Jesploraw il-potenzjal ta 'studju ta' varjetà selvaġġa ta 'speċi ta' riċerka, eżemplati minn każ kruċjali mill-klijenti ta 'BMKGENE.Ippubblikat riċentement fl-edizzjoni ta 'din is-sena tal-Pjanti Biotechnology Journal, l-artiklu intitolat "Kromosome-level Wild Hevea brasiliensis Genome: Empowering Genomic-Assisted Breeding and Unearthing Vital Loci for Elevated Rubber Yield" stands bħala referenza siewja.
Is-siġra tal-gomma Brażiljana (Hevea brasiliensis) tinsab għolja bħala sors tal-gomma naturali pivotali.Matul l-aħħar seklu, il-metodoloġiji tradizzjonali tat-tnissil wasslu għal żieda notevoli ta 'sitt darbiet fil-produzzjoni tal-gomma.Madankollu, il-pedament ġenetiku sottostanti responsabbli għat-titjib potenzjali tar-rendiment tal-gomma għadu enigmatiku.
Dan l-istudju beda jibni ġenoma fil-livell tal-kromożomi għas-siġra tal-gomma selvaġġa, billi uża sinerġija ta 'sekwenzjar ta' qari fit-tul Nanopore, sekwenzar NGS Illumina, u teknoloġija Hi-C.
B'mod parallel, ġabra ta' 147 riżorsi tal-ġermoplasma, li jinkludu varjazzjonijiet ta 'rendiment għoli, razez selvaġġi, u speċi relatati, ġew assemblati għal risekwenzar komprensiv tal-ġenoma kollu (WGS) bl-użu tal-pjattaforma Illumina.Id-dejta tas-sekwenzjar li rriżulta għaddiet minn analiżi rigoruża tal-ġenetika tal-popolazzjoni, li ppermettiet id-dissezzjoni tal-istruttura tal-popolazzjoni, id-diversità u l-iżbilanċ tar-rabta.Din l-analiżi tefgħet dawl fuq il-varjazzjonijiet tad-domestikazzjoni bejn il-popolazzjonijiet.
Investigazzjonijiet ulterjuri inkludew analiżi li tinkludi Fst, π, Tajima's D, u LD, bil-għan li jiżvelaw sinjali ta 'għażla li jirriżultaw minn rendiment imtejjeb tal-latex, b'mod partikolari li jiffoka fuq kloni ta' Wickham.
Il-qofol tagħhom f'Analiżi tal-Assoċjazzjoni kollha tal-Ġenoma (GWAS), ġew identifikati markaturi marbuta mal-karatteristiċi tar-rendiment u sussegwentement ġeni relatati mar-rendiment.Il-validazzjoni inizjali żvelat attivitajiet ta 'traskrizzjoni distintivi bejn mutanti differenti għal żewġ ġeni ERF, li pprovdiet ħarsa preliminari fis-sinifikat funzjonali tagħhom.Aktar korroborazzjoni hija skedata fi ħdan ir-riċerka li ġejja.
BMKGENE huwa kburi li jikkontribwixxi għar-risekwenzjar estensiv tal-ġenoma kollu ta 'din il-popolazzjoni mdaqqsa, flimkien ma' rwol sostanzjali fl-analiżi tal-bijoinformatika.L-esperjenza vasta tagħna tinkludi analiżi tas-sekwenzjar NGS/TGS u bijoinformatika multiomika fuq firxa ta '1000+ speċi.Nistennew bil-ħerqa l-prospett li nissieħbu miegħek fil-proġetti li jmiss tiegħek.
Ikklikkja hawn biextgħallem aktar dwar dan l-istudju
Ħin tal-post: Awissu-29-2023