●ပလပ်ဖောင်းများ-Illumina NovaSeq 6000၊ NovaSeq၊ HiSeq X Ten နှင့် BGI-DNB-T7
●ဆက်တိုက်မုဒ်များ-PE50, PE100, PE150, PE250
●အတွဲလိုက်မလုပ်မီ စာကြည့်တိုက်များ၏ အရည်အသွေးကို ထိန်းချုပ်ပါ။
●ဒေတာပေးပို့ခြင်းနှင့် QC စီခြင်း-QC အစီရင်ခံစာနှင့် ကုန်ကြမ်းဒေတာကို demultiplexing နှင့် filtering Q30 ဖတ်ပြီးနောက် fastq ဖော်မတ်ဖြင့် ပေးပို့ခြင်း။
●Sequencing ဝန်ဆောင်မှုများ၏ ဘက်စုံသုံးနိုင်မှု-သုံးစွဲသူသည် လမ်းကြော၊ စီးဆင်းမှုဆဲလ် သို့မဟုတ် ဒေတာပမာဏအလိုက် စီရန်ရွေးချယ်နိုင်သည်။
●ပလပ်ဖောင်းများ၏ ဘက်စုံအသုံးပြုနိုင်မှု-DNB စာကြည့်တိုက်များကို Illumina ပလပ်ဖောင်းများသို့လွှဲပြောင်းနိုင်သည်။
●Illumina sequencing platform တွင် ကျယ်ပြန့်သော အတွေ့အကြုံ။မျိုးစိတ်အမျိုးမျိုးဖြင့် ပိတ်ထားသော ပရောဂျက်ပေါင်း ထောင်နှင့်ချီ၍
●ဆက်တိုက် QC အစီရင်ခံစာပေးပို့ခြင်း-အရည်အသွေးတိုင်းတာမှုများ၊ ဒေတာတိကျမှုနှင့် စီစစ်ခြင်းပရောဂျက်၏ အလုံးစုံစွမ်းဆောင်ရည်တို့နှင့်အတူ။
●အရွယ်ရောက်ပြီးသော စီတန်းခြင်းလုပ်ငန်းစဉ်-အလှည့်ကျအချိန်တိုဖြင့်။
●တင်းကျပ်သောအရည်အသွေးထိန်းချုပ်မှု: ကျွန်ုပ်တို့သည် အရည်အသွေးမြင့်မားသောရလဒ်များကို တစ်သမတ်တည်းပေးဆောင်ရန် အာမခံရန် တင်းကျပ်သော QC လိုအပ်ချက်များကို အကောင်အထည်ဖော်ပါသည်။
ဒေတာပမာဏ (X) | အာရုံစူးစိုက်မှု (qPCR/nM) | အတွဲ |
X ≤ 50 Gb | ≥ 2 nM | ≥ 20 μl |
50 Gb ≤ X < 100 Gb | ≥ 3 nM | ≥ 20 μl |
X ≥ 100 Gb | ≥ 4 nM | ≥ 20 μl |
ပလပ်ဖောင်း | အာရုံစူးစိုက်မှု (qPCR/nM) | အတွဲ |
HiSeq X Ten | ≥ 2 nM | ≥ 20 μl |
NovaSeq 6000 SP | ≥ 1 nM | ≥ 25 μl |
NovaSeq 6000 S4 | ≥ 1.5 nM | ≥ 25 μl |
NovaSeq X | ≥ 1.5 nM | ≥ 25 μl |
BGI-DNBSEQ-T7 | ≥ 1.5 nM | ≥ 25 μl |
အာရုံစူးစိုက်မှုနှင့် စုစုပေါင်းပမာဏအပြင် သင့်လျော်သော အမြင့်ဆုံးပုံစံတစ်ခုလည်း လိုအပ်ပါသည်။
အတွဲလိုက်၊ စာကြည့်တိုက် ပမာဏကို အကဲဖြတ်ခြင်းနှင့် အပိုင်းပိုင်းခွဲခြင်းမပြုမီ စာကြည့်တိုက်၏ အရည်အသွေးဆိုင်ရာ အစီရင်ခံစာကို ပံ့ပိုးပေးပါသည်။
ဇယား 1. ကိန်းဂဏာန်းများ စီစစ်ခြင်းဆိုင်ရာ ကိန်းဂဏန်းများ။
နမူနာ ID | BMKID | အကြမ်းဖတ်တယ်။ | ဒေတာအကြမ်း (bp) | သန့်ရှင်းစွာဖတ်ခြင်း (%) | Q20(%) | Q30(%) | GC(%) |
C_01 | BMK_01 | ၂၂,၈၇၀,၁၂၀ | ၆,၈၆၁,၀၃၆,၀၀၀ | ၉၆.၄၈ | ၉၉.၁၄ | ၉၄.၈၅ | ၃၆.၆၇ |
C_02 | BMK_02 | ၁၄၊၇၁၇၊၈၆၇ | ၄၊၄၁၅၊၃၆၀၊၁၀၀ | ၉၆.၀၀ | ၉၈.၉၅ | ၉၃.၈၉ | ၃၇.၀၈ |
ပုံ 1။ နမူနာတစ်ခုစီတွင် ဖတ်ရှုထားသော အရည်အသွေးများ ဖြန့်ဝေခြင်း။
ပုံ 2။ အခြေခံအကြောင်းအရာ ဖြန့်ဖြူးခြင်း။
ပုံ 3။ အချက်အလက် စီတန်းခြင်းတွင် ဖတ်ထားသော အကြောင်းအရာများကို ဖြန့်ဝေခြင်း။