● Berbilang strategi penjujukan tersedia untuk matlamat penyelidikan yang berbeza
● Berpengalaman tinggi dalam pemasangan genom kulat dengan lebih 10,000 genom pene-lengkap dipasang.
● Pasukan sokongan teknikal selepas jualan profesional memenuhi keperluan penyelidikan yang lebih khusus.
Perkhidmatan | Strategi Penjujukan | Kualiti terjamin | Anggaran masa pusing balik |
Peta halus kulat | Illumina 50X+Nanopore 100X | Contig N50≥2 Mb | 35 hari bekerja |
PacBio HiFi 30X | |||
Peta lengkap pene kulat | Illumina 50X+Nanopore 100X(Pacbio HiFi 30X)+Hi-C 100X | Nisbah penambat kromosom >90% | 45 hari bekerja |
● Kawalan kualiti data mentah
● Pemasangan genom
● Analisis komponen genom
● Anotasi fungsi gen
● Analisis genomik perbandingan
Untukekstrak DNA:
Jenis Sampel | Jumlah | penumpuan | Kesucian |
ekstrak DNA | > 1.2 μg | > 20 ng/μl | OD260/280= 1.6-2.5 |
Untuk sampel tisu:
Jenis sampel | Rawatan sampel yang disyorkan | Penyimpanan dan penghantaran sampel |
Kulat Unisel | Perhatikan yis di bawah mikroskop dan kumpulkan yis dalam fasa eksponennya Pindahkan kultur (mengandungi lebih kurang 3-4.5e9 sel) ke dalam eppendorf 1.5 atau 2 ml.(Teruskan atas ais) Sentrifuge tiub selama 1 minit pada 14000 g untuk mengumpul bakteria dan mengeluarkan supernatan dengan berhati-hati Tutup tiub dan bekukan bakteria dalam nitrogen cecair sekurang-kurangnya 1-3 jam.Simpan tiub dalam peti sejuk -80 ℃. | Bekukan sampel dalam nitrogen cecair selama 3-4 jam dan simpan dalam nitrogen cecair atau -80 darjah untuk tempahan jangka panjang.Sampel penghantaran dengan ais kering diperlukan. |
Kulat Makro | Tisu dalam fasa pertumbuhan aktif adalah disyorkan. Bilas tisu dengan air bebas endotoksin, kemudian 70% eton. Simpan sampel dalam tiub krio. |
1. Gambar rajah Circos mengenai komponen genomik kulat
2.Analisis genomik perbandingan: Pokok filogenetik