● ပြည့်စုံသော ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာခြင်း- စိတ်ကြိုက်ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှု လိုအပ်ချက်အမျိုးမျိုးကို ပြည့်မီရန် ပရော်ဖက်ရှင်နယ်ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာမှု ပိုက်လိုင်း၊
● ကျယ်ပြန့်သောအတွေ့အကြုံ- တိရစ္ဆာန်နှင့် အပင်နမူနာများအပါအဝင် ပရောဂျက် ရာပေါင်းများစွာကို ယခုအချိန်အထိ အောင်မြင်စွာ ပြီးမြောက်ခဲ့ပါသည်။
ပလပ်ဖောင်း- Illumina NovaSeq ပလပ်ဖောင်း
စာကြည့်တိုက်အမျိုးအစား- ATAC-seq
အကြံပြုထားသည့် ဒေတာအထွက်- ≥20M ဖတ်သည်။
နမူနာအမျိုးအစား- တစ်ရှူးများ၊ သက်ရှိဆဲလ်များ သို့မဟုတ် အေးခဲထားသောဆဲလ်များ စသည်တို့ဖြစ်သည်။
ဆဲလ်နံပါတ်- ≥ 5×105ဆဲလ်များ၊ တိကျသောဆဲလ်နံပါတ်သည် စမ်းသပ်မှုအောင်မြင်ရန် သော့ချက်ဖြစ်သည်။
တစ်ရှူးအလေးချိန်: ≥ 200mg လတ်ဆတ်သောတစ်ရှူး;
သွေး: ≥ 2 mL
1.ATAC ရှိ အပူမြေပုံသည် TSS နှင့် ကပ်လျက် ဒေသများတွင် ဖြန့်ဖြူးမှုကို ဖတ်သည် (±3 kb)
2. မတူညီသော genome အစိတ်အပိုင်းများတွင် open chromatin ဒေသကို ဖြန့်ဝေခြင်း။
3. အုပ်စုများအကြား ကွဲပြားသော အထွတ်အထိပ်ခေါ်ဆိုမှု