Transkriptom ialah pautan antara maklumat genetik genomik dan proteom fungsi biologi.Kawal selia tahap transkrip ialah mod kawal selia organisma yang paling penting dan paling banyak dikaji.Penjujukan transkriptom boleh menyusun transkrip pada bila-bila masa atau di bawah sebarang keadaan, dengan resolusi yang tepat kepada satu nukleotida. Ia boleh mencerminkan tahap transkripsi gen secara dinamik, pada masa yang sama mengenal pasti dan mengukur transkrip yang jarang dan normal, dan memberikan maklumat struktur contoh transkrip tertentu.
Pada masa ini, teknologi penjujukan transkrip telah digunakan secara meluas dalam agronomi, perubatan dan bidang penyelidikan lain, termasuk peraturan pembangunan haiwan dan tumbuhan, penyesuaian alam sekitar, interaksi imun, penyetempatan gen, evolusi genetik spesies dan pengesanan tumor dan penyakit genetik.
