● Reġjun tal-Kodifikazzjoni tal-Proteina Immirat: billi jinqabad u ssekwenzja r-reġjun tal-kodifikazzjoni tal-proteini, hWES jiġi utilizzat biex jiżvela varjanti relatati mal-istruttura tal-proteini;
● Preċiżjoni Għolja: b'fond għoli ta 'sekwenzjar, hWES jiffaċilita l-iskoperta ta' varjanti komuni u varjanti rari bi frekwenzi inqas minn 1%;
● Kost effettiv: hWES jagħti madwar 85% tal-mutazzjonijiet tal-mard tal-bniedem minn 1% tal-ġenoma uman;
● Ħames proċeduri QC stretti li jkopru l-proċess kollu b'Q30>85% garantit.
Pjattaforma
| Librerija
| Exon Qbid Strateġija
| Irrakkomanda Strateġija ta' Sekwenzar
|
Pjattaforma Illumina NovaSeq
| PE150 | Agilent SureSelect Human All Exon V6 IDT xGen Exome Hyb Panel V2 | 5 Gb 10 Gb |
Tip ta' Kampjun
| Ammont(Qubit® )
| Volum
| Konċentrazzjoni
| Purità (NanoDrop™) |
DNA ġenomika
| ≥ 300 ng | ≥ 15 μL | ≥ 20 ng/μL | OD260/280=1.8-2.0 l-ebda degradazzjoni, l-ebda kontaminazzjoni
|
Għal disturbi Mendeliani/mard rari: fond tas-sekwenzjar effettiv 'il fuq minn 50×
Għal kampjuni tat-tumur: fond tas-sekwenzjar effettiv 'il fuq minn 100×
1.Statistika ta' allinjament
Tabella 1 Statistika tar-riżultat tal-mappa
Tabella 2 Statistika tal-qbid tal-exome
2.Sejbien tal-Varjazzjoni
Figura 1 Statistika ta' SNV u InDel
3.Analiżi Avvanzata
Figura 2 Plott ta 'Circos ta' SNV u InDel ta 'ħsara għall-ġenoma kollu
Tabella 3 Screening tal-ġeni li jikkawżaw il-mard