MIKROBJALI
Il-kompatibilità tal-batterja u l-immobilizzazzjoni bil-biochar tejbu d-degradazzjoni tat-tebuconazole, il-kompożizzjoni u l-funzjonament tal-mikrobijoma tal-ħamrija
Sekwenzar ta' amplicon 16S ta' tul sħiħ |PacBio HiFi |Alpha diversità |Diversità beta
F'dan l-istudju, sekwenzar ta 'amplicon 16S ta' tul sħiħ minn PacBio u analiżi bijoinformatika ġew ipprovduti minn Biomarker Technologies.
Il-punti ewlenin
Batterji degradanti ta 'tebuconazole immobilizzati bil-bijokar Alcaligenes faecalis WZ-2 ġie studjat fuq l-effiċjenza tal-bijodegradazzjoni u taffettwa fuq ħamrija kkontaminata b'tebuconazole meta mqabbla mar-razza degradanti ħielsa WZ-2.
1. WZ-2 immobilizzat bil-biochar wera degradazzjoni aktar effiċjenti fit-tebuconazole meta mqabbel ma 'WZ-2 ħieles billi naqqas il-half-life ta' tebuconazole fil-ħamrija minn 18.7 ijiem għal 13.3 ijiem.
2. WZ-2 immobilizzat bil-biochar kienu kapaċi jirrestawraw attivitajiet ta 'enżimi mikrobiċi tal-ħamrija indiġeni, inklużi urease, dehydrogenase u invertase, eċċ.
3. Il-profil mikrobjali f'ħamrija ttrattata WZ-2 immobilizzata bil-bijochar determinata permezz ta 'sekwenzjar 16S ta' tul sħiħ appoġġa b'mod qawwi li din is-sistema tista 'terġa' tirrestawra s-saħħa tal-ħamrija billi ttejjeb l-istruttura tal-komunità batterjali taħt kontaminazzjoni ta 'tebuconazole.
Esperjenza (relatat mas-sekwenzjar)
Raggruppament: CK: Ħamrija naturali;T: Ħamrija mgħollija b'tebuconazole;S: Tebuconazole kien fih ħamrija b'razza ħielsa WZ-2;QK: Tebuconazole kien fih ħamrija bil-bijokar;BCS: Tebuconazole kien fih ħamrija b'biochar immobilizzat WZ-2.
Teħid ta' kampjuni: Estrazzjoni totali tad-DNA tal-ħamrija amplifikata minn primers 16S rDNA
27F (5′-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3′) u 1492R (5′-GGTTACCTTGTTACGA),16S rDNA ta' tul sħiħ li jirrispetta
Pjattaforma tas-sekwenzjar: PacBio RS II
Strateġija ta' sekwenzar: CCS HIFI jaqra
Analiżi tad-dejta:BMKCloudIl-Pjattaformi Bijoinformatiċi jagħmlu l-goldfish sistema mudell ġenetiku eċċellenti għall-fiżjoloġija u l-evoluzzjoni tal-ħut.
Riżultat
L-istruttura tal-komunità mikrobjali tal-ħamrija ġiet iddeterminata permezz ta 'sekwenzjar ta' rDNA 16S.Ir-rikkezza OTU u l-indiċi tad-diversità alfa, inklużi l-indiċijiet Chao1, Ace, Shannon u Simpson ġew evalwati biex jiżvelaw id-diversità tal-ispeċi f'kull sistema.Wara 60 jum inkubazzjoni, l-indiċi kollha wrew xejra simili, jiġifieri tebuconazole jista' jinduċi tnaqqis fir-rikkezza tal-ispeċi u d-diversità fil-ħamrija.Madankollu, biż-żieda tar-razza WZ-2, il-komunità tal-batterji tal-ħamrija ġiet parzjalment irkuprata f'termini kemm ta 'rikkezza kif ukoll ta' diversità.Differenza limitata kienet osservata fost BC, BCS u CK, li tindika li l-biochar u l-biochar immobilizzat WZ-2 jistgħu effettivament jirrestawraw is-saħħa bijoloġika tal-ħamrija.
F'dan l-istudju ġie applikat il-Metodu ta' grupp ta' par mhux ppeżat b'Mezzi Aritmetiċi (UPGMA) biex juri d-diversità beta fost il-gruppi.Kif muri fil-figura li ġejja, BC, BSC u CK qasmu mudell aktar simili ta 'kompożizzjoni mikrobjali meta mqabbla mal-grupp T u S, li indika aktar li l-introduzzjoni ta' biochar fil-bijorimedjazzjoni tal-ħamrija kkontaminata b'tebuconazole tista 'tiffaċilita fil-biċċa l-kbira l-irkupru tal-komunità mikrobjali fil-ħamrija.
Figura.UPGMA raggruppament ta 'komunità batterjali fil-livell phylum taħt trattament differenti
Referenza
Sun, Tong, et al."Il-kompatibilità tal-batterja u l-immobilizzazzjoni bil-biochar tejbu d-degradazzjoni tat-tebuconazole, il-kompożizzjoni u l-funzjonament tal-mikrobijoma tal-ħamrija."Ġurnal ta 'Materjali Perikolużi398 (2020): 122941.
Aħbarijiet u Highlights għandu l-għan li jaqsam l-aħħar każijiet ta’ suċċess mat-Teknoloġiji tal-Bijomarker, li jinqabad kisbiet xjentifiċi ġodda kif ukoll tekniki prominenti applikati matul l-istudju.
Ħin tal-post: Jan-08-2022