BMKCloud Log in
条形banner-03

Prodotti

Sekwenzar tad-DNA/RNA - Nanopore Sequencer

Is-sekwenzjar ONT huwa teknoloġija ta 'sekwenzjar ta' sinjal elettriku f'ħin reali ta 'molekula waħda bbażata fuq nanopori, il-prinċipju ta' sekwenzar ta 'kull pjattaforma huwa l-istess.Double-stranded DNA/RNA se jorbot ma 'proteina nanoporuża inkorporata fil-bijofilm u tinħall taħt il-ċomb tal-proteina tal-mutur, taħt l-azzjoni tad-differenza fil-vultaġġ miż-żewġ naħat tal-bijofilm, il-linji tad-DNA/RNA jgħaddu mill-proteina tal-kanal nanoporu f'ċertu rata.Minħabba d-differenzi tal-proprjetajiet kimiċi tal-bażijiet differenti fuq il-linja tad-DNA/RNA, meta bażi waħda jew molekula tad-DNA tgħaddi mill-kanal nanopori, tikkawża l-bidla ta 'sinjali elettriċi differenti.Billi tiskopri u tikkorrispondi għal dawn is-sinjali, it-tipi ta 'bażi ​​korrispondenti jistgħu jiġu kkalkulati, u l-iskoperta f'ħin reali tas-sekwenza tista' titlesta.


Dettalji tas-Servizz

Riżultat Demo

Dettalji tas-Servizz Karatteristiċi

Pjattaforma

Daqs tal-Librerija

Rendiment tad-Data Teoretika (Kull Ċellula)

Preċiżjoni b'bażi ​​waħda

Applikazzjonijiet

Nanopore

8Kb, 10kb, 20kb, Ultralong, cDNA-PCR

70-90Gb/Ċellula

85-92%

Sejħa SV, De novo, Sekwenzar fit-tul sħiħ, Iso-Seq, Annotazzjoni tal-ġeni, Sejbien tal-metilazzjoni tad-DNA

Vantaġġi tas-Servizz

● Aktar minn 5 snin esperjenza fuq il-pjattaforma tas-sekwenzjar PacBio b'eluf ta 'proġetti magħluqa b'diversi speċi.
● BMKGENE huwa sieħeb uffiċjali ta 'Oxford Nanopore, b'ċertifikazzjoni RNA/DNA ta' pjattaforma doppja.
● Hemm mudelli mainstream ta 'sequencers b'tagħmir komplut u throughput ta' sekwenzar suffiċjenti.
● Ibbażat fuq il-pjattaforma Nanopore, aktar minn 10 riċerki Denovo fuq annimali u pjanti ġew ippubblikati f'ġurnali rinomati internazzjonalment.

Rekwiżiti tal-Kampjun


Tip ta' Kampjun

Ammont

Konċentrazzjoni (Qubit ®)

Volum

Purità

Oħrajn

DNA ġenomika

Jiddependi fuq ir-Rekwiżit tad-Data

 ≥20ng/μl

≥15μl

OD260/280=1.7-2.2;

OD260/230≥1.5;

Oqfa ​​ċara f'260 nm, l-ebda kontaminazzjoni

Il-konċentrazzjoni trid titkejjel b'Qubit u Qubit/Nanopore ≤ 2

RNA totali

≥1.2μg

≥100μg/μl

≥15μl

OD260/280=1.7-2.5;

OD260/230 = 0.5-2.5;l-ebda kontaminazzjoni

Valur RIN ≥7.5

 

Fluss tax-Xogħol tas-Servizz

preparazzjoni tal-kampjun

Preparazzjoni tal-kampjun

Preparazzjoni Librerija

Kostruzzjoni ta' librerija

Sekwenzar

Sekwenzar

Analiżi tad-dejta

Analiżi tad-dejta

Kampjun QC

Twassil tal-proġett


  • Preċedenti:
  • Li jmiss:

  • Valutazzjoni tal-Kwalità tad-Data tal-Kampjun tad-DNA

    Tabella 1. Statistika dwar data nadifa.

    BMKID

    rawSeqNum

    rawSumBase

    cleanSeqNum

    cleanSumBase

    nadifN50Len

    nadifN90Len

    cleanMeanLen

    cleanMaxLen

    cleanMeanQual

    DNA_BMK01

    1,218,239

    26.37

    1,121,736

    25.90

    28,014

    15,764

    23,090

    143,181

    9

    Valutazzjoni tal-Kwalità tad-Data tal-Kampjun tal-RNA

    Tabella 1. Statistika dwar data nadifa.

    Isem tal-fajl

    ClientID

    ReadNum

    BaseNum

    N50

    MeanLength

    MaxLength

    MeanQscore

    RNA_BMK001

    C2

    8,947,708

    4,047,230,083

    398

    452

    129,227

    Q12

    Figura 1. Aqra d-distribuzzjoni tat-tul

    A3

    Figura 2. Distribuzzjoni tal-punteġġ tal-kwalità tad-dejta nadifa

    A4

    Figura 3. Distribuzzjoni tal-punteġġ tat-tul u l-kwalità tad-dejta nadifa

    A5

    tikseb kwotazzjoni

    Ikteb il-messaġġ tiegħek hawn u ibgħatilna

    Ibgħatilna l-messaġġ tiegħek: