1) Riżoluzzjoni subċellulari: Kull żona ta’ qbid kienet fiha >2 miljun Spazjali Barcoded Spots b’dijametru ta’ 2.5 µm u spazjar ta’ 5 µm bejn iċ-ċentri tal-post, li ppermettiet analiżi tat-traskriptome spazjali b’riżoluzzjoni subċellulari (5 µm).
2) Analiżi ta 'riżoluzzjoni f'diversi livelli: Analiżi flessibbli f'diversi livelli li tvarja minn 100 μm sa 5 μm biex issolvi diversi karatteristiċi tat-tessuti bl-aħjar riżoluzzjoni.
3) Profiling komprensiv tat-traskriptome: Traskrizzjonijiet maqbuda mill-pjastra tat-tessut kollu jistgħu jiġu analizzati, mingħajr restrizzjoni fuq in-numru ta 'ġeni fil-mira u żona fil-mira.
Librerija | Strateġija ta' sekwenzar | Output tad-Data rakkomandat |
Librerija cDNA S1000 | BMKMANU S1000-Illumina PE150 | 60Gb/kampjun |
Kampjun | Numru | Daqs | Kwalità RNA |
Blokk tat-tessut inkorporat OCT | 2-3 blokki/kampjun | Appross.6.8x6.8x6.8 mm3 | RIN≥7 |
Għal aktar dettalji dwar il-gwida tal-preparazzjoni tal-kampjuni u l-fluss tax-xogħol tas-servizz, jekk jogħġbok tħossok liberu li tkellem lil aespert BMKGENE
Id-dejta ġġenerata minn BMKMANU S1000 hija analizzata bl-użu tas-softwer "BSTMatrix", li huwa ddisinjat b'mod indipendenti minn BMKGENE, inkluż:
1) Ġenerazzjoni tal-matriċi tal-espressjoni tal-ġeni
2) Ipproċessar tal-immaġni HE
3) Kompatibbli ma 'softwer ta' parti terza downstream għall-analiżi
4) Online "BSTViewer" jgħin biex jinkisbu riżultati ta 'viżwalizzazzjoni f'riżoluzzjonijiet differenti.
1.Spot clustering
2.Distribuzzjoni spazjali
Note: Riżoluzzjonilivell=13 (100 µm, xellug); 7 (50 µm, id-dritt)
3.Mappa tas-sħana tal-aggruppament tal-abbundanza tal-espressjoni tal-markatur
4.Analiżi tad-dejta bejn il-kampjuni