-
Sekwenzar tal-Immunopreċipitazzjoni tal-Kromatina (ChIP-seq)
ChIP-Seq jipprovdi profili madwar il-ġenoma tal-miri tad-DNA għall-modifika tal-histone, fatturi ta 'traskrizzjoni, u proteini oħra assoċjati mad-DNA.Jikkombina s-selettività tal-immuno-preċipitazzjoni tal-kromatin (ChIP) biex tirkupra kumplessi speċifiċi ta 'proteina-DNA, bil-qawwa tas-sekwenzjar tal-ġenerazzjoni li jmiss (NGS) għal sekwenzar ta' produzzjoni għolja tad-DNA rkuprat.Barra minn hekk, minħabba li l-kumplessi proteina-DNA jiġu rkuprati minn ċelloli ħajjin, is-siti ta 'rbit jistgħu jitqabblu f'tipi ta' ċelluli u tessuti differenti, jew taħt kundizzjonijiet differenti.L-applikazzjonijiet ivarjaw minn regolamentazzjoni tat-traskrizzjoni għal mogħdijiet ta 'żvilupp għal mekkaniżmi ta' mard u lil hinn.
Pjattaforma: Pjattaforma Illumina NovaSeq
-
Sekwenzar Metagenomic -NGS
Metagenome jirreferi għal ġabra ta 'materjal ġenetiku totali ta' komunità mħallta ta 'organiżmi, bħal metaġenomu ambjentali, metaġenomu uman, eċċ. Fih ġenomi ta' mikro-organiżmi kemm kultivabbli kif ukoll mhux kultivabbli.Is-sekwenzjar metaġenomika hija għodda molekulari użata biex tanalizza l-materjali ġenomiċi mħallta estratti minn kampjuni ambjentali, li tipprovdi informazzjoni dettaljata fid-diversità u l-abbundanza tal-ispeċi, l-istruttura tal-popolazzjoni, ir-relazzjoni filoġenetika, il-ġeni funzjonali u n-netwerk ta 'korrelazzjoni ma' fatturi ambjentali.
Pjattaforma:Pjattaforma Illumina NovaSeq
-
Sekwenzar Metagenomic-Nanopore
Metagenomics hija għodda molekulari użata biex tanalizza l-materjali ġenomiċi mħallta estratti minn kampjuni ambjentali, li tipprovdi informazzjoni dettaljata fid-diversità u l-abbundanza tal-ispeċi, l-istruttura tal-popolazzjoni, ir-relazzjoni filoġenetika, il-ġeni funzjonali u n-netwerk ta 'korrelazzjoni ma' fatturi ambjentali, eċċ. Pjattaformi ta 'sekwenzjar ta' Nanopore introduċew dan l-aħħar għal studji metaġenomika.Il-prestazzjoni eċċellenti tagħha fit-tul tal-qari tejbet fil-biċċa l-kbira l-analiżi metaġenomika downstream, speċjalment l-assemblaġġ tal-metaġenomu.Filwaqt li tieħu vantaġġi ta 'qari-tul, studju metagenomic ibbażat fuq Nanopore huwa kapaċi jikseb assemblaġġ aktar kontinwu meta mqabbel ma' metagenomics shot-gun.Ġie ppubblikat li l-metaġenomika bbażata fuq Nanopore ġġenerat b'suċċess ġenomi batteriċi kompluti u magħluqa minn mikrobijomi (Moss, EL, et. al,Natura Biotech, 2020)
Pjattaforma:Nanopore PromethION P48
-
Sekwenzar bisulfit tal-ġenoma kollu
Il-metilazzjoni tad-DNA fil-ħames pożizzjoni fiċ-ċitosina (5-mC) għandha influwenza fundamentali fuq l-espressjoni tal-ġeni u l-attività ċellulari.Mudelli anormali ta 'metilazzjoni ġew assoċjati ma' bosta kundizzjonijiet u mard, bħall-kanċer.WGBS sar l-istandard tad-deheb għall-istudju tal-metilazzjoni mal-ġenoma kollu f'riżoluzzjoni bażi waħda.
Pjattaforma: Pjattaforma Illumina NovaSeq
-
Assaġġ għall-Kromatin Aċċessibbli għat-Transposase b'Sekwenzar ta' Throughput Għoli (ATAC-seq)
ATAC-seq huwa metodu ta 'sekwenzjar ta' produzzjoni għolja għall-analiżi tal-aċċessibbiltà tal-kromatina mal-ġenoma kollu, li huwa importanti għall-kontroll epiġenetiku globali tal-espressjoni tal-ġeni.L-adapters tas-sekwenzjar huma mdaħħla f'reġjuni tal-kromatina miftuħa permezz tat-transposase Tn5 iperattiva.Wara l-amplifikazzjoni tal-PCR, tinbena librerija tas-sekwenzjar.Ir-reġjuni miftuħa kollha tal-kromatin jistgħu jinkisbu taħt kundizzjoni speċifika ta 'spazju-ħin, mhux biss limitati għas-siti ta' rbit ta 'fattur ta' traskrizzjoni, jew ċertu reġjun modifikat ta 'histone.
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-PacBio
Is-subunità fuq 16S u 18S rRNA li fiha kemm reġjuni kkonservati ħafna kif ukoll iper-varjabbli hija marka tas-swaba' molekulari perfetta għall-identifikazzjoni ta 'organiżmi prokarjotiċi u ewkarjotiċi.Filwaqt li jieħdu vantaġġ mis-sekwenzjar, dawn l-amplicons jistgħu jiġu mmirati bbażati fuq il-partijiet konservati u r-reġjuni iper-varjabbli jistgħu jiġu kkaratterizzati bis-sħiħ għall-identifikazzjoni tal-mikrobi li jikkontribwixxu għal studji li jkopru analiżi tad-diversità tal-mikrobi, tassonomija, filoġenija, eċċ. Molekula waħda f'ħin reali (SMRT). ) is-sekwenzjar tal-pjattaforma PacBio jippermetti l-kisba ta' qari twal preċiżi ħafna, li jistgħu jkopru amplicons full-length (madwar 1.5 Kb).Il-fehma wiesgħa tal-qasam ġenetiku tejbet ħafna r-riżoluzzjoni fl-annotazzjoni tal-ispeċi fil-komunità tal-batterji jew tal-fungi.
Pjattaforma:PacBio Sequel II
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-NGS
Is-sekwenzjar tal-amplikon 16S/18S/ITS għandu l-għan li jiżvela l-filoġenija, it-tassonomija u l-abbundanza tal-ispeċi f'komunità mikrobjali billi jinvestiga prodotti tal-PCR ta 'markaturi ġenetiċi ta' manutenzjoni li fihom partijiet kemm konversati ħafna kif ukoll ipervarjabbli.L-introduzzjoni ta 'dawn il-marki tas-swaba' molekulari perfetti minn Woeses et al, (1977) tagħti s-setgħa lill-profiling tal-mikrobijoma mingħajr iżolament.Is-sekwenzjar ta '16S (batterji), 18S (fungi) u spacer traskritt Intern (ITS, fungi) jippermetti l-identifikazzjoni ta' kemm speċi abbundanti kif ukoll speċi rari u mhux identifikati.Din it-teknoloġija qed issir għodda applikata b'mod wiesa 'u maġġuri fl-identifikazzjoni tal-kompożizzjoni mikrobjali differenzjali f'diversi ambjenti, bħal ħalq tal-bniedem, imsaren, ħmieġ, eċċ.
Pjattaforma:Pjattaforma Illumina NovaSeq
-
Sekwenzar mill-ġdid tal-Ġenoma Sħiħ Batterjali u Fungali
Is-sekwenzjar mill-ġdid tal-ġenoma sħiħ batterjali u fungali huwa għodda kritika biex jitlestew il-ġenomi ta 'batterji u fungi magħrufa, kif ukoll biex jitqabblu ġenomi multipli jew biex jiġu mmappjati ġenomi ta' organiżmi ġodda.Huwa ta 'importanza kbira li jiġu sekwenzati ġenomi sħaħ ta' batterju u fungi sabiex jiġu ġġenerati ġenomi ta 'referenza preċiżi, biex isiru identifikazzjoni mikrobjali u studji komparattivi oħra tal-ġenoma.
Pjattaforma: Pjattaforma Illumina NovaSeq
-
PacBio-Full-length 16S/18S/ITS Amplicon Sequencing
Pjattaforma Amplicon (16S/18S/ITS) hija żviluppata b'snin ta 'esperjenza fl-analiżi tal-proġett tad-diversità tal-mikrobi, li fiha analiżi bażika standardizzata u analiżi personalizzata: analiżi bażika tkopri l-kontenut tal-analiżi mainstream tar-riċerka mikrobjali attwali, il-kontenut tal-analiżi huwa għani u komprensiv, u r-riżultati tal-analiżi huma ppreżentati fil-forma ta’ rapporti ta’ proġetti;Il-kontenut tal-analiżi personalizzata huwa divers.Jistgħu jintgħażlu kampjuni u l-parametri jistgħu jiġu stabbiliti b'mod flessibbli skont ir-rapport bażiku tal-analiżi u l-iskop tar-riċerka, biex jiġu realizzati rekwiżiti personalizzati.Sistema operattiva Windows, sempliċi u veloċi.
-
PacBio-Transcriptome ta' tul sħiħ (Mhux Referenza)
Filwaqt li d-data tas-sekwenzjar tal-Isoform tal-Pacific Biosciences (PacBio) bħala input, din l-App hija kapaċi tidentifika sekwenzi ta 'traskrizzjoni ta' tul sħiħ (mingħajr assemblaġġ).Bl-immappjar ta 'sekwenzi ta' tul sħiħ kontra ġenoma ta 'referenza, traskrizzjonijiet jistgħu jiġu ottimizzati minn ġeni magħrufa, traskrizzjonijiet, reġjuni ta' kodifikazzjoni, eċċ. F'dan il-każ, tista 'tinkiseb identifikazzjoni aktar preċiża ta' strutturi mRNA, bħal splicing alternattiv, eċċ.Analiżi konġunta mad-dejta tas-sekwenzjar tat-traskriptome NGS tippermetti annotazzjoni aktar komprensiva u kwantifikazzjoni aktar preċiża fl-espressjoni fil-livell tat-traskrizzjoni, li ħafna tibbenefika l-espressjoni differenzjali downstream u l-analiżi funzjonali.
-
Sekwenzar tal-Bisulfite b'Rappreżentanza Mnaqqsa (RRBS)
Ir-riċerka dwar il-metilazzjoni tad-DNA dejjem kienet suġġett jaħraq fir-riċerka tal-mard, u hija relatata mill-qrib mal-espressjoni tal-ġeni u l-karatteristiċi fenotipiċi.RRBS huwa metodu preċiż, effiċjenti u ekonomiku għar-riċerka tal-metilazzjoni tad-DNA.L-arrikkiment tar-reġjuni tal-gżejjer promotur u CpG permezz ta 'qsim enżimatiku (Msp I), flimkien ma' sekwenzar tal-Bisulfite, jipprovdi skoperta ta 'metilazzjoni tad-DNA b'riżoluzzjoni għolja.
Pjattaforma: Pjattaforma Illumina NovaSeq
-
Sekwenzar ta' mRNA prokarjotiku
Is-sekwenzjar tal-mRNA jagħti s-setgħa lill-profiling komprensiv tat-traskrizzjonijiet kollha tal-mRNA fi ħdan iċ-ċelloli taħt kundizzjonijiet speċifiċi.Din it-teknoloġija avvanzata sservi bħala għodda qawwija, li tikxef profili kkomplikati ta 'espressjoni tal-ġeni, strutturi tal-ġeni, u mekkaniżmi molekulari assoċjati ma' proċessi bijoloġiċi diversi.Adottat ħafna fir-riċerka fundamentali, id-dijanjostika klinika, u l-iżvilupp tad-droga, is-sekwenzjar tal-mRNA joffri għarfien dwar l-intricacies tad-dinamika ċellulari u r-regolamentazzjoni ġenetika.L-ipproċessar tal-kampjun tal-mRNA prokarjotiku tagħna huwa mfassal għal traskriptomi prokarjotiċi, li jinvolvi t-tnaqqis tal-rRNA u l-preparazzjoni tal-librerija direzzjonali.
Pjattaforma: Illumina NovaSeq X
