-
PacBio-Full-length 16S/18S/ITS Amplicon Sequencing
Pjattaforma Amplicon (16S/18S/ITS) hija żviluppata b'snin ta 'esperjenza fl-analiżi tal-proġett tad-diversità tal-mikrobi, li fiha analiżi bażika standardizzata u analiżi personalizzata: analiżi bażika tkopri l-kontenut tal-analiżi mainstream tar-riċerka mikrobjali attwali, il-kontenut tal-analiżi huwa għani u komprensiv, u r-riżultati tal-analiżi huma ppreżentati fil-forma ta’ rapporti ta’ proġetti;Il-kontenut tal-analiżi personalizzata huwa divers.Jistgħu jintgħażlu kampjuni u l-parametri jistgħu jiġu stabbiliti b'mod flessibbli skont ir-rapport bażiku tal-analiżi u l-iskop tar-riċerka, biex jiġu realizzati rekwiżiti personalizzati.Sistema operattiva Windows, sempliċi u veloċi.
-
PacBio-Transcriptome ta' tul sħiħ (Mhux Referenza)
Filwaqt li d-data tas-sekwenzjar tal-Isoform tal-Pacific Biosciences (PacBio) bħala input, din l-App hija kapaċi tidentifika sekwenzi ta 'traskrizzjoni ta' tul sħiħ (mingħajr assemblaġġ).Bl-immappjar ta 'sekwenzi ta' tul sħiħ kontra ġenoma ta 'referenza, traskrizzjonijiet jistgħu jiġu ottimizzati minn ġeni magħrufa, traskrizzjonijiet, reġjuni ta' kodifikazzjoni, eċċ. F'dan il-każ, tista 'tinkiseb identifikazzjoni aktar preċiża ta' strutturi mRNA, bħal splicing alternattiv, eċċ.Analiżi konġunta mad-dejta tas-sekwenzjar tat-traskriptome NGS tippermetti annotazzjoni aktar komprensiva u kwantifikazzjoni aktar preċiża fl-espressjoni fil-livell tat-traskrizzjoni, li ħafna tibbenefika l-espressjoni differenzjali downstream u l-analiżi funzjonali.
-
Settijiet ta' għodda
BMKCloud hija pjattaforma bijoinformatika ewlenija li tipprovdi soluzzjoni one-stop għal programmi ġenomiċi, li hija fdata ħafna minn riċerkaturi f'arena varji inklużi mediċi, agrikoli, ambjentali, eċċ. BMKCloud hija impenjata li tipprovdi servizzi integrati, affidabbli u effiċjenti inklużi pjattaformi u għodod ta' analiżi bijoinformatika , riżorsi tal-kompjuters, database pubblika, korsijiet online bijoinformatiċi, eċċ. BMKCloud għandu diversi għodod bijoinformatiċi użati ta 'spiss li jinkludu annotazzjoni tal-ġeni, għodod ġenetiċi evoluzzjonarji, ncRNA, kontroll tal-kwalità tad-dejta, assemblaġġ, allinjament, estrazzjoni tad-dejta, mutazzjonijiet, statistika, ġeneratur tal-figura, sekwenza analiżi, eċċ.
-
RNA żgħir
RNAs żgħar huma tip ta 'RNA qasir li ma jikkodifikax b'tul medju ta' 18-30 nt, inklużi miRNA, siRNA u piRNA.Dawn l-RNAs żgħar ġew irrappurtati b'mod massiv li huma involuti f'diversi proċessi bijoloġiċi bħal degradazzjoni tal-mRNA, inibizzjoni tat-traduzzjoni, formazzjoni ta' eterokromatina, eċċ. L-analiżi ta' sekwenzar ta' SmallRNA ġiet applikata b'mod wiesa' fi studji dwar l-iżvilupp tal-annimali/pjanti, mard, virus, eċċ. RNA żgħir pjattaforma analiżi sekwenzar tikkonsisti analiżi standard u data mining avvanzati.Fuq il-bażi tad-dejta RNA-seq, analiżi standard tista 'tikseb identifikazzjoni u tbassir ta' miRNA, tbassir tal-ġeni fil-mira tal-miRNA, annotazzjoni u analiżi tal-espressjoni.Analiżi avvanzata tippermetti tfittxija u estrazzjoni miRNA personalizzati, ġenerazzjoni ta 'dijagramma Venn, miRNA u bini ta' netwerk tal-ġeni fil-mira.
-
NGS-WGS (Illumina/BGI)
NGS-WGS hija pjattaforma sħiħa ta 'analiżi ta' sekwenzar mill-ġdid tal-ġenoma, li hija żviluppata fuq il-bażi ta 'esperjenza rikka fit-Teknoloġiji tal-Bijomarker.Din il-pjattaforma faċli biex tużah tippermetti s-sottomissjoni ta 'malajr ta' fluss tax-xogħol ta 'analiżi integrata billi sempliċement tissettja ftit parametru bażiku, li joqgħod għad-dejta tas-sekwenzjar tad-DNA ġġenerata kemm mill-pjattaforma Illumina kif ukoll mill-pjattaforma tas-sekwenzjar BGI.Din il-pjattaforma hija skjerata fuq server tal-kompjuters ta 'prestazzjoni għolja, li jagħti s-setgħa analiżi tad-dejta effiċjenti ħafna fi żmien limitat ħafna.It-tħaffir tad-dejta personalizzat huwa disponibbli fuq il-bażi ta 'analiżi standard, inkluża mistoqsija tal-ġene mutat, disinn tal-primer tal-PCR, eċċ.
-
mRNA(Referenza)
Transcriptome huwa r-rabta bejn l-informazzjoni ġenetika ġenomika u l-proteome tal-funzjoni bijoloġika.Ir-regolamentazzjoni tal-livell ta 'traskrizzjoni hija l-aktar mod ta' regolazzjoni importanti u studjat b'mod wiesa 'ta' organiżmi.Is-sekwenzjar tat-traskriptome jista 'sekwenzja t-traskrizzjoni fi kwalunkwe punt fiż-żmien jew taħt kwalunkwe kundizzjoni, b'riżoluzzjoni preċiża għal nukleotide wieħed. Jista' jirrifletti b'mod dinamiku l-livell ta 'traskrizzjoni tal-ġeni, fl-istess ħin jidentifika u jikkwantifika traskrizzjonijiet rari u normali, u jipprovdi l-informazzjoni strutturali ta' kampjun ta' traskrizzjonijiet speċifiċi.
Fil-preżent, it-teknoloġija tas-sekwenzjar tat-traskriptome intużat ħafna fl-agronomija, il-mediċina u oqsma oħra ta 'riċerka, inklużi r-regolamentazzjoni tal-iżvilupp tal-annimali u tal-pjanti, adattament ambjentali, interazzjoni immuni, lokalizzazzjoni tal-ġeni, evoluzzjoni ġenetika tal-ispeċi u sejbien ta' tumur u mard ġenetiku.
-
Metaġenomika (NGS)
Din il-pjattaforma ta 'analiżi hija mfassla għall-analiżi tad-dejta metaġenomika ta' shotgun fuq il-bażi ta 'snin ta' esperjenza.Tikkonsisti fluss tax-xogħol integrat li fih diversi analiżi ta' metaġenomika meħtieġa b'mod komuni inkluż ipproċessar tad-dejta, studji fil-livell tal-ispeċi, studji fil-livell tal-funzjoni tal-ġeni, binning tal-metaġenomi, eċċ. , l-issettjar tal-parametri, il-ġenerazzjoni ta 'figura personalizzata, eċċ.
-
LncRNA
RNAs twal mhux kodifikanti (lncRNA) huma tip ta 'traskrizzjonijiet b'tul itwal minn 200 nt, li ma jistgħux jikkodifikaw il-proteini.L-evidenza akkumulattiva tissuġġerixxi li ħafna mill-lncRNAs huma probabbli ħafna li jkunu funzjonali.Teknoloġiji ta 'sekwenzjar ta' prestazzjoni għolja u għodod ta 'analiżi bijoinformatika jagħtuna s-setgħa li niżvelaw sekwenzi lncRNA u informazzjoni ta' pożizzjonament b'mod aktar effiċjenti u jwassluna biex niskopru lncRNAs b'funzjonijiet regolatorji kruċjali.BMKCloud huwa kburi li jipprovdi lill-klijenti tagħna pjattaforma ta 'analiżi ta' sekwenzar tal-lncRNA biex tinkiseb analiżi tal-lncRNA mgħaġġla, affidabbli u flessibbli.
-
GWAS
Studju ta 'assoċjazzjoni mal-ġenoma kollu (GWAS) għandu l-għan li jidentifika varjanti ġenetiċi (ġenotip) li assoċjati ma' karatteristiċi speċifiċi (fenotip).Studji tal-GWA jinvestigaw markaturi ġenetiċi jaqsmu l-ġenoma kollu ta 'numru kbir ta' individwi u jbassru assoċjazzjonijiet ġenotip-fenotip permezz ta 'analiżi statistika fil-livell tal-popolazzjoni.Ir-risekwenzjar tal-ġenoma kollu jista' potenzjalment jiskopri l-varjanti ġenetiċi kollha.Flimkien ma 'dejta fenotipika, GWAS jista' jiġi pproċessat biex jidentifika SNPs, QTLs u ġeni kandidati relatati mal-fenotip, li jappoġġa bil-qawwa t-tnissil modern ta 'annimali/pjanti.SLAF hija strateġija ta' sekwenzar tal-ġenoma simplifikata żviluppata minnha nnifisha, li tiskopri markaturi distribwiti mal-ġenoma kollu, SNP.Dawn l-SNPs, bħala markaturi ġenetiċi molekulari, jistgħu jiġu pproċessati għal studji ta 'assoċjazzjoni b'karatteristiċi mmirati.Hija strateġija kost-effettiva fl-identifikazzjoni ta 'karatteristiċi kumplessi assoċjati varjazzjonijiet ġenetiċi.
-
Nanopore Traskriptomika ta' tul sħiħ
Iżoformi alternattivi kumplessi u varjabbli fl-organiżmi huma mekkaniżmi ġenetiċi importanti biex jirregolaw l-espressjoni tal-ġeni u d-diversità tal-proteini.L-identifikazzjoni preċiża tal-istrutturi tat-traskrizzjoni hija l-bażi għal studju fil-fond tal-mudelli tar-regolamentazzjoni tal-espressjoni tal-ġeni.Il-pjattaforma tas-sekwenzjar ta 'Nanopore ġabet b'suċċess l-istudju traskritomiku għal-livell ta' isoform.Din il-pjattaforma ta 'analiżi hija mfassla biex tanalizza d-dejta RNA-Seq ġġenerata fuq il-pjattaforma Nanopore fuq il-bażi tal-ġenoma ta' referenza, li tikseb analiżi kwalitattiva u kwantitattiva kemm fil-livell tal-ġeni kif ukoll fil-livell tat-traskrizzjonijiet.
-
circ-RNA
L-RNA ċirkolari (circRNA) huwa tip ta' RNA li ma jikkodifikax, li reċentement instabu li għandhom rwol vitali f'netwerks regolatorji involuti fl-iżvilupp, reżistenza ambjentali, eċċ. Distinti minn molekuli RNA lineari, eż. mRNA, lncRNA, 3′ u 5′ truf ta 'circRNA huma magħquda flimkien biex jiffurmaw struttura ċirkolari, li jsalvahom mid-diġestjoni ta' exonuclease u huma aktar stabbli mill-biċċa l-kbira ta 'RNA lineari.CircRNA instabu li għandhom funzjonijiet varji fir-regolazzjoni tal-espressjoni tal-ġeni.CircRNA jista 'jwettaq bħala ceRNA, li jorbot il-miRNA b'mod kompetittiv, magħruf bħala sponża miRNA.Il-pjattaforma tal-analiżi tas-sekwenzjar CircRNA tagħti s-setgħa lill-istruttura u l-analiżi tal-espressjoni taċ-ċirRNA, tbassir tal-mira u analiżi konġunta ma 'tipi oħra ta' molekuli RNA
-
BSA
Il-pjattaforma tal-Bulked Segregant Analysis tikkonsisti f'analiżi standard f'pass wieħed u analiżi avvanzata b'issettjar ta 'parametri apposta.BSA hija teknika użata biex tidentifika malajr markaturi ġenetiċi assoċjati mal-fenotip.Il-fluss tax-xogħol ewlieni tal-BSA fih: 1. għażla ta' żewġ gruppi ta' individwi b'fenotipi estremament opposti;2. il-ġbir flimkien tad-DNA, RNA jew SLAF-seq (Żviluppat minn Biomarker) ta 'l-individwi kollha biex jiffurmaw żewġ biċċa l-kbira tad-DNA;3. identifikazzjoni ta' sekwenzi differenzjali kontra ġenoma ta' referenza jew bejniethom, 4. tbassir ta' reġjuni konnessi kandidati permezz ta' algoritmu ta' ED u SNP-index;5. Analiżi funzjonali u arrikkiment fuq ġeni f'reġjuni kandidati, eċċ. Minjieri aktar avvanzati fid-dejta inkluż screening tal-marker ġenetiku u disinn tal-primer huma wkoll disponibbli.
