Transkriptom Spatial BMKMANU S1000

Organisasi spatial sel memainkan peranan penting dalam pelbagai proses biologi, seperti penyusupan imun, perkembangan embrio, dan lain-lain. Penjujukan transkrip spatial, yang menunjukkan pemprofilan ekspresi gen sambil mengekalkan maklumat kedudukan ruang, telah memberikan pandangan yang hebat tentang seni bina tisu peringkat transkrip.Dengan perkembangan teknologi, morfologi tisu ultra-jelas dan perbezaan struktur sebenar ekspresi molekul spatial perlu dikaji dengan resolusi yang lebih tinggi.BMKGENE menyediakan perkhidmatan penjujukan transkrip spatial sehenti yang komprehensif daripada sampel kepada cerapan biologi.

Teknologi transkriptomi spatial memperkasakan perspektif baru dalam arena penyelidikan yang pelbagai dengan menyelesaikan profil ekspresi gen dengan kandungan spatial dalam sampel heterogen.

Cip transkrip spatial: BMKMANU S1000

Platform: Platform Illumina NovaSeq

Hubungi Kami

Butiran Perkhidmatan

Bioinformatik

Keputusan Demo

Skim Teknikal Transkriptom Spatial BMKMANU S1000

Kelebihan BMKMANU S1000

1) Resolusi sub-selular: Setiap kawasan tangkapan mengandungi >2 juta Bintik Barcode spatial dengan diameter 2.5 µm dan jarak 5 µm antara pusat spot, membolehkan analisis transkriptom spatial dengan resolusi sub-selular (5 µm).

2) Analisis resolusi pelbagai peringkat: Analisis pelbagai peringkat yang fleksibel antara 100 μm hingga 5 μm untuk menyelesaikan ciri tisu yang pelbagai pada resolusi yang optimum.

3) Pemprofilan transkrip yang komprehensif: Transkrip yang ditangkap daripada keseluruhan slaid tisu boleh dianalisis, tanpa sekatan pada bilangan gen sasaran dan kawasan sasaran.

Spesifikasi Perkhidmatan

Perpustakaan	Strategi urutan	Output Data disyorkan
Pustaka cDNA S1000	BMKMANU S1000-Illumina PE150	60Gb/sampel

Keperluan Sampel

Sampel	Nombor	Saiz	Kualiti RNA
blok tisu terbenam OCT	2-3 blok/ sampel	lebih kurang6.8x6.8x6.8 mm³	RIN≥7

Untuk butiran lanjut tentang panduan penyediaan sampel dan aliran kerja perkhidmatan, sila hubungi aPakar BMKGENE

Aliran Kerja Perkhidmatan

Reka bentuk eksperimen

Contoh penghantaran

Pra-eksperimen

Pengekodan bar ruang

Pembinaan perpustakaan

Sequencing

Analisis data

Perkhidmatan selepas jualan

Sebelumnya: 10x Transkriptom Spatial Visium Genomics

Seterusnya: Penjujukan Keseluruhan Genom Tumbuhan/Haiwan

Data yang dijana oleh BMKMANU S1000 dianalisis menggunakan perisian “BSTMatrix”, yang direka secara bebas oleh BMKGENE, termasuk:

1) Penjanaan matriks ekspresi gen
2) pemprosesan imej HE
3) Serasi dengan perisian pihak ketiga hiliran untuk analisis
4) "BSTViewer" dalam talian membantu untuk mendapatkan hasil visualisasi pada resolusi yang berbeza.

1. Pengelompokan titik

s1000 (4)