Analisis Persatuan seluruh genom

Kajian persatuan seluruh genom (GWAS) bertujuan untuk mengenal pasti varian genetik (genotip) yang dikaitkan dengan ciri tertentu (fenotip).Kajian GWAS menyiasat penanda genetik merentas keseluruhan genom sejumlah besar individu dan meramalkan persatuan genotip-fenotip melalui analisis statistik pada peringkat populasi.Ia telah digunakan secara meluas dalam penyelidikan mengenai penyakit manusia dan perlombongan gen berfungsi pada sifat kompleks haiwan atau tumbuhan.

Hubungi Kami

Butiran Perkhidmatan

Keputusan Demo

Penerbitan Pilihan

1.Kelebihan Perkhidmatan

● Kes Projek yang Banyak: sejak penubuhannya pada 2009, BMKGENE telah menyelesaikan ratusan projek spesies dalam penyelidikan populasi GWAS, membantu penyelidik menerbitkan lebih daripada 100 artikel dan faktor impak terkumpul mencapai 500.
● Penganalisis profesional.
● Kitaran analisis pendek.
● Perlombongan data yang tepat.

2. Spesifikasi Perkhidmatan

taip	Skala Penduduk	Strategi dan kedalaman urutan
SLAF-GWAS	Nombor sampel ≥200	Saiz genom < 400M, dengan ref-genom, WGS disyorkan
		Saiz genom ≤ 1G, Teg 100K dan 10X
		1G ≤ Saiz genom ≤ 2G, 200K Teg dan 10X
		Saiz genom > 2G, 300K Tag dan 10X
WGS-GWAS	Nombor sampel ≥200	10X untuk setiap sampel

3. Pemilihan Bahan

Pelbagai jenis, subspesies, landraces/bank gen/keluarga campuran/sumber liar

Pelbagai jenis, subspesies, landraces

Keluarga separuh saudara/keluarga saudara penuh/sumber liar

4. Analisis Biomaklumat

● Analisis perkaitan seluruh genom
● Analisis dan saringan SNP penting
● Anotasi fungsi gen calon

5. Aliran Kerja Perkhidmatan

Reka bentuk eksperimen

Contoh penghantaran

Pengekstrakan RNA

Pembinaan perpustakaan

Sequencing

Analisis data

Perkhidmatan selepas jualan

Sebelumnya: Penjujukan RNA nukleus tunggal

Seterusnya:

a.QC fenotip

Histogram taburan kekerapan

Statistik fenotip

b.Analisis persatuan (Model: GEMMA, FaST-LMM, EMMAX)

Plot QQ

Plot Manhattan

tahun	Jurnal	IF	Tajuk
2022	NC	17.69	Asas genom bagi kromosom giga dan genom giga peony pokok Paeonia ostii
2015	NP	7.43	Jejak kaki domestik menambat kawasan genom yang mempunyai kepentingan agronomi dalam kacang soya
2018	MP	9.32	Penyusunan semula genom keseluruhan koleksi seluruh dunia aksesi rapeseed mendedahkan asas genetik perbezaan ekotaip mereka
2022	HR	7.29	Analisis perkaitan seluruh genom memberikan pandangan molekul ke dalam variasi semula jadi saiz biji tembikai