Kajian persatuan seluruh genom (GWAS) bertujuan untuk mengenal pasti varian genetik (genotip) yang dikaitkan dengan ciri tertentu (fenotip).Kajian GWA menyiasat penanda genetik merentas keseluruhan genom sejumlah besar individu dan meramalkan persatuan genotip-fenotip melalui analisis statistik pada peringkat populasi.Penjujukan semula genom keseluruhan berpotensi menemui semua varian genetik.Bergandingan dengan data fenotip, GWAS boleh diproses untuk mengenal pasti SNP berkaitan fenotip, QTL dan gen calon, yang menyokong pembiakan haiwan/tumbuhan moden dengan kuat.SLAF ialah strategi penjujukan genom dipermudah yang dibangunkan sendiri, yang menemui penanda teragih seluruh genom, SNP.SNP ini, sebagai penanda genetik molekul, boleh diproses untuk kajian persatuan dengan ciri yang disasarkan.Ia adalah strategi kos efektif dalam mengenal pasti ciri-ciri kompleks yang berkaitan dengan variasi genetik.
