-
Sekwenzar ta 'mRNA ta' tul sħiħ-Nanopore
Is-sekwenzjar tal-RNA kien għodda imprezzabbli għal analiżi komprensiva tat-traskriptome.Bla dubju, is-sekwenzjar tradizzjonali tal-qari qasir kiseb ħafna żvilupp importanti hawn.Madankollu, ħafna drabi tiltaqa 'ma' limitazzjonijiet fl-identifikazzjonijiet tal-isoformi fit-tul sħiħ, il-kwantifikazzjoni, il-preġudizzju tal-PCR.
Is-sekwenzjar tan-Nanopore jiddistingwi ruħu minn pjattaformi oħra ta 'sekwenzjar, peress li n-nukleotidi jinqraw direttament mingħajr sintesi tad-DNA u jiġġenera qari fit-tul f'għexieren ta' kilobases.Dan jagħti s-setgħa lill-qari dirett li jaqsam traskrizzjonijiet full-length u li jindirizza l-isfidi fi studji fil-livell tal-isoforma.
Pjattaforma：Nanopore PromethION
Librerija:cDNA-PCR
-
De novo Sekwenzar tat-Traskriptome ta' tul sħiħ -PacBio
De novosekwenzar tat-traskriptome full-length, magħruf ukoll bħalaDe novoIso-Seq jieħu l-vantaġġi tas-sekwenzar PacBio fit-tul tal-qari, li jippermetti sekwenzar ta 'molekuli ta' cDNA full-length mingħajr ebda waqfien.Dan jevita kompletament kwalunkwe żball iġġenerat fil-passi tal-assemblaġġ tat-traskrizzjoni u jibni settijiet unigene b'riżoluzzjoni fil-livell tal-isoforma.Dan is-settijiet unigene jipprovdi informazzjoni ġenetika qawwija bħala "ġenoma ta 'referenza" fil-livell tat-traskriptome.Barra minn hekk, flimkien mad-dejta tas-sekwenzjar tal-ġenerazzjoni li jmiss, dan is-servizz jagħti s-setgħa kwantifikazzjoni preċiża tal-espressjoni fil-livell tal-isoforma.
Pjattaforma: PacBio Sequel IILibrerija: Librerija tal-qanpiena SMRT -
Sekwenzar tal-mRNA ewkarjotiku-Illumina
Is-sekwenzjar tal-mRNA jippermetti profil tal-mRNAs kollha traskritti miċ-ċelloli taħt kundizzjonijiet speċifiċi.Hija teknoloġija qawwija biex tiżvela l-profil tal-espressjoni tal-ġeni, l-istrutturi tal-ġeni u l-mekkaniżmi molekulari ta 'ċerti proċessi bijoloġiċi.Sal-lum, is-sekwenzjar tal-mRNA ġie użat ħafna fir-riċerka fundamentali, id-dijanjostika klinika, l-iżvilupp tad-droga, eċċ.
Pjattaforma: Illumina NovaSeq 6000
-
Sekwenzar tal-mRNA mhux ibbażat fuq Referenza-Illumina
Is-sekwenzjar ta 'mRNA jadotta teknika ta' sekwenzar tal-ġenerazzjoni li jmiss (NGS) biex jaqbad il-messaġġier RNA (mRNA) forma Eukaryote f'perjodu speċifiku li xi funzjonijiet speċjali qed jattivaw.L-itwal traskrizzjoni spliced kienet imsejħa 'Unigene' u użata bħala s-sekwenza ta 'referenza għall-analiżi sussegwenti, li hija mezz effettiv biex jiġi studjat il-mekkaniżmu molekulari u n-netwerk regolatorju tal-ispeċi mingħajr referenza.
Wara l-assemblaġġ tad-dejta tat-traskriptome u l-annotazzjoni funzjonali unigene
(1)Analiżi SNP, analiżi SSR, tbassir CDS u struttura tal-ġeni se jiġu preformati.
(2) Se titwettaq kwantifikazzjoni ta 'espressjoni unigene f'kull kampjun.
(3) Unigenes espressi b'mod differenzjali bejn kampjuni (jew gruppi) se jiġu skoperti bbażati fuq espressjoni unigene
(4)Se jsiru gruppi, annotazzjoni funzjonali u analiżi ta' arrikkiment ta' unigenes espressi b'mod differenzjali
-
Sekwenzar twil mhux ta 'kodifikazzjoni-Illumina
RNAs twal mhux kodifikanti (lncRNAs) huma tip ta 'molekuli RNA b'tul li jaqbeż il-200 nt, li huma kkaratterizzati minn potenzjal ta' kodifikazzjoni estremament baxx.LncRNA, bħala membru ewlieni fl-RNAs li ma jikkodifikawx, jinsab prinċipalment fin-nukleu u fil-plażma.L-iżvilupp fit-teknoloġija tas-sekwenzjar u l-bijoinformatika jippermetti l-identifikazzjoni ta 'lncRNAs ġodda numerużi u jassoċja dawk ma' funzjonijiet bijoloġiċi.Evidenzi akkumulattivi jissuġġerixxu li lncRNA huwa involut b'mod wiesa 'f'regolazzjoni epiġenetika, regolazzjoni ta' traskrizzjoni u regolazzjoni ta 'wara t-traskrizzjoni.
-
Sekwenzar ta 'RNA żgħir-Illumina
RNA żgħir tirreferi għal klassi ta 'molekuli RNA li ma jikkodifikawx li huma ġeneralment inqas minn 200nt fit-tul, inkluż mikro RNA (miRNA), RNA ta' interferenza żgħira (siRNA), u RNA ta 'interazzjoni piwi (piRNA).
MicroRNA (miRNA) hija klassi ta 'RNA żgħir endoġenu b'tul ta' madwar 20-24nt, li għandu varjetà ta 'rwoli regolatorji importanti fiċ-ċelloli.miRNA involut f'ħafna proċessi tal-ħajja li jiżvelaw tessut – speċifiku u stadju – espressjoni speċifika u kkonservat ħafna fi speċi differenti.
-
circRNA sekwenzar-Illumina
Is-sekwenzjar tat-traskriptome sħiħ huwa ddisinjat biex jipproteġi kull tip ta' molekuli RNA, inklużi RNAs kodifikanti (mRNA) u mhux kodifikanti (inklużi lncRNA, circRNA u miRNA) li huma traskritti minn ċelloli speċifiċi f'ċertu ħin.Is-sekwenzjar tat-transcriptome sħiħ, magħruf ukoll bħala "sekwenzjar tal-RNA totali" għandu l-għan li jiżvela netwerks regolatorji komprensivi fil-livell tat-traskriptome.Filwaqt li tieħu vantaġġ mit-teknoloġija NGS, sekwenzi ta 'prodotti tat-traskriptome sħaħ huma disponibbli għall-analiżi ceRNA u analiżi konġunta tal-RNA, li tipprovdi l-ewwel pass lejn karatterizzazzjoni funzjonali.Tiżvela netwerk regolatorju ta 'ceRNA ibbażat fuq circRNA-miRNA-mRNA.
-
Sekwenzar tat-traskriptome kollu – Illumina
Is-sekwenzjar tat-traskriptome sħiħ huwa ddisinjat biex jipproteġi kull tip ta' molekuli RNA, inklużi RNAs kodifikanti (mRNA) u mhux kodifikanti (inklużi lncRNA, circRNA u miRNA) li huma traskritti minn ċelloli speċifiċi f'ċertu ħin.Is-sekwenzjar tat-transcriptome sħiħ, magħruf ukoll bħala "sekwenzjar tal-RNA totali" għandu l-għan li jiżvela netwerks regolatorji komprensivi fil-livell tat-traskriptome.Filwaqt li tieħu vantaġġ mit-teknoloġija NGS, sekwenzi ta 'prodotti tat-traskriptome sħaħ huma disponibbli għall-analiżi ceRNA u analiżi konġunta tal-RNA, li tipprovdi l-ewwel pass lejn karatterizzazzjoni funzjonali.Tiżvela netwerk regolatorju ta 'ceRNA ibbażat fuq circRNA-miRNA-mRNA.
-
Sekwenzar ta' RNA prokarjotiku
Is-sekwenzjar tal-RNA prokarjotiku juża sekwenzar tal-ġenerazzjoni li jmiss (NGS) biex jiżvela l-preżenza u l-kwantità ta 'RNA f'mument partikolari, billi janalizza t-traskriptoma ċellulari li qed jinbidel.Is-sekwenzjar tal-RNA prokarjotiku tal-kumpanija tagħna, jimmira speċifikament lejn prokarjoti b'ġenomi ta 'referenza, li jipprovdilek profili tat-traskriptome, analiżi tal-istruttura tal-ġeni, eċċ. Ġie applikat b'mod wiesa' għar-riċerka xjentifika bażika, riċerka u żvilupp tad-droga, u aktar.
Pjattaforma: Illumina NovaSeq 6000
-
Is-Sekwenzar tal-Metatranscriptome
Is-sekwenzjar tal-metatranscriptome jidentifika l-espressjoni tal-ġeni tal-mikrobi (kemm ewkarjoti kif ukoll prokarjoti) f'ambjenti naturali (jiġifieri ħamrija, ilma, baħar, ħmieġ, u musrana.). Speċifikament, dan is-servizz jippermettilek tikseb profili tal-espressjoni tal-ġeni kollha ta' komunitajiet mikrobjali kumplessi, analiżi tassonomika. ta 'speċi, analiżi ta' arrikkiment funzjonali ta 'ġeni espressi b'mod differenti, u aktar.
Pjattaforma: Illumina NovaSeq 6000
