-
Penjujukan mRNA penuh-Nanopore
Penjujukan RNA telah menjadi alat yang tidak ternilai untuk analisis transkrip yang komprehensif.Tidak dinafikan, penjujukan bacaan pendek tradisional mencapai banyak perkembangan penting di sini.Walau bagaimanapun, ia sering menghadapi batasan dalam pengenalan isoform penuh, kuantifikasi, bias PCR.
Penjujukan nanopori membezakan dirinya daripada platform penjujukan yang lain, kerana nukleotida dibaca terus tanpa sintesis DNA dan menjana bacaan panjang pada puluhan kilobase.Ini memperkasakan transkrip bersilang bacaan langsung dan menangani cabaran dalam kajian peringkat isoform.
Platform：PromethION Nanopore
Perpustakaan:cDNA-PCR
-
De novo Penjujukan Transkriptom Penuh -PacBio
De novopenjujukan transkriptom penuh, juga dikenali sebagaiDe novoIso-Seq mengambil kelebihan penjujukan PacBio dalam panjang bacaan, yang membolehkan penjujukan molekul cDNA penuh panjang tanpa sebarang patah.Ini sepenuhnya mengelakkan sebarang ralat yang dijana dalam langkah pemasangan transkrip dan membina set unigene dengan resolusi tahap isoform.Set unigene ini menyediakan maklumat genetik yang berkuasa sebagai "genom rujukan" pada peringkat transkriptom.Di samping itu, menggabungkan dengan data penjujukan generasi akan datang, perkhidmatan ini memperkasakan kuantifikasi yang tepat bagi ekspresi peringkat isoform.
Platform： PacBio Sequel IIPerpustakaan: perpustakaan loceng SMRT -
Penjujukan mRNA eukariotik-Illumina
Penjujukan mRNA membolehkan pemprofilan semua mRNA yang ditranskrip daripada sel di bawah keadaan tertentu.Ia adalah teknologi berkuasa untuk mendedahkan profil ekspresi gen, struktur gen dan mekanisme molekul proses biologi tertentu.Sehingga kini, penjujukan mRNA telah digunakan secara meluas dalam penyelidikan asas, diagnostik klinikal, pembangunan ubat, dll.
Platform: Illumina NovaSeq 6000
-
Penjujukan mRNA berasaskan bukan Rujukan-Illumina
Penjujukan mRNA mengguna pakai teknik penjujukan generasi akan datang (NGS) untuk menangkap RNA(mRNA) utusan daripada Eukariota pada tempoh tertentu yang diaktifkan oleh beberapa fungsi khas.Transkrip terpanjang yang disambungkan dipanggil 'Unigene' dan digunakan sebagai urutan rujukan untuk analisis seterusnya, yang merupakan cara yang berkesan untuk mengkaji mekanisme molekul dan rangkaian pengawalseliaan spesies tanpa rujukan.
Selepas pemasangan data transkrip dan anotasi fungsi unigene
(1)Analisis SNP, analisis SSR, ramalan CDS dan struktur gen akan dibentuk terlebih dahulu.
(2) Kuantifikasi ekspresi unigen dalam setiap sampel akan dilakukan.
(3) Unigen yang dinyatakan secara berbeza antara sampel (atau kumpulan) akan ditemui berdasarkan ekspresi unigen
(4) Pengelompokan, anotasi berfungsi dan analisis pengayaan bagi unigen yang dinyatakan secara berbeza akan dilakukan
-
Penjujukan bukan pengekodan panjang-Illumina
RNA bukan pengekodan panjang (lncRNAs) ialah sejenis molekul RNA dengan panjang melebihi 200 nt, yang dicirikan oleh potensi pengekodan yang sangat rendah.LncRNA, sebagai ahli utama dalam RNA bukan pengekodan, terutamanya terdapat dalam nukleus dan plasma.Perkembangan dalam teknologi penjujukan dan bioinformtik membolehkan pengenalpastian pelbagai lncRNA novel dan mengaitkan mereka yang mempunyai fungsi biologi.Bukti terkumpul menunjukkan bahawa lncRNA terlibat secara meluas dalam peraturan epigenetik, peraturan transkripsi dan peraturan pasca transkripsi.
-
Penjujukan RNA kecil-Illumina
RNA kecil merujuk kepada kelas molekul RNA bukan pengekodan yang biasanya panjangnya kurang daripada 200nt, termasuk RNA mikro (miRNA), RNA gangguan kecil (siRNA) dan RNA berinteraksi piwi (piRNA).
MicroRNA (miRNA) ialah kelas RNA kecil endogen dengan panjang kira-kira 20-24nt, yang memainkan pelbagai peranan pengawalseliaan penting dalam sel.miRNA terlibat dalam banyak proses hidup yang mendedahkan tisu - khusus dan peringkat - ekspresi khusus dan sangat terpelihara dalam spesies yang berbeza.
-
penjujukan circRNA-Illumina
Penjujukan transkrip keseluruhan direka untuk memprofilkan semua jenis molekul RNA, termasuk pengekodan (mRNA) dan RNA bukan pengekodan (termasuk lncRNA, circRNA dan miRNA) yang ditranskripsikan oleh sel tertentu pada masa tertentu.Penjujukan keseluruhan transkrip, juga dikenali sebagai "penjujukan RNA jumlah" bertujuan untuk mendedahkan rangkaian pengawalseliaan yang komprehensif pada tahap transkrip.Mengambil kesempatan daripada teknologi NGS, jujukan keseluruhan produk transkrip tersedia untuk analisis ceRNA dan analisis RNA bersama, yang menyediakan langkah pertama ke arah pencirian berfungsi.Mendedahkan rangkaian pengawalseliaan ceRNA berasaskan circRNA-miRNA-mRNA.
-
Penjujukan transkrip keseluruhan - Illumina
Penjujukan transkrip keseluruhan direka untuk memprofilkan semua jenis molekul RNA, termasuk pengekodan (mRNA) dan RNA bukan pengekodan (termasuk lncRNA, circRNA dan miRNA) yang ditranskripsikan oleh sel tertentu pada masa tertentu.Penjujukan keseluruhan transkrip, juga dikenali sebagai "penjujukan RNA jumlah" bertujuan untuk mendedahkan rangkaian pengawalseliaan yang komprehensif pada tahap transkrip.Mengambil kesempatan daripada teknologi NGS, jujukan keseluruhan produk transkrip tersedia untuk analisis ceRNA dan analisis RNA bersama, yang menyediakan langkah pertama ke arah pencirian berfungsi.Mendedahkan rangkaian pengawalseliaan ceRNA berasaskan circRNA-miRNA-mRNA.
-
Penjujukan RNA prokariotik
Penjujukan RNA prokariotik menggunakan penjujukan generasi seterusnya (NGS) untuk mendedahkan kehadiran dan kuantiti RNA pada masa tertentu, dengan menganalisis transkrip selular yang berubah.Penjujukan RNA prokariotik syarikat kami, khusus menyasarkan prokariot dengan genom rujukan, memberikan anda pemprofilan transkriptom, analisis struktur gen, dsb. Ia telah digunakan secara meluas untuk penyelidikan sains asas, penyelidikan dan pembangunan ubat, dan banyak lagi.
Platform: Illumina NovaSeq 6000
-
Penjujukan Metatranskrip
Penjujukan metatranskriptom mengenal pasti ekspresi gen mikrob (kedua-dua eukariota dan prokariot) dalam persekitaran semula jadi (iaitu tanah, air, laut, najis dan usus.). Khususnya, perkhidmatan ini membolehkan anda mendapatkan pemprofilan ekspresi gen keseluruhan komuniti mikrob kompleks, analisis taksonomi spesies, analisis pengayaan fungsi gen yang dinyatakan secara berbeza, dan banyak lagi.
Platform: Illumina NovaSeq 6000
