Prodotti

Analiżi tal-Assoċjazzjoni tal-ġenoma kollu

Immaġni Dehru Analiżi tal-Assoċjazzjoni mal-ġenoma kollu

Studju ta 'assoċjazzjoni mal-ġenoma kollu (GWAS) għandu l-għan li jidentifika varjanti ġenetiċi (ġenotip) li assoċjati ma' karatteristiċi speċifiċi (fenotip).Studju GWAS jinvestiga markaturi ġenetiċi jaqsmu l-ġenoma kollu ta 'numru kbir ta' individwi u jbassar assoċjazzjonijiet ġenotip-fenotip permezz ta 'analiżi statistika fil-livell tal-popolazzjoni.Ġie applikat b'mod wiesa 'f'riċerka dwar mard tal-bniedem u tħaffir tal-ġeni funzjonali fuq karatteristiċi kumplessi ta' annimali jew pjanti.

Ikkuntatjana

Dettalji tas-Servizz

Riżultat Demo

Pubblikazzjoni Dehru

1.Vantaġġi tas-Servizz

● Każijiet Abbundanti ta 'Proġett: mit-twaqqif tiegħu fl-2009, BMKGENE lesta mijiet ta' proġetti ta 'speċi fir-riċerka tal-GWAS tal-popolazzjoni, għen riċerkaturi biex jippubblikaw aktar minn 100 artiklu, u l-fattur ta' impatt kumulattiv laħaq 500.
● Analisti professjonali.
● Ċiklu qasir ta 'analiżi.
● Tħaffir preċiż tad-dejta.

2. Speċifikazzjonijiet tas-Servizz

Tip	Skala tal-Popolazzjoni	Strateġija ta' sekwenzar u fond
SLAF-GWAS	Numru tal-kampjun ≥200	Daqs tal-ġenoma < 400M, b'ref-ġenoma, WGS huwa rakkomandat
		Daqs tal-ġenoma ≤ 1G, 100K Tags u 10X
		1G ≤ Daqs tal-ġenoma ≤ 2G, 200K Tikketti u 10X
		Daqs tal-ġenoma > 2G, 300K Tags u 10X
WGS-GWAS	Numru tal-kampjun ≥200	10X għal kull kampjun

3. Għażla tal-Materjal

Varjetajiet differenti, sottospeċi, razez tal-post/banek tal-ġeni/familji mħallta/riżorsi selvaġġi

Varjetajiet differenti, sottospeċi, razez tal-pajjiż

Familja ta’ nofs aħwa/familja ta’ aħwa sħiħa/riżorsi selvaġġi

4. Analiżi tal-Bijoinformazzjoni

● Analiżi ta 'assoċjazzjoni mal-ġenoma kollu
● Analiżi u screening ta' SNP sinifikanti
● Annotazzjoni funzjonali tal-ġene kandidat

5. Fluss tax-Xogħol tas-Servizz

Disinn tal-esperimenti

Kunsinna tal-kampjun

Estrazzjoni tal-RNA

Kostruzzjoni ta' librerija

Sekwenzar

Analiżi tad-dejta

Servizzi ta' wara l-bejgħ

Preċedenti: Sekwenzar ta' RNA b'nukleu wieħed

Li jmiss:

a.Fenotip QC

Istogramma tad-distribuzzjoni tal-frekwenza

L-istatistika tal-fenotip

b.Analiżi ta' assoċjazzjoni (Mudell: GEMMA, FaST-LMM, EMMAX)

QQ Plot

Manhattan Plot

Sena	Ġurnal	IF	Titolu
2022	NC	17.69	Il-bażi ġenomika tal-giga-kromożomi u l-giga-genoma tal-peony tas-siġar Paeonia ostii
2015	NP	7.43	Il-footprints tad-domestikazzjoni jankraw reġjuni ġenomiċi ta 'importanza agronomika fis-sojja
2018	MP	9.32	Is-sekwenza mill-ġdid tal-ġenoma kollu ta’ kollezzjoni dinjija ta’ adeżjonijiet taż-żerriegħa tal-kolza jiżvela l-bażi ġenetika tad-diverġenza tal-ekotip tagħhom
2022	HR	7.29	Analiżi ta 'assoċjazzjoni mal-ġenoma kollu tipprovdi għarfien molekulari dwar il-varjazzjoni naturali tad-daqs taż-żerriegħa tad-dulliegħa