● Għażla tad-daqs tal-RNA qabel il-preparazzjoni tal-librerija
● Analiżi bijoinformatika ċċentrata madwar tbassir tal-miRNA u l-miri tagħhom
●Analiżi komprensiva tal-bijoinformatika:li tippermetti l-identifikazzjoni ta' miRNAs kemm magħrufa kif ukoll ġodda, identifikazzjoni ta' miri ta' miRNAs u annotazzjoni funzjonali korrispondenti u arrikkiment b'databases multipli (KEGG, GO)
●Kontroll Riguż tal-Kwalità: nimplimentaw punti ta' kontroll ewlenin fl-istadji kollha, mill-preparazzjoni tal-kampjuni u tal-libreriji sas-sekwenzjar u l-bijoinformatika.Dan il-monitoraġġ metikoluż jiżgura l-kunsinna ta' riżultati ta' kwalità għolja b'mod konsistenti.
●Appoġġ wara l-Bejgħ: L-impenn tagħna jestendi lil hinn mit-tlestija tal-proġett b'perjodu ta 'servizz ta' wara l-bejgħ ta '3 xhur.Matul dan iż-żmien, noffru segwitu tal-proġett, assistenza għas-soluzzjoni tal-problemi, u sessjonijiet ta’ Q&A biex nindirizzaw kwalunkwe mistoqsija relatata mar-riżultati.
●Kompetenza estensiva: b'rekord ta 'suċċess ta' għeluq fuq proġetti sRNA multipli li jkopru aktar minn 100 speċi f'diversi oqsma ta 'riċerka, it-tim tagħna jġib rikkezza ta' esperjenza għal kull proġett.
Librerija | Pjattaforma | Dejta rakkomandata | Data QC |
Daqs magħżul | Illumina SE50 | 10M-20M jaqra | Q30≥85% |
Nukleotidi:
Konċ.(ng/μl) | Ammont (μg) | Purità | Integrità |
≥ 80 | ≥ 0.5 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 Kontaminazzjoni limitata jew l-ebda proteina jew DNA murija fuq il-ġel. | RIN≥6.5; 5.0≥28S/18S≥1.0; elevazzjoni tal-linja bażi limitata jew l-ebda |
● Pjanti:
Għeruq, Zokk jew Petali: 450 mg
Weraq jew Żerriegħa: 300 mg
Frott: 1.2 g
● Annimali:
Qalb jew Imsaren: 450 mg
Vixxri jew Moħħ: 240 mg
Muskolu: 600 mg
Għadam, Xagħar jew Ġilda: 1.5g
● Artropodi:
Insetti: 9g
Krustaċji: 450 mg
● Demm sħiħ: 2 tubi
● Ċelloli: 106 ċelloli
● Serum u Plażma:6 mL
Kontenitur:
Tubu taċ-ċentrifuga ta' 2 ml (Fojl tal-landa mhux rakkomandat)
Tikkettjar tal-kampjun: Grupp+replika eż. A1, A2, A3;B1, B2, B3... ...
Konsenja:
1.Dry-silġ: Il-kampjuni jeħtieġ li jiġu ppakkjati f'boroż u midfuna fis-silġ niexef.
2. Tubi RNAstable: kampjuni RNA jistgħu jitnixxfu f'tubu ta 'stabbilizzazzjoni RNA (eż. RNAstable®) u jintbagħtu f'temperatura tal-kamra.
Bijoinformatika
Identifikazzjoni ta 'miRNA: struttura u fond
Espressjoni differenzjali ta 'miRNA - raggruppament ġerarkiku
Annotazzjoni funzjonali tal-mira ta 'miRNAs espressi b'mod differenzjali
Esplora l-avvanzi tar-riċerka ffaċilitati mis-servizzi ta’ sekwenzar tal-sRNA ta’ BMKGene permezz ta’ ġabra ta’ pubblikazzjonijiet ikkurata.
Chen, H. et al.(2023) 'L-infezzjonijiet virali jinibixxu l-bijosintesi u l-fotosintesi tas-saponin f'Panax notoginseng', Plant Physiology and Biochemistry, 203, p.108038. doi: 10.1016/J.PLAPHY.2023.108038.
Li, H. et al.(2023) "Il-proteina FREE1 li fiha d-dominju tal-pjanti FYVE jassoċja ma 'komponenti ta' mikroproċessur biex tirrażżan il-bijoġenesi tal-miRNA", rapporti EMBO, 24 (1).doi: 10.15252/EMBR.202255037/SUPPL_FILE/EMBR202255037-SUP-0004-SDATAFIG4.TIF.
Yu, J. et al.(2023) "Il-MicroRNA Ame-Bantam-3p Jikkontrolla l-Iżvilupp Pupali tal-Larva billi Jimmira l-Dominji Multipli li jixbħu Fattur ta' Tkabbir Epidermali 8 Gene (megf8) fin-naħal, Apis mellifera", Ġurnal Internazzjonali tax-Xjenzi Molekulari, 24 (6), p. .5726. doi: 10.3390/IJMS24065726/S1.
Zhang, M. et al.(2018) 'Analiżi Integrata ta' MiRNA u Ġeni Assoċjati mal-Kwalità tal-Laħam Tiżvela li Gga-MiR-140-5p Taffettwa d-Depożizzjoni tax-Xaħam Intramuskolari fit-Tiġieġ', Fiżjoloġija Ċellulari u Bijokimika, 46 (6), pp. 2421–2433.doi: 10.1159/000489649.