Selidiki potensi mengkaji kepelbagaian spesies penyelidikan liar, yang dicontohkan oleh kes penting daripada pelanggan BMKGENE.Baru-baru ini diterbitkan dalam Jurnal Bioteknologi Tumbuhan edisi tahun ini, artikel bertajuk "Genom Hevea brasiliensis Liar peringkat kromosom: Memperkasakan Pembiakan Berbantukan Genomik dan Mencungkil Loci Vital untuk Hasil Getah Tinggi" berdiri sebagai rujukan yang berharga.
Pokok getah Brazil (Hevea brasiliensis) berdiri tegak sebagai sumber getah asli yang penting.Sepanjang abad yang lalu, metodologi pembiakan tradisional mencetuskan lonjakan enam kali ganda yang luar biasa dalam pengeluaran getah.Namun, batuan dasar genetik yang bertanggungjawab terhadap potensi peningkatan hasil getah masih membingungkan.
Kajian ini memulakan pembinaan genom peringkat kromosom untuk pokok getah liar, menggunakan sinergi penjujukan bacaan lama Nanopore, penjujukan Illumina NGS, dan teknologi Hi-C.
Secara selari, kumpulan 147 sumber plasma nutfah, yang merangkumi variasi hasil tinggi, strain liar dan spesies yang berkaitan, telah dipasang untuk penjujukan semula genom keseluruhan (WGS) yang komprehensif menggunakan platform Illumina.Data penjujukan berikutnya menjalani analisis genetik populasi yang ketat, membolehkan pembelahan struktur populasi, kepelbagaian, dan ketidakseimbangan hubungan.Analisis ini memberi penerangan tentang variasi domestikasi merentas populasi.
Siasatan lanjut merangkumi analisis yang merangkumi Fst, π, Tajima's D, dan LD, bertujuan untuk mendedahkan isyarat pemilihan yang timbul daripada hasil lateks yang dipertingkatkan, terutamanya memfokuskan pada klon Wickham.
Memuncak dalam Analisis Persatuan Seluruh Genom (GWAS), penanda yang dikaitkan dengan ciri-ciri hasil dan seterusnya gen yang berkaitan dengan hasil telah ditunjuk.Pengesahan awal mendedahkan aktiviti transkrip yang tersendiri merentas mutan berbeza untuk dua gen ERF, memberikan gambaran awal tentang kepentingan fungsinya.Pengesahan selanjutnya dijadualkan dalam penyelidikan yang akan datang.
BMKGENE berbangga dalam menyumbang kepada penjujukan semula genom keseluruhan populasi yang besar ini, bersama-sama dengan peranan penting dalam analisis bioinformatik.Pengalaman luas kami merangkumi penjujukan NGS/TGS dan analisis bioinformatik multiomik merentas pelbagai 1000+ spesies.Kami menantikan prospek untuk bekerjasama dengan anda dalam projek anda yang akan datang.
Klik di sini untukmengetahui lebih lanjut mengenai kajian ini
Masa siaran: 29 Ogos 2023