BMKCloud Log in
条形 बॅनर-03

उत्पादने

स्पेसिफिक-लोकस अॅम्प्लीफाइड फ्रॅगमेंट सिक्वेन्सिंग (SLAF-Seq)

उच्च-थ्रूपुट जीनोटाइपिंग, विशेषत: मोठ्या प्रमाणावरील लोकसंख्येवर, अनुवांशिक संबंध अभ्यासातील एक मूलभूत पायरी आहे, जी कार्यात्मक जनुक शोध, उत्क्रांती विश्लेषण इ. साठी अनुवांशिक आधार प्रदान करते. संपूर्ण जीनोम पुन्हा अनुक्रमित करण्याऐवजी, कमी प्रतिनिधित्व जीनोम अनुक्रम (RGS) ) अनुवांशिक मार्कर शोधावर वाजवी कार्यक्षमता राखून, प्रति नमुना अनुक्रम खर्च कमी करण्यासाठी सादर केला आहे.हे सामान्यतः दिलेल्या आकाराच्या श्रेणीमध्ये प्रतिबंध तुकडा काढण्याद्वारे प्राप्त केले जाते, ज्याला कमी प्रतिनिधित्व लायब्ररी (RRL) असे नाव दिले जाते.स्पेसिफिक-लोकस अॅम्प्लीफाइड फ्रॅगमेंट सिक्वेन्सिंग (SLAF-Seq) हे संदर्भ जीनोमसह किंवा त्याशिवाय SNP जीनोटाइपिंगसाठी स्वयं-विकसित धोरण आहे.
प्लॅटफॉर्म: Illumina NovaSeq प्लॅटफॉर्म


सेवा तपशील

डेमो परिणाम

वैशिष्ट्यीकृत प्रकाशने

सेवा तपशील

तांत्रिक योजना

111

कामाचा प्रवाह

流程图

सेवा फायदे

उच्च मार्कर शोध कार्यक्षमता- उच्च-थ्रूपुट सिक्वेन्सिंग तंत्रज्ञान SLAF-Seq ला संपूर्ण जीनोममधील शेकडो हजारो टॅग शोधण्यात मदत करते.

जीनोमवर कमी अवलंबित्व- हे संदर्भ जीनोमसह किंवा त्याशिवाय प्रजातींवर लागू केले जाऊ शकते.

लवचिक योजना डिझाइन- सिंगल-एंझाइम, ड्युअल-एंझाइम, मल्टी-एंझाईम पचन आणि विविध प्रकारचे एन्झाईम, सर्व भिन्न संशोधन लक्ष्य किंवा प्रजाती पूर्ण करण्यासाठी निवडले जाऊ शकतात.सिलिकोमधील पूर्व-मूल्यांकनाचा उपयोग चांगल्या एन्झाइम डिझाइनची खात्री देण्यासाठी केला जातो.

कार्यक्षम एंजाइमॅटिक पचन- परिस्थिती अनुकूल करण्यासाठी पूर्व-प्रयोग केला गेला, ज्यामुळे औपचारिक प्रयोग स्थिर आणि विश्वसनीय होतो.फ्रॅगमेंट संकलन कार्यक्षमता 95% पेक्षा जास्त साध्य करू शकते.

समान रीतीने वितरित SLAF टॅग- SLAF टॅग सर्व गुणसूत्रांमध्ये समान प्रमाणात वितरित केले जातात, ज्यामुळे सरासरी 1 SLAF प्रति 4 kb.

पुनरावृत्ती प्रभावी टाळणे- SLAF-Seq डेटामधील पुनरावृत्तीचा क्रम 5% पेक्षा कमी केला जातो, विशेषत: उच्च पातळीच्या पुनरावृत्ती असलेल्या प्रजातींमध्ये, जसे की गहू, मका इ.

व्यापक अनुभव- वनस्पती, सस्तन प्राणी, पक्षी, कीटक, एक्वा-जीव इत्यादी शेकडो प्रजातींवर 2000 हून अधिक बंद SLAF-Seq प्रकल्प.

स्वयं-विकसित जैव सूचनात्मक कार्यप्रवाह- अंतिम आउटपुटची विश्वासार्हता आणि अचूकता सुनिश्चित करण्यासाठी BMKGENE द्वारे SLAF-Seq साठी एकात्मिक जैव सूचनात्मक कार्यप्रवाह विकसित केला गेला.

 

सेवा तपशील

 

प्लॅटफॉर्म

Conc.(ng/gl)

एकूण (ug)

OD260/280

इलुमिना नोव्हासेक

>35

>१.६(खंड>15μl)

१.६-२.५

टीप: तीन नमुने, प्रत्येकी तीन एन्झाइम योजनांसह, पूर्व-प्रयोगासाठी सादर केले जातील.

शिफारस केलेली क्रमवारी धोरण

अनुक्रम खोली: 10X/टॅग

जीनोम आकार

शिफारस केलेले SLAF टॅग

< 500 Mb

100K किंवा WGS

500 Mb- 1 Gb

100 के

1 Gb -2 Gb

200 के

राक्षस किंवा जटिल जीनोम

300 - 400K

 

अर्ज

 

शिफारस केली

लोकसंख्या स्केल

 

अनुक्रम धोरण आणि खोली

 

खोली

 

टॅग क्रमांक

 

GWAS

 

नमुना क्रमांक ≥ 200

 

10X

 

 

 

 

 

त्यानुसार

जीनोम आकार

 

अनुवांशिक उत्क्रांती

 

प्रत्येकाच्या व्यक्ती

उपसमूह ≥ 10;

एकूण नमुने ≥ 30

 

10X

 

शिफारस केलेले नमुना वितरण

कंटेनर: 2 मिली सेंट्रीफ्यूज ट्यूब

बहुतेक नमुन्यांसाठी, आम्ही इथेनॉलमध्ये जतन न करण्याची शिफारस करतो.

नमुना लेबलिंग: नमुना माहिती फॉर्म सबमिट करण्यासाठी नमुने स्पष्टपणे लेबल केलेले आणि एकसारखे असणे आवश्यक आहे.

शिपमेंट: ड्राय-बर्फ: नमुने प्रथम पिशव्यामध्ये पॅक करणे आणि कोरड्या बर्फात पुरणे आवश्यक आहे.

सेवा कार्यप्रवाह

नमुना QC
पायलट प्रयोग
SLAF प्रयोग
लायब्ररीची तयारी
अनुक्रम
डेटा विश्लेषण
विक्रीनंतर सेवा

नमुना QC

पायलट प्रयोग

SLAF-प्रयोग

लायब्ररीची तयारी

अनुक्रम

डेटा विश्लेषण

विक्रीनंतरच्या सेवा


  • मागील:
  • पुढे:

  • 1. नकाशा निकालाची आकडेवारी

    प्रतिमा1

    A1

    2. SLAF मार्कर विकास

    A2

    3. भिन्नता भाष्य

    A3

    वर्ष

    जर्नल

    IF

    शीर्षक

    अर्ज

    2022

    निसर्ग संप्रेषण

    १७.६९४

    गीगा-क्रोमोसोमचा जीनोमिक आधार आणि ट्री पेनीचा गिगा-जीनोम

    Paeonia ostii

    SLAF-GWAS

    2015

    नवीन फायटोलॉजिस्ट

    ७.४३३

    मधील कृषिशास्त्रीय महत्त्व असलेल्या जीनोमिक क्षेत्रांना घरगुती पायाचे ठसे नांगरतात

    सोयाबीन

    SLAF-GWAS

    2022

    प्रगत संशोधन जर्नल

    १२.८२२

    G. हर्सुटममध्ये गॉसिपियम बार्बाडेन्सचे जीनोम-व्यापी कृत्रिम प्रवेश

    कापूस फायबर गुणवत्ता आणि उत्पन्नाच्या एकाच वेळी सुधारण्यासाठी उत्कृष्ट स्थान प्रकट करा

    वैशिष्ट्ये

    SLAF - उत्क्रांती आनुवंशिकी

    2019

    आण्विक वनस्पती

    १०.८१

    लोकसंख्या जीनोमिक विश्लेषण आणि डी नोव्हो असेंब्ली विडीचे मूळ प्रकट करते

    एक उत्क्रांतीवादी खेळ म्हणून तांदूळ

    SLAF - उत्क्रांती आनुवंशिकी

    2019

    नेचर जेनेटिक्स

    ३१.६१६

    सामान्य कार्प, सायप्रिनस कार्पिओचा जीनोम अनुक्रम आणि अनुवांशिक विविधता

    SLAF-लिंकेज नकाशा

    2014

    नेचर जेनेटिक्स

    २५.४५५

    लागवड केलेल्या शेंगदाण्याचे जीनोम शेंगाच्या कॅरिओटाइप, पॉलीप्लॉइडची अंतर्दृष्टी प्रदान करते

    उत्क्रांती आणि पीक पाळीवपणा.

    SLAF-लिंकेज नकाशा

    2022

    प्लांट बायोटेक्नॉलॉजी जर्नल

    ९.८०३

    ST1 ची ओळख बियाणे आकारविज्ञानाच्या हिचहाइकिंगचा समावेश असलेली निवड प्रकट करते

    आणि सोयाबीन पाळीव करताना तेलाचे प्रमाण

    SLAF-मार्कर विकास

    2022

    आंतरराष्ट्रीय आण्विक विज्ञान जर्नल

    ६.२०८

    गहू-लेयमस मॉलिस 2Ns (2D) साठी ओळख आणि डीएनए मार्कर विकास

    डिसोमिक क्रोमोसोम प्रतिस्थापन

    SLAF-मार्कर विकास

    एक कोट मिळवा

    तुमचा संदेश इथे लिहा आणि आम्हाला पाठवा

    तुमचा संदेश आम्हाला पाठवा: