-
Penjujukan Imunopresipitasi Kromatin (ChIP-seq)
ChIP-Seq menyediakan profil genom seluruh sasaran DNA untuk pengubahsuaian histon, faktor transkripsi dan protein berkaitan DNA yang lain.Ia menggabungkan selektiviti chromatin immuno-precipitation (ChIP) untuk memulihkan kompleks protein-DNA tertentu, dengan kuasa penjujukan generasi akan datang (NGS) untuk penjujukan pemprosesan tinggi bagi DNA yang dipulihkan.Selain itu, kerana kompleks protein-DNA diperoleh semula daripada sel hidup, tapak pengikat boleh dibandingkan dalam jenis sel dan tisu yang berbeza, atau dalam keadaan yang berbeza.Aplikasi terdiri daripada peraturan transkrip kepada laluan perkembangan kepada mekanisme penyakit dan seterusnya.
Platform: Platform Illumina NovaSeq
-
Penjujukan Metagenomik -NGS
Metagenom merujuk kepada koleksi jumlah bahan genetik komuniti campuran organisma, seperti metagenom persekitaran, metagenom manusia, dll. Ia mengandungi genom kedua-dua mikroorganisma yang boleh ditanam dan tidak boleh ditanam.Penjujukan metagenomik ialah alat molekul yang digunakan untuk menganalisis bahan genomik campuran yang diekstrak daripada sampel persekitaran, yang menyediakan maklumat terperinci dalam kepelbagaian dan kelimpahan spesies, struktur populasi, hubungan filogenetik, gen berfungsi dan rangkaian korelasi dengan faktor persekitaran.
Platform：Platform Illumina NovaSeq
-
Penjujukan Metagenomik-Nanopori
Metagenomik ialah alat molekul yang digunakan untuk menganalisis bahan genomik campuran yang diekstrak daripada sampel persekitaran, yang menyediakan maklumat terperinci dalam kepelbagaian dan kelimpahan spesies, struktur populasi, hubungan filogenetik, gen berfungsi dan rangkaian korelasi dengan faktor persekitaran, dll. Platform penjujukan Nanopore baru-baru ini telah diperkenalkan kepada kajian metagenomik.Prestasi cemerlangnya dalam panjang bacaan sebahagian besarnya dipertingkatkan analisis metagenomik aliran bawah, terutamanya pemasangan metagenom.Mengambil kelebihan daripada bacaan panjang, kajian metagenomik berasaskan Nanopore mampu mencapai pemasangan yang lebih berterusan berbanding dengan metagenomik senapang patah.Telah diterbitkan bahawa metagenomik berasaskan Nanopore berjaya menghasilkan genom bakteria lengkap dan tertutup daripada mikrobiom (Moss, EL, et. al,Bioteknologi Alam Semula Jadi, 2020)
Platform：Nanopore PromethION P48
-
Penjujukan bisulfit genom keseluruhan
Metilasi DNA pada kedudukan kelima dalam sitosin (5-mC) mempunyai pengaruh asas terhadap ekspresi gen dan aktiviti selular.Corak metilasi yang tidak normal telah dikaitkan dengan beberapa keadaan dan penyakit, seperti kanser.WGBS telah menjadi piawaian emas untuk mengkaji metilasi seluruh genom pada resolusi asas tunggal.
Platform: Platform Illumina NovaSeq
-
Ujian untuk Kromatin Boleh Akses Transposase dengan Penjujukan Throughput Tinggi (ATAC-seq)
ATAC-seq ialah kaedah penjujukan throughput tinggi untuk analisis kebolehcapaian kromatin seluruh genom, yang penting untuk kawalan epigenetik global ekspresi gen.Penyesuai penjujukan dimasukkan ke dalam kawasan kromatin terbuka oleh transposase Tn5 hiperaktif.Selepas penguatan PCR, perpustakaan penjujukan dibina.Semua kawasan kromatin terbuka boleh diperoleh di bawah keadaan ruang-masa tertentu, bukan sahaja terhad kepada tapak pengikatan faktor transkripsi, atau kawasan ubah suai histon tertentu.
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-PacBio
Subunit pada rRNA 16S dan 18S yang mengandungi kedua-dua kawasan yang sangat konservatif dan hiper-pembolehubah ialah cap jari molekul yang sempurna untuk pengecaman organisma prokariotik dan eukariotik.Mengambil kesempatan daripada penjujukan, amplikon ini boleh disasarkan berdasarkan bahagian yang dipelihara dan kawasan hiper-pembolehubah boleh dicirikan sepenuhnya untuk pengenalpastian mikrob yang menyumbang kepada kajian yang meliputi analisis kepelbagaian mikrob, taksonomi, filogeni, dll. Molekul tunggal masa nyata (SMRT ) penjujukan platform PacBio membolehkan mendapatkan bacaan panjang yang sangat tepat, yang boleh meliputi amplikon panjang penuh (lebih kurang 1.5 Kb).Pandangan luas bidang genetik telah meningkatkan resolusi dalam anotasi spesies dalam komuniti bakteria atau kulat.
Platform：Sekuel PacBio II
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-NGS
Penjujukan amplikon 16S/18S/ITS bertujuan untuk mendedahkan kelimpahan filogeni, taksonomi dan spesies dalam komuniti mikrob dengan menyiasat produk PCR penanda genetik pengemasan yang mengandungi bahagian yang sangat bertutur dan hipervariable.Pengenalan cap jari molekul sempurna ini oleh Woeses et al, (1977) memperkasakan pemprofilan mikrobiom bebas pengasingan.Penjujukan 16S (bakteria), 18S (kulat) dan spacer transkripsi Dalaman (ITS, kulat) membolehkan pengecaman kedua-dua spesies yang banyak serta spesies yang jarang dan tidak dikenal pasti.Teknologi ini telah menjadi alat yang digunakan secara meluas dan utama dalam mengenal pasti komposisi mikrob yang berbeza dalam pelbagai persekitaran, seperti mulut manusia, usus, najis, dll.
Platform：Platform Illumina NovaSeq
-
Penjujukan Semula Seluruh Genom Bakteria dan Kulat
Penjujukan semula genom keseluruhan bakteria dan kulat ialah alat kritikal untuk melengkapkan genom bakteria dan kulat yang diketahui, serta membandingkan berbilang genom atau memetakan genom organisma baharu.Adalah sangat penting untuk menyusun keseluruhan genom bakteria dan kulat untuk menghasilkan genom rujukan yang tepat, untuk melakukan pengenalpastian mikrob dan kajian genom perbandingan lain.
Platform:Platform Illumina NovaSeq
-
Penjujukan Amplikon 16S/18S/ITS Panjang Penuh PacBio
Platform Amplicon (16S/18S/ITS) dibangunkan dengan pengalaman bertahun-tahun dalam analisis projek kepelbagaian mikrob, yang mengandungi analisis asas piawai dan analisis peribadi: analisis asas meliputi kandungan analisis arus perdana penyelidikan mikrob semasa, kandungan analisis kaya dan komprehensif, dan hasil analisis dibentangkan dalam bentuk laporan projek;Kandungan analisis diperibadikan adalah pelbagai.Sampel boleh dipilih dan parameter boleh ditetapkan secara fleksibel mengikut laporan analisis asas dan tujuan penyelidikan, untuk merealisasikan keperluan yang diperibadikan.Sistem pengendalian Windows, ringkas dan pantas.
-
Transkriptom PacBio-Full-length (Bukan Rujukan)
Mengambil data penjujukan Isoform Pacific Biosciences (PacBio) sebagai input, Apl ini dapat mengenal pasti urutan transkrip panjang penuh (tanpa pemasangan).Dengan memetakan jujukan panjang penuh terhadap genom rujukan, transkrip boleh dioptimumkan oleh gen yang diketahui, transkrip, kawasan pengekodan, dll. Dalam kes ini, pengenalpastian struktur mRNA yang lebih tepat, seperti penyambungan alternatif, dll, boleh dicapai.Analisis bersama dengan data penjujukan transkrip NGS membolehkan anotasi yang lebih komprehensif dan kuantifikasi yang lebih tepat dalam ungkapan pada peringkat transkrip, yang sebahagian besarnya memberi manfaat kepada ekspresi pembezaan hiliran dan analisis fungsi.
-
Penjujukan Bisulfit Perwakilan Terkurang (RRBS)
Penyelidikan metilasi DNA sentiasa menjadi topik hangat dalam penyelidikan penyakit, dan berkait rapat dengan ekspresi gen dan sifat fenotip.RRBS ialah kaedah yang tepat, cekap dan menjimatkan untuk penyelidikan metilasi DNA.Pengayaan kawasan pulau promoter dan CpG oleh belahan enzimatik (Msp I), digabungkan dengan penjujukan Bisulfit, menyediakan pengesanan metilasi DNA resolusi tinggi.
Platform: Platform Illumina NovaSeq
-
Penjujukan mRNA prokariotik
Penjujukan mRNA memperkasakan profil komprehensif semua transkrip mRNA dalam sel di bawah keadaan tertentu.Teknologi canggih ini berfungsi sebagai alat yang mujarab, mendedahkan profil ekspresi gen yang rumit, struktur gen, dan mekanisme molekul yang dikaitkan dengan pelbagai proses biologi.Diguna pakai secara meluas dalam penyelidikan asas, diagnostik klinikal dan pembangunan ubat, penjujukan mRNA menawarkan pandangan tentang selok-belok dinamik selular dan peraturan genetik.Pemprosesan sampel mRNA prokariotik kami disesuaikan untuk transkriptom prokariotik, yang melibatkan pengurangan rRNA dan penyediaan perpustakaan berarah.
Platform: Illumina NovaSeq X
