● Wilayah Pengekodan Protein yang Disasarkan: dengan menangkap dan menyusun kawasan pengekodan protein, hWES digunakan untuk mendedahkan varian yang berkaitan dengan struktur protein;
● Ketepatan Tinggi: dengan kedalaman jujukan yang tinggi, hWES memudahkan pengesanan varian biasa dan varian jarang dengan frekuensi yang lebih rendah daripada 1%;
● Kos Berkesan: hWES menghasilkan kira-kira 85% mutasi penyakit manusia daripada 1% genom manusia;
● Lima prosedur QC yang ketat meliputi keseluruhan proses dengan Q30>85% dijamin.
Platform
| Perpustakaan
| Strategi Tangkapan Exon
| Mengesyorkan Strategi Penjujukan
|
Platform Illumina NovaSeq
| PE150 | Agilent SureSelect Human All Exon V6 IDT xGen Exome Hyb Panel V2 | 5 Gb 10 Gb |
Jenis Sampel
| Jumlah(Qubit® )
| Kelantangan
| penumpuan
| Kesucian(NanoDrop™ ) |
DNA genomik
| ≥ 300 ng | ≥ 15 μL | ≥ 20 ng/μL | OD260/280=1.8-2.0 tiada degradasi, tiada pencemaran
|
Untuk gangguan Mendelian/penyakit jarang berlaku: kedalaman penjujukan berkesan melebihi 50×
Untuk sampel tumor: kedalaman penjujukan berkesan melebihi 100×
1. Statistik penjajaran
Jadual 1 Statistik hasil peta
Jadual 2 Statistik tangkapan exome
2. Pengesanan Variasi
Rajah 1 Statistik SNV dan InDel
3.Analisis Lanjutan
Rajah 2 Plot Circos bagi SNV dan InDel berbahaya seluruh Genom
Jadual 3 Pemeriksaan gen penyebab penyakit