ထုတ်ကုန်များ

DNA/RNA စည်းမျဥ်း - နာနိုပရီဆက်ခံခြင်း

DNA/RNA Sequencing - Nanopore Sequencer အထူးအသားပေးပုံ

ONT sequencing သည် nanopores များကို အခြေခံ၍ အချိန်နှင့်တပြေးညီ လျှပ်စစ်အချက်ပြမှုဆိုင်ရာ မော်လီကျူးတစ်ခုတည်းကို ပေါင်းစပ်ခြင်းနည်းပညာဖြစ်ပြီး၊ ပလပ်ဖောင်းတစ်ခုစီ၏ စီစစ်ခြင်းနိယာမသည် အတူတူပင်ဖြစ်သည်။နှစ်ထပ်သောင်တင်ထားသော DNA/RNA သည် biofilm တွင်ထည့်သွင်းထားသော nanoporous ပရိုတင်းများနှင့် ချိတ်ဆက်မည်ဖြစ်ပြီး၊ မော်တာပရိုတင်း၏ဦးဆောင်မှုအောက်တွင် ဖြည်လိုက်မည်ဖြစ်ပြီး၊ biofilm ၏နှစ်ဖက်စလုံးမှဗို့အားကွာခြားချက်ဖြင့်၊ DNA/RNA ကြိုးများသည် အချို့သောအချိန်တွင် nanopore channel ပရိုတင်းမှတဆင့်ဖြတ်သန်းသွားမည်ဖြစ်သည်။ နှုန်း။DNA/RNA strand ပေါ်ရှိ မတူညီသော အခြေခံများ၏ ဓာတုဂုဏ်သတ္တိများ ကွဲပြားမှုကြောင့်၊ တစ်ခုတည်းသော အခြေခံ သို့မဟုတ် DNA မော်လီကျူးသည် နာနိုပရီချန်နယ်ကို ဖြတ်သွားသောအခါ၊ ၎င်းသည် မတူညီသော လျှပ်စစ်အချက်ပြမှုများ အပြောင်းအလဲကို ဖြစ်စေသည်။ဤအချက်ပြမှုများကို ထောက်လှမ်းပြီး ဆက်စပ်ခြင်းဖြင့် သက်ဆိုင်သော အခြေခံအမျိုးအစားများကို တွက်ချက်နိုင်ပြီး sequence ၏ အချိန်နှင့်တစ်ပြေးညီ သိရှိမှုကို ပြီးမြောက်နိုင်ပါသည်။

ကြှနျုပျတို့ကိုဆကျသှယျရနျ

ဝန်ဆောင်မှုအသေးစိတ်

သရုပ်ပြရလဒ်

ဝန်ဆောင်မှုအသေးစိတ်အင်္ဂါရပ်များ

ပလပ်ဖောင်း	စာကြည့်တိုက်အရွယ်အစား	သီအိုရီဒေတာ အထွက်နှုန်း (ဆဲလ်တစ်ခုစီ)	Single-base တိကျမှု	လျှောက်လွှာများ
နာနိုပီးယား	8Kb၊ 10kb၊ 20kb၊ Ultralong၊ cDNA-PCR	70-90Gb/Cell	၈၅-၉၂%	SV ခေါ်ဆိုမှု၊ De novo၊ အရှည်လျား စီစစ်ခြင်း၊ Iso-Seq၊ ဗီဇဖော်ပြချက်၊ DNA မက်သွိုင်းရှင်းကို စစ်ဆေးခြင်း

ဝန်ဆောင်မှု အားသာချက်များ

● မျိုးစိတ်အမျိုးမျိုးဖြင့် ပိတ်ထားသော ပရောဂျက်ပေါင်း ထောင်ပေါင်းများစွာရှိသော PacBio စီစစ်ခြင်းပလပ်ဖောင်းတွင် 5 နှစ်ကျော်အတွေ့အကြုံ။
● BMKGENE သည် Dual Platform RNA/DNA အသိအမှတ်ပြုလက်မှတ်ဖြင့် Oxford Nanopore ၏တရားဝင်ပါတနာဖြစ်သည်။
● ကိရိယာအပြည့်အစုံနှင့် လုံလောက်သော စီစစ်ခြင်းဖြတ်သန်းမှုပါရှိသော ပင်မရေစီးကြောင်း မော်ဒယ်များ ရှိပါသည်။
● Nanopore ပလပ်ဖောင်းကို အခြေခံ၍ တိရစ္ဆာန်နှင့် အပင် Denovo သုတေသနပြုချက် 10 ကျော်ကို နိုင်ငံတကာ ကျော်ကြားသော ဂျာနယ်များတွင် ထုတ်ဝေခဲ့သည်။

နမူနာလိုအပ်ချက်များ

နမူနာအမျိုးအစား

ပမာဏ

အာရုံစူးစိုက်မှု(Qubit ®)

အတွဲ

သန့်ရှင်းစင်ကြယ်ခြင်း။

တခြားသူတွေ

မျိုးရိုးဗီဇ DNA

ဒေတာလိုအပ်ချက်အပေါ် မူတည်

≥20ng/μl

≥15μl

OD260/280=1.7-2.2;

OD260/230≥1.5；

260 nm တွင် ရှင်းလင်းသော အမြင့်ဆုံး၊ ညစ်ညမ်းမှု မရှိပါ။

အာရုံစူးစိုက်မှုကို Qubit နှင့် Qubit/Nanopore ≤ 2 ဖြင့် တိုင်းတာရန် လိုအပ်သည်။

စုစုပေါင်း RNA

≥1.2μg

≥100μg/μl

≥15μl

OD260/280=1.7-2.5;

OD260/230=0.5-2.5； ညစ်ညမ်းမှုမရှိပါ။

RIN တန်ဖိုး ≥7.5

ဝန်ဆောင်မှုလုပ်ငန်းအသွားအလာ

နမူနာပြင်ဆင်မှု

စာကြည့်တိုက်တည်ဆောက်ရေး

Sequencing

ဒေတာခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာ

စီမံကိန်းပေးပို့ခြင်း။

ယခင်- DNA/RNA Sequence - Illumina Sequencer

နောက်တစ်ခု: Specific-Locus Amplified Fragment Sequencing (SLAF-Seq)

DNA နမူနာ၏ ဒေတာအရည်အသွေး အကဲဖြတ်ခြင်း။

ဇယား 1. သန့်ရှင်းသောဒေတာဆိုင်ရာ စာရင်းအင်းများ။

BMKID	rawSeqNum	rawSumBase	cleanSeqNum	cleanSumBase	သန့်ရှင်းသောN50Len	သန့်ရှင်းသောN90Len	cleanMeanLen	သန့်စင်သော MaxLen	cleanMeanQual
DNA_BMK01	၁၊၂၁၈၊၂၃၉	၂၆၊၃၇	၁၊၁၂၁၊၇၃၆	25.90	၂၈၊၀၁၄	၁၅.၇၆၄	၂၃,၀၉၀	၁၄၃။၁၈၁	9

RNA နမူနာ၏ ဒေတာအရည်အသွေး အကဲဖြတ်ခြင်း။

ဇယား 1. သန့်ရှင်းသောဒေတာဆိုင်ရာ စာရင်းအင်းများ။

ဖိုင်နာမည်	ClientID	ReadNum	BaseNum	N50	အရှည်	MaxLength	MeanQscore
RNA_BMK001	C2	၈.၉၄၇.၇၀၈	၄၊၀၄၇၊၂၃၀၊၀၈၃	၃၉၈	၄၅၂	၁၂၉၊၂၂၇	Q12