူကလိယကို ထုတ်ယူရန် လိုအပ်သည်၊ ဆိုလိုသည်မှာ နျူကလိယအား တစ်ရှူးများ သို့မဟုတ် ဆဲလ်များမှ တိုက်ရိုက်ထုတ်ယူပြီး single-nucleus suspension အဖြစ် ပြင်ဆင်သည်။ ဆဲလ် စီစစ်ခြင်း။
BMK သည် 10× Genomics ChromiumTM အခြေပြု ဆဲလ်တစ်ခုတည်း RNA စီစစ်ခြင်းဝန်ဆောင်မှုကို ပံ့ပိုးပေးပါသည်။ဤဝန်ဆောင်မှုကို ခုခံအားဆဲလ်များ ကွဲပြားခြင်း၊ အကျိတ်များ ကွဲပြားခြင်း၊ တစ်သျှူးများ ဖွံ့ဖြိုးခြင်းစသည့် ရောဂါဆိုင်ရာ လေ့လာမှုများတွင် ကျယ်ကျယ်ပြန့်ပြန့် အသုံးပြုခဲ့သည်။
Spatial transcriptome ချစ်ပ်- 10× Genomics
ပလပ်ဖောင်း- Illumina NovaSeq ပလပ်ဖောင်း
-
BMKMANU S1000 Spatial စာသားမှတ်တမ်း
Spatial transcriptomics သည် သိပ္ပံနည်းကျ ဆန်းသစ်တီထွင်မှု၏ ရှေ့တန်းမှ ရပ်တည်နေပြီး ၎င်းတို့၏ spatial context ကို ထိန်းသိမ်းထားစဉ် တစ်ရှူးများအတွင်း ရှုပ်ထွေးသော မျိုးဗီဇဖော်ပြမှုပုံစံများကို သုတေသီများအား စူးစမ်းလေ့လာရန် စွမ်းဆောင်နိုင်စေပါသည်။အမျိုးမျိုးသောပလက်ဖောင်းများကြားတွင် BMKGene သည် BMKManu S1000 Spatial Transcriptome Chip ကို ကြွားလုံးထုတ်ခဲ့ပြီး၊ပိုမိုကောင်းမွန်သော resolution5µM ၏ subcellular အကွာအဝေးသို့ရောက်ရှိခြင်းနှင့်ဖွင့်ခြင်း။အဆင့်ပေါင်းများစွာ ကြည်လင်ပြတ်သားမှု ဆက်တင်များ.S1000 ချစ်ပ်သည် အစက်အပြောက် ၂ သန်းခန့်ပါရှိသော နေရာအလိုက် ဘားကုဒ်ဖမ်းယူစစ်ဆေးသည့်ပစ္စတင်များပါရှိသော ပုတီးစေ့များပါသည့် microwells များကို အသုံးပြုထားသည်။spatial barcodes များဖြင့် ကြွယ်ဝသော cDNA စာကြည့်တိုက်ကို S1000 ချစ်ပ်မှ ပြင်ဆင်ပြီး နောက်ပိုင်းတွင် Illumina NovaSeq ပလပ်ဖောင်းပေါ်တွင် စီစစ်ထားသည်။နေရာဒေသအလိုက် ဘားကုဒ်လုပ်ထားသော နမူနာများနှင့် UMI များ ပေါင်းစပ်ခြင်းသည် ထုတ်လုပ်လိုက်သော ဒေတာများ၏ တိကျမှုနှင့် တိကျမှုကို သေချာစေသည်။BMKManu S1000 ချစ်ပ်၏ထူးခြားသောအရည်အချင်းမှာ ၎င်း၏ဘက်စုံအသုံးပြုနိုင်မှုတွင်ရှိပြီး မတူညီသောတစ်ရှူးများနှင့်အသေးစိတ်အဆင့်များအထိ ကောင်းစွာချိန်ညှိနိုင်သည့် Multi-level resolution ဆက်တင်များကို ပေးဆောင်သည်။ဤလိုက်လျောညီထွေရှိမှုသည် ချစ်ပ်အား ကွဲပြားသော spatial transcriptomics လေ့လာမှုများအတွက် ထူးထူးခြားခြားရွေးချယ်မှုတစ်ခုအဖြစ် သတ်မှတ်ပေးထားပြီး တိကျသော spatial clustering ကို ဆူညံသံအနည်းငယ်ဖြင့် သေချာစေသည်။
BMKManu S1000 ချစ်ပ်နှင့် အခြားသော spatial transcriptomics နည်းပညာများကို အသုံးပြု၍ သုတေသီများသည် ဆဲလ်များ၏ spatial အဖွဲ့အစည်းနှင့် တစ်ရှူးများအတွင်း ဖြစ်ပေါ်သည့် ရှုပ်ထွေးသော မော်လီကျူး အပြန်အလှန်တုံ့ပြန်မှုများကို သုတေသီများက ပိုမိုနားလည်သဘောပေါက်နိုင်ပြီး နယ်ပယ်များစွာတွင် ဇီဝဗေဒဆိုင်ရာ လုပ်ငန်းစဉ်များဆိုင်ရာ ယန္တရားများအကြောင်း တန်ဖိုးမဖြတ်နိုင်သော ထိုးထွင်းသိမြင်မှုများကို ပံ့ပိုးပေးပါသည်။ ကင်ဆာဗေဒ၊ အာရုံကြောသိပ္ပံ၊ ဖွံ့ဖြိုးမှုဆိုင်ရာ ဇီဝဗေဒ၊ ကိုယ်ခံစွမ်းအားနှင့် ရုက္ခဗေဒလေ့လာမှုများ။
ပလပ်ဖောင်း- BMKManu S1000 ချစ်ပ်နှင့် Illumina NovaSeq
-
10x Genomics Visium Spatial စာသားမှတ်တမ်း
Spatial transcriptomics သည် သုတေသီများအား ၎င်းတို့၏ spatial context ကို ထိန်းသိမ်းထားစဉ် တစ်ရှူးများအတွင်း မျိုးဗီဇဖော်ပြမှုပုံစံများကို စုံစမ်းစစ်ဆေးရန် ခွင့်ပြုသည့် နောက်ဆုံးပေါ်နည်းပညာတစ်ခုဖြစ်သည်။ဤဒိုမိန်းရှိ အားကောင်းသည့် ပလပ်ဖောင်းတစ်ခုသည် Illumina စီစစ်ခြင်းနှင့်အတူ 10x Genomics Visium ဖြစ်သည်။10X Visium ၏ နိယာမသည် တစ်ရှူးအပိုင်းများ ထားရှိရာ သတ်မှတ်ထားသော ဖမ်းယူဧရိယာပါသော အထူးပြု ချစ်ပ်ပေါ်တွင် တည်ရှိသည်။ဤဖမ်းယူမှုဧရိယာတွင် တစ်ရှူးအတွင်း ထူးခြားသော အာကာသတည်နေရာတစ်ခုစီနှင့် သက်ဆိုင်သည့် ဘားကုဒ်လုပ်ထားသော အစက်အပြောက်များ ပါဝင်ပါသည်။ထို့နောက် တစ်ရှူးမှ ဖမ်းယူထားသော RNA မော်လီကျူးများကို ပြောင်းပြန် ကူးယူခြင်း လုပ်ငန်းစဉ်အတွင်း ထူးခြားသော မော်လီကျူး အမှတ်အသားများ (UMIs) ဖြင့် တံဆိပ်တပ်ထားသည်။ဤဘားကုဒ်လုပ်ထားသော အစက်အပြောက်များနှင့် UMI များသည် ဆဲလ်တစ်ခုတည်း ကြည်လင်ပြတ်သားမှုတွင် မျိုးဗီဇဖော်ပြမှု၏ တိကျသော spatial mapping နှင့် quantification တို့ကို လုပ်ဆောင်ပေးပါသည်။နေရာဒေသအလိုက် ဘားကုဒ်လုပ်ထားသော နမူနာများနှင့် UMI များ ပေါင်းစပ်ခြင်းသည် ထုတ်လုပ်လိုက်သော ဒေတာများ၏ တိကျမှုနှင့် တိကျမှုကို သေချာစေသည်။ဤ Spatial Transcriptomics နည်းပညာကို အသုံးပြုခြင်းဖြင့် သုတေသီများသည် ကင်ဆာဗေဒ၊ အာရုံကြောသိပ္ပံ၊ ဖွံ့ဖြိုးမှုဆိုင်ရာ ဇီဝဗေဒဆိုင်ရာ ဇီဝဗေဒ၊ ကိုယ်ခံစွမ်းအားဆိုင်ရာ နယ်ပယ်ပေါင်းစုံရှိ နယ်ပယ်ပေါင်းစုံရှိ ဇီဝဗေဒဆိုင်ရာ ယန္တရားများအကြောင်း တန်ဖိုးမဖြတ်နိုင်သော ထိုးထွင်းသိမြင်မှုများကို ပေးစွမ်းနိုင်သည် နှင့် ရုက္ခဗေဒလေ့လာမှုများ။
ပလပ်ဖောင်း- 10X Genomics Visium နှင့် Illumina NovaSeq
