RNA kecil ialah jenis RNA bukan pengekodan pendek dengan panjang purata 18-30 nt, termasuk miRNA, siRNA dan piRNA.RNA kecil ini telah dilaporkan secara besar-besaran terlibat dalam pelbagai proses biologi seperti degradasi mRNA, perencatan terjemahan, pembentukan heterochromatin, dll. Analisis penjujukan SmallRNA telah digunakan secara meluas dalam kajian tentang pembangunan haiwan/tumbuhan, penyakit, virus, dll. RNA kecil platform analisis penjujukan terdiri daripada analisis standard dan perlombongan data lanjutan.Berdasarkan data RNA-seq, analisis standard boleh mencapai pengenalan dan ramalan miRNA, ramalan gen sasaran miRNA, anotasi dan analisis ekspresi.Analisis lanjutan membolehkan carian dan pengekstrakan miRNA tersuai, penjanaan rajah Venn, miRNA dan pembinaan rangkaian gen sasaran.