केंद्रकांचे पृथक्करण 10× जीनोमिक्स क्रोमियमटीएम द्वारे साध्य केले जाते, ज्यामध्ये दुहेरी क्रॉसिंगसह आठ-चॅनेल मायक्रोफ्लुइडिक्स प्रणाली असते.या प्रणालीमध्ये, बारकोड आणि प्राइमर, एन्झाईम्स आणि सिंगल न्यूक्लियस असलेले जेल मणी नॅनोलिटर-आकाराच्या तेलाच्या थेंबात गुंतलेले असतात, जे जेल बीड-इन-इमल्शन (GEM) तयार करतात.एकदा जीईएम तयार झाल्यानंतर, सेल लिसिस आणि बारकोड सोडणे प्रत्येक जीईएममध्ये केले जाते.mRNA 10× बारकोड आणि UMI सह cDNA रेणूंमध्ये उलट लिप्यंतरण केले जाते, जे पुढे मानक अनुक्रमिक लायब्ररी बांधकामाच्या अधीन आहेत.
पेशी / ऊतक | कारण |
फ्रोझन टिश्यू अनफ्रेश करा | ताज्या किंवा दीर्घकाळ जतन केलेल्या संस्था मिळविण्यात अक्षम |
स्नायू पेशी, मेगाकारियोसाइट, चरबी… | इन्स्ट्रुमेंटमध्ये प्रवेश करण्यासाठी सेल व्यास खूप मोठा आहे |
यकृत… | खंडित करण्यासाठी खूप नाजूक, एकल पेशी वेगळे करण्यात अक्षम |
न्यूरॉन सेल, मेंदू… | अधिक संवेदनशील, तणावासाठी सोपे, अनुक्रम परिणाम बदलेल |
स्वादुपिंड, थायरॉईड… | अंतर्जात एन्झाइम्समध्ये समृद्ध, सिंगल सेल सस्पेंशनच्या उत्पादनावर परिणाम होतो |
सिंगल-न्यूक्लियस | सिंगल सेल |
अमर्यादित सेल व्यास | सेल व्यास: 10-40 μm |
साहित्य गोठलेले ऊतक असू शकते | सामग्री ताजे मेदयुक्त असणे आवश्यक आहे |
गोठलेल्या पेशींचा कमी ताण | एंजाइम उपचारामुळे सेल तणावाची प्रतिक्रिया होऊ शकते |
लाल रक्तपेशी काढून टाकण्याची गरज नाही | लाल रक्तपेशी काढून टाकणे आवश्यक आहे |
न्यूक्लियर बायोमाहिती व्यक्त करते | संपूर्ण पेशी जैव माहिती व्यक्त करते |
लायब्ररी | अनुक्रम धोरण | डेटा व्हॉल्यूम | नमुना आवश्यकता | मेदयुक्त |
10× जीनोमिक्स सिंगल-न्यूक्ली लायब्ररी | 10x जीनोमिक्स -इलुमिना पीई150 | 100,000 वाचन/सेल अंदाजे.100-200 Gb | सेल क्रमांक: >2×105 सेल conc.700-1,200 सेल/μL वर | ≥ 200 मिग्रॅ |
नमुना तयारी मार्गदर्शन आणि सेवा कार्यप्रवाह बद्दल अधिक तपशीलांसाठी, कृपया मोकळ्या मनाने अ शी बोलाBMKGENE तज्ञ
1.स्पॉट क्लस्टरिंग
2.मार्कर अभिव्यक्ती विपुलता क्लस्टरिंग हीटमॅप
3.मेकर जनुकांचे विविध क्लस्टर्समध्ये वितरण
4. सेल प्रक्षेपण विश्लेषण/स्यूडोटाइम