-
Penjujukan Amplikon 16S/18S/ITS Panjang Penuh PacBio
Platform Amplicon (16S/18S/ITS) dibangunkan dengan pengalaman bertahun-tahun dalam analisis projek kepelbagaian mikrob, yang mengandungi analisis asas piawai dan analisis peribadi: analisis asas meliputi kandungan analisis arus perdana penyelidikan mikrob semasa, kandungan analisis kaya dan komprehensif, dan hasil analisis dibentangkan dalam bentuk laporan projek;Kandungan analisis diperibadikan adalah pelbagai.Sampel boleh dipilih dan parameter boleh ditetapkan secara fleksibel mengikut laporan analisis asas dan tujuan penyelidikan, untuk merealisasikan keperluan yang diperibadikan.Sistem pengendalian Windows, ringkas dan pantas.
-
Transkriptom PacBio-Full-length (Bukan Rujukan)
Mengambil data penjujukan Isoform Pacific Biosciences (PacBio) sebagai input, Apl ini dapat mengenal pasti urutan transkrip panjang penuh (tanpa pemasangan).Dengan memetakan jujukan panjang penuh terhadap genom rujukan, transkrip boleh dioptimumkan oleh gen yang diketahui, transkrip, kawasan pengekodan, dll. Dalam kes ini, pengenalpastian struktur mRNA yang lebih tepat, seperti penyambungan alternatif, dll, boleh dicapai.Analisis bersama dengan data penjujukan transkrip NGS membolehkan anotasi yang lebih komprehensif dan kuantifikasi yang lebih tepat dalam ungkapan pada peringkat transkrip, yang sebahagian besarnya memberi manfaat kepada ekspresi pembezaan hiliran dan analisis fungsi.
-
Kit alatan
BMKCloud ialah platform bioinformatik terkemuka yang menyediakan penyelesaian sehenti untuk program genomik, yang dipercayai secara meluas oleh penyelidik dalam pelbagai arena termasuk perubatan, pertanian, alam sekitar, dll. BMKCloud komited untuk menyediakan perkhidmatan bersepadu, boleh dipercayai dan cekap termasuk platform dan alatan analisis bioinformatik , sumber pengkomputeran, pangkalan data awam, kursus dalam talian bioinformtik, dll. BMKCloud mempunyai pelbagai alat bioinformatik yang kerap digunakan termasuk anotasi gen, alat genetik evolusi, ncRNA, kawalan kualiti data, pemasangan, penjajaran, pengekstrakan data, mutasi, statistik, penjana angka, jujukan analisis, dsb.
-
RNA kecil
RNA kecil ialah jenis RNA bukan pengekodan pendek dengan panjang purata 18-30 nt, termasuk miRNA, siRNA dan piRNA.RNA kecil ini telah dilaporkan secara besar-besaran terlibat dalam pelbagai proses biologi seperti degradasi mRNA, perencatan terjemahan, pembentukan heterochromatin, dll. Analisis penjujukan SmallRNA telah digunakan secara meluas dalam kajian tentang pembangunan haiwan/tumbuhan, penyakit, virus, dll. RNA kecil platform analisis penjujukan terdiri daripada analisis standard dan perlombongan data lanjutan.Berdasarkan data RNA-seq, analisis standard boleh mencapai pengenalan dan ramalan miRNA, ramalan gen sasaran miRNA, anotasi dan analisis ekspresi.Analisis lanjutan membolehkan carian dan pengekstrakan miRNA tersuai, penjanaan rajah Venn, miRNA dan pembinaan rangkaian gen sasaran.
-
NGS-WGS (Illumina/BGI)
NGS-WGS ialah platform analisis penjujukan semula genom keseluruhan, yang dibangunkan berdasarkan pengalaman yang kaya dalam Teknologi Biomarker.Platform yang mudah digunakan ini membolehkan penyerahan aliran kerja analisis bersepadu dengan hanya menetapkan beberapa parameter asas, yang sesuai untuk data penjujukan DNA yang dijana daripada platform Illumina dan platform penjujukan BGI.Platform ini digunakan pada pelayan pengkomputeran berprestasi tinggi, yang memperkasakan analisis data yang sangat cekap dalam masa yang sangat terhad.Perlombongan data diperibadikan tersedia berdasarkan analisis standard, termasuk pertanyaan gen bermutasi, reka bentuk primer PCR, dsb.
-
mRNA(Rujukan)
Transkriptom ialah pautan antara maklumat genetik genomik dan proteom fungsi biologi.Kawal selia tahap transkrip ialah mod kawal selia organisma yang paling penting dan paling banyak dikaji.Penjujukan transkriptom boleh menyusun transkrip pada bila-bila masa atau di bawah sebarang keadaan, dengan resolusi yang tepat kepada satu nukleotida. Ia boleh mencerminkan tahap transkripsi gen secara dinamik, pada masa yang sama mengenal pasti dan mengukur transkrip yang jarang dan normal, dan memberikan maklumat struktur contoh transkrip tertentu.
Pada masa ini, teknologi penjujukan transkrip telah digunakan secara meluas dalam agronomi, perubatan dan bidang penyelidikan lain, termasuk peraturan pembangunan haiwan dan tumbuhan, penyesuaian alam sekitar, interaksi imun, penyetempatan gen, evolusi genetik spesies dan pengesanan tumor dan penyakit genetik.
-
Metagenomik (NGS)
Platform analisis ini direka untuk analisis data metagenomik senapang patah berdasarkan pengalaman bertahun-tahun.Ia terdiri daripada aliran kerja bersepadu yang mengandungi pelbagai analisis metagenomik yang lazim diperlukan termasuk pemprosesan data, kajian peringkat spesies, kajian peringkat fungsi gen, binning metagenome, dll. Selain itu, alat perlombongan data tersuai tersedia berdasarkan aliran kerja analisis standard, termasuk pertanyaan gen dan spesies , tetapan parameter, penjanaan angka diperibadikan, dsb.
-
LncRNA
RNA bukan pengekodan panjang (lncRNA) ialah sejenis transkrip dengan panjang lebih daripada 200 nt, yang tidak dapat mengekodkan protein.Bukti terkumpul menunjukkan bahawa kebanyakan lncRNA berkemungkinan besar berfungsi.Teknologi penjujukan throughput tinggi dan alat analisis bioinformatik memperkasakan kami untuk mendedahkan jujukan lncRNA dan maklumat kedudukan dengan lebih cekap dan membawa kami menemui lncRNA dengan fungsi pengawalseliaan yang penting.BMKCloud berbangga untuk menyediakan platform analisis penjujukan lncRNA pelanggan kami untuk mencapai analisis lncRNA yang pantas, boleh dipercayai dan fleksibel.
-
GWAS
Kajian persatuan seluruh genom (GWAS) bertujuan untuk mengenal pasti varian genetik (genotip) yang dikaitkan dengan ciri tertentu (fenotip).Kajian GWA menyiasat penanda genetik merentas keseluruhan genom sejumlah besar individu dan meramalkan persatuan genotip-fenotip melalui analisis statistik pada peringkat populasi.Penjujukan semula genom keseluruhan berpotensi menemui semua varian genetik.Bergandingan dengan data fenotip, GWAS boleh diproses untuk mengenal pasti SNP berkaitan fenotip, QTL dan gen calon, yang menyokong pembiakan haiwan/tumbuhan moden dengan kuat.SLAF ialah strategi penjujukan genom dipermudah yang dibangunkan sendiri, yang menemui penanda teragih seluruh genom, SNP.SNP ini, sebagai penanda genetik molekul, boleh diproses untuk kajian persatuan dengan ciri yang disasarkan.Ia adalah strategi kos efektif dalam mengenal pasti ciri-ciri kompleks yang berkaitan dengan variasi genetik.
-
Transkriptomi penuh Nanopore
Isoform alternatif yang kompleks dan berubah-ubah dalam organisma adalah mekanisme genetik yang penting untuk mengawal ekspresi gen dan kepelbagaian protein.Pengenalpastian tepat struktur transkrip adalah asas untuk kajian mendalam tentang corak peraturan ekspresi gen.Platform penjujukan nanopore telah berjaya membawa kajian transkriptom ke tahap isoform.Platform analisis ini direka bentuk untuk menganalisis data RNA-Seq yang dijana pada platform Nanopore berdasarkan genom rujukan, yang mencapai analisis kualitatif dan kuantitatif dalam kedua-dua peringkat gen dan tahap transkrip.
-
circ-RNA
RNA Pekeliling(circular RNA) ialah sejenis RNA bukan pengekodan, yang baru-baru ini didapati memainkan peranan penting dalam rangkaian pengawalseliaan yang terlibat dalam pembangunan, rintangan alam sekitar, dll. Berbeza daripada molekul RNA linear, contohnya mRNA, lncRNA, 3' dan 5' hujung circRNA dicantumkan untuk membentuk struktur bulat, yang menyelamatkannya daripada pencernaan exonuclease dan lebih stabil daripada kebanyakan RNA linear.CircRNA didapati mempunyai pelbagai fungsi dalam mengawal ekspresi gen.CircRNA boleh berfungsi sebagai ceRNA, yang mengikat miRNA secara kompetitif, dikenali sebagai span miRNA.Platform analisis penjujukan CircRNA memperkasakan analisis struktur dan ekspresi circRNA, ramalan sasaran dan analisis bersama dengan jenis molekul RNA yang lain
-
BSA
Platform Analisis Segregant Pukal terdiri daripada analisis standard satu langkah dan analisis lanjutan dengan tetapan parameter tersuai.BSA ialah teknik yang digunakan untuk mengenal pasti penanda genetik berkaitan fenotip dengan cepat.Aliran kerja utama BSA mengandungi: 1. memilih dua kumpulan individu dengan fenotip yang sangat bertentangan;2. mengumpulkan DNA, RNA atau SLAF-seq(Dibangunkan oleh Biomarker) semua individu untuk membentuk dua pukal DNA;3. mengenal pasti jujukan pembezaan terhadap genom rujukan atau di antaranya, 4. meramalkan kawasan yang dipautkan calon oleh ED dan algoritma indeks SNP;5. Analisis dan pengayaan fungsional pada gen di kawasan calon, dsb. Perlombongan yang lebih maju dalam data termasuk pemeriksaan penanda genetik dan reka bentuk primer juga tersedia.
