ထုတ်ကုန်များ

Eukaryotic mRNA Sequencing-Illumina

mRNA စီစစ်ခြင်းသည် တိကျသောအခြေအနေများအောက်တွင် ဆဲလ်များမှကူးယူထားသော mRNA အားလုံးကို ပရိုဖိုင်ပြုလုပ်နိုင်စေပါသည်။၎င်းသည် မျိုးဗီဇဖော်ပြမှုပရိုဖိုင်၊ မျိုးဗီဇဖွဲ့စည်းပုံများနှင့် အချို့သောဇီဝဖြစ်စဉ်များ၏ မော်လီကျူးယန္တရားများကို ထုတ်ဖော်ပြသရန်အတွက် အစွမ်းထက်သောနည်းပညာတစ်ခုဖြစ်သည်။ယနေ့အထိ၊ mRNA sequencing ကို အခြေခံကျသော သုတေသန၊ ဆေးခန်းဆိုင်ရာ ရောဂါရှာဖွေမှု၊ ဆေးဝါးဖွံ့ဖြိုးတိုးတက်မှုစသည်ဖြင့် တွင်ကျယ်စွာ အသုံးပြုခဲ့သည်။

ပလပ်ဖောင်း- Illumina NovaSeq ပလပ်ဖောင်း

ကြှနျုပျတို့ကိုဆကျသှယျရနျ

ဝန်ဆောင်မှုအသေးစိတ်

ဇီဝအချက်အလက်

သရုပ်ပြရလဒ်များ

အားသာချက်များ

● အတွေ့အကြုံကောင်းများ- ဆဲလ်ယဉ်ကျေးမှု၊ တစ်ရှူးများ၊ ခန္ဓာကိုယ်အရည်များ စသည်တို့အပါအဝင် ကွဲပြားသောနမူနာအမျိုးအစားများကို လွှမ်းခြုံထားသော BMK တွင် နမူနာ 200,000 ကျော်ကို စီမံဆောင်ရွက်ထားပြီး အမျိုးမျိုးသော သုတေသနနယ်ပယ်ကို လွှမ်းခြုံထားသော mRNA-Seq ပရောဂျက်ပေါင်း 7,000 ကျော်။

● တင်းကျပ်သော အရည်အသွေးထိန်းချုပ်မှုစနစ်- နမူနာပြင်ဆင်မှု၊ စာကြည့်တိုက်ပြင်ဆင်မှု၊ စီစစ်ခြင်းနှင့် ဇီဝသတင်းအချက်အလတ်များအပါအဝင် အဆင့်အားလုံးမှတစ်ဆင့် အရည်အသွေးမြင့်ရလဒ်များကို ပေးပို့နိုင်ရန် အနီးကပ်စောင့်ကြည့်မှုအောက်တွင် ရှိနေပါသည်။

● မတူကွဲပြားသော သုတေသနပန်းတိုင်များကို ဖြည့်ဆည်းရန်အတွက် လုပ်ဆောင်မှုမှတ်စာများနှင့် ပြည့်စုံလေ့လာမှုများအတွက် ရရှိနိုင်သောဒေတာဘေ့စ်များစွာ။

● ရောင်းပြီးနောက်ပိုင်းဝန်ဆောင်မှုများ- ပရောဂျက်များနောက်ဆက်တွဲ၊ ပြဿနာဖြေရှင်းခြင်း၊ ရလဒ်များ အမေးအဖြေစသည်ဖြင့် ပရောဂျက်ပြီးဆုံးချိန်တွင် 3 လအထိ သက်တမ်းရှိသော ဝန်ဆောင်မှုများ။

နမူနာလိုအပ်ချက်များနှင့် ပေးပို့ခြင်း။

စာကြည့်တိုက်	Sequence ဗျူဟာ	ဒေတာအကြံပြုထားသည်။	အရည်အသွေးထိန်းချုပ်မှု
Poly A ကြွယ်ဝသည်။	Illumina PE150	6 Gb	Q30≥85%

နမူနာလိုအပ်ချက်များ-

Nucleotides-

Conc.(ng/μl)

ပမာဏ (μg)

သန့်ရှင်းစင်ကြယ်ခြင်း။

သမာဓိ

≥ ၂၀

≥ 0.5

OD260/280=1.7-2.5

OD260/230=0.5-2.5

ဂျယ်တွင်ပြသထားသော ပရိုတင်း သို့မဟုတ် DNA ညစ်ညမ်းမှု အကန့်အသတ် သို့မဟုတ် မရှိပါ။

အပင်များအတွက် RIN≥6.5;

တိရစ္ဆာန်များအတွက် RIN≥7.0;

5.0≥28S/18S≥1.0;

အကန့်အသတ် သို့မဟုတ် အခြေခံအဆင့်မြင့်ခြင်း

တစ်ရှူး- အလေးချိန် (အခြောက်)≥1 ဂရမ်
* 5 မီလီဂရမ်ထက်သေးငယ်သောတစ်ရှူးအတွက်၊ ဖလက်ရှ်အေးခဲထားသော (နိုက်ထရိုဂျင်အရည်တွင်) တစ်ရှူးနမူနာကို ပေးပို့ရန် အကြံပြုအပ်ပါသည်။

ဆဲလ်ဆိုင်းငံ့မှု-ဆဲလ်အရေအတွက် = 3×10⁶- 1×10⁷
* အေးခဲနေသောဆဲလ် lysate ကိုတင်ပို့ရန်ကျွန်ုပ်တို့အကြံပြုပါသည်။ဆဲလ်သည် 5×105 ထက်ငယ်ပါက ရေတွက်ပါ။

သွေးနမူနာများထုထည်≥1 ml

သေးငယ်သောဇီဝသက်ရှိ-ထုထည် ≥ 1 ဂရမ်

နမူနာပေးပို့မှု အကြံပြုထားသည်။

ကွန်တိန်နာ- 2 ml centrifuge tube (Tin foil ကို မထောက်ခံပါ)

နမူနာတံဆိပ်ကပ်ခြင်း- အုပ်စု+ဥပမာ A1၊ A2၊ A3၊B1၊ B2၊ B3 ......

တင်ပို့မှု-

ရေခဲခြောက်- နမူနာများကို အိတ်များတွင် ထုပ်ပိုးပြီး ရေခဲခြောက်ထဲတွင် မြှုပ်ထားရန် လိုအပ်သည်။
RNAstable tubes- RNA နမူနာများကို RNA stabilization tube (ဥပမာ RNAstable®) တွင် အခြောက်ခံပြီး အခန်းအပူချိန်တွင် တင်ပို့နိုင်ပါသည်။