BMKGENE menyediakan perkhidmatan penjujukan transkrip spatial untuk kajian "STEEL membolehkan persempadanan data transkrip spatiotemporal beresolusi tinggi", yang diterbitkan dalam Taklimat dalam Bioinformatik.
Kajian ini mencadangkan algoritma berasaskan pembelajaran tanpa pengawasan dan manifold, pengelompokan Spatial Transcriptome cEll typE (STEEL), yang mengenal pasti domain daripada transkrip spatial dengan mengelompokkan manik yang mempamerkan kedua-dua profil ekspresi gen yang sangat serupa dan jarak spatial yang dekat mengikut cara graf.
Penilaian komprehensif STEEL pada set data transkriptik spatial daripada platform 10X Visium menunjukkan bahawa ia bukan sahaja mencapai resolusi tinggi untuk mencirikan struktur halus otak tetikus tetapi juga membolehkan penyepaduan berbilang slaid tisu dianalisis secara individu kepada yang lebih besar.
Dengan kemajuan teknologi transkrip spatial, kaedah kami akan mempunyai kebolehgunaan yang hebat dalam pengenalan domain dan pembinaan semula atlas ekspresi gen.
klikdi siniuntuk mengetahui lebih lanjut tentang kajian ini.
Masa siaran: 20-Okt-2023