-
BSA
Platform Analisis Segregant Pukal terdiri daripada analisis standard satu langkah dan analisis lanjutan dengan tetapan parameter tersuai.BSA ialah teknik yang digunakan untuk mengenal pasti penanda genetik berkaitan fenotip dengan cepat.Aliran kerja utama BSA mengandungi: 1. memilih dua kumpulan individu dengan fenotip yang sangat bertentangan;2. mengumpulkan DNA, RNA atau SLAF-seq(Dibangunkan oleh Biomarker) semua individu untuk membentuk dua pukal DNA;3. mengenal pasti jujukan pembezaan terhadap genom rujukan atau di antaranya, 4. meramalkan kawasan yang dipautkan calon oleh ED dan algoritma indeks SNP;5. Analisis dan pengayaan fungsional pada gen di kawasan calon, dsb. Perlombongan yang lebih maju dalam data termasuk pemeriksaan penanda genetik dan reka bentuk primer juga tersedia.
-
Amplicon (16S/18S/ITS)
Platform Amplicon (16S/18S/ITS) dibangunkan dengan pengalaman bertahun-tahun dalam analisis projek kepelbagaian mikrob, yang mengandungi analisis asas piawai dan analisis peribadi: analisis asas meliputi kandungan analisis arus perdana penyelidikan mikrob semasa, kandungan analisis kaya dan komprehensif, dan hasil analisis dibentangkan dalam bentuk laporan projek;Kandungan analisis diperibadikan adalah pelbagai.Sampel boleh dipilih dan parameter boleh ditetapkan secara fleksibel mengikut laporan analisis asas dan tujuan penyelidikan, untuk merealisasikan keperluan yang diperibadikan.Sistem pengendalian Windows, ringkas dan pantas.
-
Genetik Evolusi
Genetik evolusi ialah perkhidmatan penjujukan padat yang direka untuk menyediakan tafsiran komprehensif tentang maklumat evolusi bahan yang diberikan berdasarkan variasi genetik, termasuk SNP, InDels, SV dan CNV.Ia menyediakan semua analisis asas yang diperlukan untuk menerangkan perubahan evolusi dan ciri genetik populasi, seperti struktur populasi, kepelbagaian genetik, hubungan filogeni, dll. Ia juga mengandungi kajian tentang aliran gen, yang memperkasakan anggaran saiz populasi yang berkesan, masa perbezaan.
-
Genomik Perbandingan
Genomik perbandingan secara literal bermaksud membandingkan jujukan genom lengkap dan struktur spesies yang berbeza.Disiplin ini bertujuan untuk mendedahkan evolusi spesies, fungsi gen, mekanisme pengawalseliaan gen pada peringkat genom dengan mengenal pasti struktur jujukan dan unsur-unsur yang dipelihara atau dibezakan merentas spesies yang berbeza.Kajian genomik perbandingan biasa termasuk analisis dalam keluarga gen, perkembangan evolusi, penduaan keseluruhan genom, tekanan terpilih, dsb.
-
Genetik Evolusi
Platform analisis genetik populasi dan evolusi diwujudkan berdasarkan pengalaman besar yang terkumpul dalam pasukan R&D BMK selama bertahun-tahun.Ia adalah alat yang mesra pengguna terutamanya untuk penyelidik yang tidak mengambil jurusan bioinformatik.Platform ini membolehkan analisis asas berkaitan genetik evolusioner termasuk pembinaan pokok filogenetik, analisis ketidakseimbangan kaitan, penilaian kepelbagaian genetik, analisis sapuan terpilih, analisis persaudaraan, PCA, analisis struktur populasi, dsb.
-
Perhimpunan Genom berasaskan Hi-C
Hi-C ialah kaedah yang direka untuk menangkap konfigurasi kromosom dengan menggabungkan interaksi berasaskan kedekatan menyelidik dan penjujukan throughput tinggi.Keamatan interaksi ini dipercayai berkorelasi negatif dengan jarak fizikal pada kromosom.Oleh itu, data Hi-C boleh membimbing pengelompokan, susunan dan orientasi jujukan terkumpul dalam draf genom dan menambatnya pada bilangan kromosom tertentu.Teknologi ini memperkasakan pemasangan genom peringkat kromosom tanpa adanya peta genetik berasaskan populasi.Setiap genom memerlukan Hi-C.
Platform：Platform Illumina NovaSeq / DNBSEQ
-
Penjujukan Genom Tumbuhan/Haiwan De Novo
De Novopenjujukan merujuk kepada pembinaan genom keseluruhan spesies menggunakan teknologi penjujukan, contohnya PacBio, Nanopore, NGS, dsb., tanpa genom rujukan.Peningkatan yang luar biasa dalam panjang bacaan teknologi penjujukan generasi ketiga telah membawa peluang baharu dalam memasang genom kompleks, seperti yang mempunyai heterozigositi tinggi, nisbah kawasan berulang yang tinggi, poliploid, dsb. Dengan panjang bacaan pada tahap berpuluh-puluh kilobase, bacaan penjujukan ini membolehkan menyelesaikan elemen berulang, kawasan dengan kandungan GC abnormal dan kawasan lain yang sangat kompleks.
Platform： PacBio Sequel II /Nanopore PromethION P48/ Platform Illumina NovaSeq
-
Penjujukan Exome Seluruh Manusia
Penjujukan keseluruhan exome (WES) dianggap sebagai strategi penjujukan kos efektif untuk mengenal pasti mutasi yang menyebabkan penyakit.Walaupun ekson hanya mengambil kira-kira 1.7% daripada keseluruhan genom, ia mewakili profil jumlah fungsi protein secara langsung.Dalam genom manusia, telah dilaporkan bahawa lebih daripada 85% mutasi berkaitan penyakit berlaku di kawasan pengekodan protein.
BMKGENE menawarkan perkhidmatan penjujukan keseluruhan exome manusia yang komprehensif dan fleksibel dengan strategi penangkapan exon berbeza yang tersedia untuk memenuhi pelbagai matlamat penyelidikan.
Platform: Platform Illumina NovaSeq
-
Penjujukan Fragmen Diperkuat-Lokus Khusus (SLAF-Seq)
Genotaip pemprosesan tinggi, terutamanya pada populasi berskala besar, merupakan langkah asas dalam kajian persatuan genetik, yang menyediakan asas genetik untuk penemuan gen berfungsi, analisis evolusi, dll. Daripada penjujukan semula genom keseluruhan yang mendalam, penjujukan genom perwakilan yang dikurangkan (RRGS ) diperkenalkan untuk meminimumkan kos penjujukan bagi setiap sampel, sambil mengekalkan kecekapan yang munasabah pada penemuan penanda genetik.Ini biasanya dicapai dengan mengekstrak serpihan sekatan dalam julat saiz tertentu, yang dinamakan perpustakaan perwakilan terkurang (RRL).Penjujukan serpihan dikuatkan lokus khusus (SLAF-Seq) ialah strategi yang dibangunkan sendiri untuk genotaip SNP dengan atau tanpa genom rujukan.
Platform: Platform Illumina NovaSeq -
Illumina dan BGI
Teknologi penjujukan Illumina, berdasarkan Sequencing by Synthesis (SBS), ialah inovasi NGS yang diterima pakai secara global, bertanggungjawab untuk menjana lebih 90% data penjujukan dunia.Prinsip SBS melibatkan pengimejan penamat boleh balik berlabel pendarfluor apabila setiap dNTP ditambah, dan seterusnya dibelah untuk membenarkan penggabungan pangkalan seterusnya.Dengan kesemua empat dNTP terikat terminator boleh balik hadir dalam setiap kitaran penjujukan, persaingan semula jadi meminimumkan bias penggabungan.Teknologi serba boleh ini menyokong perpustakaan baca tunggal dan akhir berpasangan, memenuhi pelbagai aplikasi genomik.Keupayaan pemprosesan tinggi dan ketepatan penjujukan Illumina meletakkannya sebagai asas dalam penyelidikan genomik, memperkasakan saintis untuk merungkai selok-belok genom dengan perincian dan kecekapan yang tiada tandingan.
DNBSEQ, yang dibangunkan oleh BGI, ialah satu lagi teknologi NGS inovatif yang telah berjaya mengurangkan lagi kos penjujukan dan meningkatkan daya pengeluaran.Penyediaan perpustakaan DNBSEQ melibatkan pemecahan DNA, penyediaan ssDNA dan amplifikasi bulatan bergolek untuk mendapatkan bola nano DNA (DNB).Ini kemudiannya dimuatkan ke atas permukaan pepejal dan seterusnya disusun dengan gabungan Sintesis Probe-Anchor (cPAS).
Perkhidmatan penjujukan perpustakaan pra-buatan kami memudahkan pelanggan dalam menyediakan perpustakaan penjujukan mereka daripada pelbagai sumber (mRNA, genom keseluruhan, amplikon, antara lain).Selepas itu, perpustakaan ini boleh dihantar ke pusat penjujukan kami untuk kawalan kualiti dan penjujukan dalam platform Illumina atau BGI.
