-
Sekwenzar ta' RNA b'nukleu wieħed
L-avvanz fil-qbid ta’ ċellula waħda u t-teknika ta’ kostruzzjoni ta’ librerija individwali li tgħaqqad ma’ sekwenzar ta’ produttività għolja tippermetti studji dwar l-espressjoni tal-ġeni fuq bażi ta’ ċellula b’ċellula.Jippermetti analiżi tas-sistema aktar profonda u kompluta fuq popolazzjonijiet ta 'ċelluli kumplessi, li fiha fil-biċċa l-kbira tevita l-maskra tal-eteroġeneità tagħhom billi tieħu medja taċ-ċelloli kollha.
Madankollu, xi ċelluli mhumiex adattati biex isiru f'sospensjoni ta 'ċellula waħda, għalhekk metodi oħra ta' preparazzjoni ta 'kampjuni - hija meħtieġa estrazzjoni tan-nukleu mit-tessuti, jiġifieri, nukleu jiġi estratt direttament minn tessuti jew ċellula u ppreparat f'sospensjoni ta' nukleu wieħed għal nukleu wieħed. sekwenzar taċ-ċelluli.
BMK jipprovdi servizz ta' sekwenzar ta' RNA b'ċellula waħda bbażat fuq 10 × Genomics Chromium TM.Dan is-servizz intuża ħafna fi studji dwar studji relatati mal-mard, bħad-divrenzjar taċ-ċelluli immuni, l-eteroġeneità tat-tumur, l-iżvilupp tat-tessuti, eċċ.
Ċippa tat-traskriptome spazjali: 10 × Genomics
Pjattaforma: Pjattaforma Illumina NovaSeq
-
Sekwenzar tal-Ġenoma Sħiħ tal-Pjanti/Annimali
Is-sekwenzjar mill-ġdid tal-ġenoma kollu, magħruf ukoll bħala WGS, jippermetti l-iżvelar ta’ mutazzjonijiet kemm komuni kif ukoll rari fuq il-ġenoma kollu inkluż Polimorfiżmu Nukleotidu Uniku (SNP), Tħassir tal-Inserzjoni (InDel), Varjazzjoni tal-Istruttura (SV), u Varjazzjoni tan-Numru Kopja (CNV). ).L-SVs jiffurmaw porzjon akbar tal-bażi tal-varjazzjoni mill-SNPs u għandhom impatt akbar fuq il-ġenoma, li għandu effett sinifikanti fuq organiżmi ħajjin.Is-sekwenzi mill-ġdid tal-qari fit-tul jippermetti identifikazzjoni aktar preċiża ta 'frammenti kbar u varjazzjonijiet ikkumplikati minħabba li qari fit-tul jagħmluha ħafna aktar faċli għall-qsim tal-kromożomi fuq reġjuni kkumplikati bħal ripetizzjonijiet tandem, reġjuni b'ħafna GC/AT, u reġjuni iper-varjabbli.
Pjattaforma: Illumina, PacBio, Nanopore
-
BMKMANU S1000 Spazjali Transcriptome
It-traskriptomika spazjali tinsab minn ta' quddiem fl-innovazzjoni xjentifika, u tagħti s-setgħa lir-riċerkaturi biex jidħlu f'mudelli kkomplikati ta' espressjoni tal-ġeni fi ħdan it-tessuti filwaqt li jippreservaw il-kuntest spazjali tagħhom.Fost diversi pjattaformi, BMKGene żviluppa l-BMKManu S1000 Spatial Transcriptome Chip, li tiftaħarriżoluzzjoni mtejbata' 5µM, tilħaq il-medda subċellulari, u tippermettisettings ta' riżoluzzjoni f'diversi livelli.Iċ-ċippa S1000, li fiha madwar 2 miljun spots, timpjega microwells b'saffi bi żibeġ mgħobbija b'sondi tal-qbid spazjalment barcoded.Librerija cDNA, arrikkita b'barcodes spazjali, hija ppreparata miċ-ċippa S1000 u sussegwentement sekwenzata fuq il-pjattaforma Illumina NovaSeq.Il-kombinazzjoni ta 'kampjuni spazjalment barcoded u UMIs tiżgura l-eżattezza u l-ispeċifiċità tad-dejta ġġenerata.L-attribut uniku taċ-ċippa BMKManu S1000 jinsab fil-versatilità tiegħu, li joffri settings ta 'riżoluzzjoni f'diversi livelli li jistgħu jiġu sintonizzati b'mod fin għal tessuti u livelli ta' dettall differenti.Din l-adattabilità tpoġġi ċ-ċippa bħala għażla eċċellenti għal studji tat-traskriptomika spazjali diversi, li tiżgura raggruppament spazjali preċiż b'ħoss minimu.
Bl-użu taċ-ċippa BMKManu S1000 u teknoloġiji oħra tat-traskriptomika spazjali, ir-riċerkaturi jistgħu jiksbu fehim aħjar tal-organizzazzjoni spazjali taċ-ċelloli u l-interazzjonijiet molekulari kumplessi li jseħħu fit-tessuti, u jipprovdu għarfien imprezzabbli dwar il-mekkaniżmi sottostanti proċessi bijoloġiċi f'firxa wiesgħa ta 'oqsma, inklużi onkoloġija, newroxjenza, bijoloġija tal-iżvilupp, immunoloġija u studji botaniċi.
Pjattaforma: ċippa BMKManu S1000 u Illumina NovaSeq
-
10x Genomics Visium Spatial Transcriptome
It-traskriptomika spazjali hija teknoloġija avvanzata li tippermetti lir-riċerkaturi jinvestigaw il-mudelli tal-espressjoni tal-ġeni fi ħdan it-tessuti filwaqt li jippreservaw il-kuntest spazjali tagħhom.Pjattaforma waħda b'saħħitha f'dan id-dominju hija 10x Genomics Visium flimkien mas-sekwenzjar Illumina.Il-prinċipju ta '10X Visium jinsab fuq ċippa speċjalizzata b'żona ta' qbid magħżula fejn jitqiegħdu sezzjonijiet tat-tessuti.Din iż-żona tal-qbid fiha spots bil-barcode, kull wieħed jikkorrispondi għal post spazjali uniku fit-tessut.Il-molekuli ta 'RNA maqbuda mit-tessut imbagħad jiġu ttikkettjati b'identifikaturi molekulari uniċi (UMIs) matul il-proċess ta' traskrizzjoni inversa.Dawn il-barcode spots u l-UMIs jippermettu mapping spazjali preċiż u kwantifikazzjoni tal-espressjoni tal-ġeni f'riżoluzzjoni ta 'ċellula waħda.Il-kombinazzjoni ta 'kampjuni spazjalment barcoded u UMIs tiżgura l-eżattezza u l-ispeċifiċità tad-dejta ġġenerata.Billi jużaw din it-teknoloġija Spatial Transcriptomics, ir-riċerkaturi jistgħu jiksbu fehim aktar profond tal-organizzazzjoni spazjali taċ-ċelloli u l-interazzjonijiet molekulari kumplessi li jseħħu fit-tessuti, u joffru għarfien imprezzabbli dwar il-mekkaniżmi sottostanti proċessi bijoloġiċi f'diversi oqsma, inklużi l-onkoloġija, newroxjenza, bijoloġija tal-iżvilupp, immunoloġija. , u studji botaniċi.
Pjattaforma: 10X Genomics Visium u Illumina NovaSeq
-
Sekwenzar ta' mRNA ta' tul sħiħ-Nanopore
Filwaqt li s-sekwenzjar tal-mRNA bbażat fuq NGS iservi bħala għodda versatili għall-kwantifikazzjoni tal-espressjoni tal-ġeni, id-dipendenza tagħha fuq qari qosra tirrestrinġi l-effikaċja tagħha f'analiżi transcriptomic kumplessa.Is-sekwenzjar tan-Nanopore, min-naħa l-oħra, juża teknoloġija ta 'qari fit-tul, li jippermetti s-sekwenzjar ta' traskrizzjonijiet tal-mRNA full-length.Dan l-approċċ jiffaċilita esplorazzjoni komprensiva ta 'splicing alternattiv, fużjonijiet tal-ġeni, poly-adenylation, u l-kwantifikazzjoni ta' isoforms ta 'mRNA.
Is-sekwenzjar tan-nanopori jiddependi fuq sinjali elettriċi f'ħin reali b'molekula waħda tan-nanopori.Iggwidat minn proteini tal-muturi, id-DNA double-stranded jeħel ma 'proteini nanopori inkorporati f'bijofilm, jinħall hekk kif jgħaddi mill-kanal tan-nanopori taħt differenza ta' vultaġġ.Is-sinjali elettriċi distintivi ġġenerati minn bażijiet differenti fuq il-linja tad-DNA huma skoperti u kklassifikati f'ħin reali, u jiffaċilitaw is-sekwenzjar tan-nukleotidi preċiż u kontinwu.Dan l-approċċ innovattiv jegħleb il-limitazzjonijiet tal-qari fil-qosor u jipprovdi pjattaforma dinamika għal analiżi ġenomika kkomplikata, jinkludi studji traskrittomiċi kumplessi.
Pjattaforma: Nanopore Promethion P48
-
Sekwenzar ta 'mRNA ta' tul sħiħ -PacBio
Filwaqt li s-sekwenzjar tal-mRNA bbażat fuq l-NGS huwa għodda versatili għall-kwantifikazzjoni tal-espressjoni tal-ġeni, id-dipendenza tiegħu fuq qari qosra tirrestrinġi l-użu tiegħu f'analiżi transcriptomic kumplessi.Is-sekwenzjar PacBio (Iso-Seq), min-naħa l-oħra, juża teknoloġija ta 'qari fit-tul, li jippermetti s-sekwenzjar ta' traskrizzjonijiet tal-mRNA full-length.Dan l-approċċ jiffaċilita esplorazzjoni komprensiva ta 'splicing alternattiv, fużjonijiet tal-ġeni u poli-adenilazzjoni għalkemm mhix l-għażla primarja għall-kwantifikazzjoni tal-espressjoni tal-ġeni, minħabba l-ammont għoli ta' dejta meħtieġa.
It-teknoloġija tas-sekwenzjar PacBio tiddependi fuq sekwenzar ta 'molekula waħda, f'ħin reali (SMRT), li tipprovdi vantaġġ distint fil-qbid ta' traskrizzjonijiet tal-mRNA full-length.Dan l-approċċ innovattiv jinvolvi l-użu ta 'waveguides ta' modalità żero (ZMWs), bjar mikrofabbrikati li jippermettu l-osservazzjoni f'ħin reali tal-attività tal-polimerażi tad-DNA waqt is-sekwenzjar.F'dawn iż-ZMWs, id-DNA polymerase ta' PacBio tisintetizza linja komplementari ta' DNA, li tiġġenera qari twal li jkopru t-traskrizzjonijiet tal-mRNA kollha.It-tħaddim ta' PacBio fil-modalità ta' sekwenzar ta' Kunsens Ċirkolari (CCS) ittejjeb il-preċiżjoni billi tissekwenza ripetutament l-istess molekula.Il-qari HiFi iġġenerat għandhom preċiżjoni komparabbli ma 'NGS, li jikkontribwixxu aktar għal analiżi komprensiva u affidabbli ta' karatteristiċi traskrittomiċi kumplessi.Pjattaforma: PacBio Sequel II
-
Sekwenzar tal-mRNA Ewkarjotiku-Illumina
Is-sekwenzjar tal-mRNA jagħti s-setgħa lill-profiling komprensiv tat-traskrizzjonijiet kollha tal-mRNA fi ħdan iċ-ċelloli taħt kundizzjonijiet speċifiċi.Din it-teknoloġija avvanzata sservi bħala għodda qawwija, li tikxef profili kkomplikati ta 'espressjoni tal-ġeni, strutturi tal-ġeni, u mekkaniżmi molekulari assoċjati ma' proċessi bijoloġiċi diversi.Adottat ħafna fir-riċerka fundamentali, id-dijanjostika klinika, u l-iżvilupp tad-droga, is-sekwenzjar tal-mRNA joffri għarfien dwar l-intricacies tad-dinamika ċellulari u r-regolamentazzjoni ġenetika.
Pjattaforma: Illumina NovaSeq X
-
Sekwenzar tal-mRNA-Illumina mhux ibbażat fuq Referenza
Is-sekwenzjar tal-mRNA jagħti s-setgħa lill-profiling komprensiv tat-traskrizzjonijiet kollha tal-mRNA fi ħdan iċ-ċelloli taħt kundizzjonijiet speċifiċi.Din it-teknoloġija avvanzata sservi bħala għodda qawwija, li tikxef profili kkomplikati ta 'espressjoni tal-ġeni, strutturi tal-ġeni, u mekkaniżmi molekulari assoċjati ma' proċessi bijoloġiċi diversi.Adottat ħafna fir-riċerka fundamentali, id-dijanjostika klinika, u l-iżvilupp tad-droga, is-sekwenzjar tal-mRNA joffri għarfien dwar l-intricacies tad-dinamika ċellulari u r-regolamentazzjoni ġenetika.
Pjattaforma: Illumina NovaSeq X
-
Sekwenzar twil mhux ta 'kodifikazzjoni-Illumina
RNAs twal mhux kodifikanti (lncRNAs) huma RNAs itwal minn 200 nukleotide li għandhom potenzjal minimu ta 'kodifikazzjoni u huma elementi pivotali fi ħdan RNA mhux kodifikanti.Misjuba fin-nukleu u ċ-ċitoplasma, dawn l-RNAs għandhom rwoli kruċjali fir-regolamentazzjoni epiġenetika, traskrizzjoni u post-traskrizzjoni, u jenfasizzaw is-sinifikat tagħhom fit-tiswir tal-proċessi ċellulari u molekulari.Is-sekwenzjar tal-LncRNA huwa għodda qawwija fid-divrenzjar taċ-ċelluli, l-ontoġenesi u l-mard tal-Bniedem.
Pjattaforma: Illumina NovaSeq
-
Sekwenzar ta 'RNA żgħir-Illumina
Molekuli żgħar ta 'RNA (sRNA), tipikament taħt 200 nukleotide fit-tul, jinkludu microRNAs (miRNAs), RNAs żgħar li jinterferixxu (siRNAs), u RNAs li jinteraġixxu piwi (piRNAs).Fost dawn, il-miRNAs, twal madwar 20-24 nukleotidi, huma partikolarment notevoli għar-rwoli regolatorji ċentrali tagħhom f'diversi proċessi ċellulari.B'mudelli ta 'espressjoni speċifiċi għat-tessuti u speċifiċi għall-istadju, il-miRNAs juru konservazzjoni għolja fost speċi differenti.
Pjattaforma: Illumina NovaSeq
-
circRNA sekwenzar-Illumina
Is-sekwenzjar ta 'RNA ċirkolari (circRNA-seq) huwa li jipprofila u janalizza RNAs ċirkolari, klassi ta' molekuli RNA li jiffurmaw ċikli magħluqa minħabba avvenimenti ta 'splicing mhux kanoniċi, li jipprovdu dawn l-RNA b'stabbiltà akbar.Filwaqt li xi circRNAs intwerew li jaġixxu bħala sponoż tal-mikroRNA, jissekwestraw microRNAs u jipprevjenuhom milli jirregolaw l-mRNAs fil-mira tagħhom, circRNAs oħra jistgħu jinteraġixxu ma 'proteini, jimmodulaw l-espressjoni tal-ġeni, jew ikollhom rwoli fi proċessi ċellulari.L-analiżi tal-espressjoni circRNA tipprovdi għarfien dwar ir-rwoli regolatorji ta 'dawn il-molekuli u s-sinifikat tagħhom f'diversi proċessi ċellulari, stadji ta' żvilupp, u kundizzjonijiet tal-mard, li jikkontribwixxu għal fehim aktar profond tal-kumplessità tar-regolament tal-RNA fil-kuntest tal-espressjoni tal-ġeni.
-
Sekwenzar tat-traskriptome kollu – Illumina
Is-sekwenzjar tat-traskriptome kollu joffri approċċ komprensiv għall-profiling ta' molekuli RNA diversi, li jinkludi kemm RNAs kodifikanti (mRNA) kif ukoll mhux kodifikanti (lncRNA, circRNA, u miRNA).Din it-teknika taqbad it-traskriptome sħiħ ta 'ċelluli speċifiċi f'mument partikolari, li tippermetti fehim olistiku tal-proċessi ċellulari.Magħruf ukoll bħala "sekwenzjar tal-RNA totali", għandu l-għan li jiżvela netwerks regolatorji kkomplikati fil-livell tat-traskriptome, li jippermettu analiżi fil-fond bħal RNA endoġenu kompetitur (ceRNA) u analiżi konġunta tal-RNA.Dan jimmarka l-pass inizjali lejn karatterizzazzjoni funzjonali, b'mod partikolari fit-tqaxxir tan-netwerks regolatorji li jinvolvu interazzjonijiet ceRNA bbażati fuq circRNA-miRNA-mRNA.
