प्लॅटफॉर्म: Illumina NovaSeq प्लॅटफॉर्म, PE150
लायब्ररी प्रकार: 350bp घाला cDNA लायब्ररी (पीक वितरणावर अवलंबून)
अनुक्रम धोरण: पेअर-एंड 150 bp
शिफारस डेटा रक्कम: 2 Gb कच्चा डेटा/नमुना
(1) अनुक्रमण डेटा गुणवत्ता नियंत्रण: न्यूक्लियोटाइड वितरण, बेस गुणवत्ता वितरण, आरआरएनए गुणोत्तर मूल्यांकन;
(2) अनुक्रम संरेखन विश्लेषण: संरेखन परिणाम आकडेवारी, अनुक्रम संपृक्तता, अनुक्रम कव्हरेज;
(3) संदर्भ जीनोम भाष्य (NR, Swiss-Prot, Pfam, COG, GO, KEGG);
(4) अभिव्यक्ती विश्लेषण: अभिव्यक्ती वितरण (दोन किंवा अधिक नमुन्यांसह), नमुन्यांमधील अभिव्यक्तीचे विश्लेषण (वेन विश्लेषण, सहसंबंध विश्लेषण, पीसीए विश्लेषण);
(5) विभेदक अभिव्यक्ती विश्लेषण (दोन किंवा अधिक नमुन्यांसह);
(६) जनुक संच विश्लेषण: व्हेन विश्लेषण, क्लस्टर विश्लेषण, फंक्शन एनोटेशन विश्लेषण (COG, GO, KEGG), फंक्शन एनरिचमेंट विश्लेषण (GO, KEGG), फंक्शन एनरिचमेंट कॉर्डल आलेख, Ipath विश्लेषण;
(7) sRNA विश्लेषण: sRNA अंदाज, sRNA भाष्य (ब्लास्ट, sRNAMap, sRNATarBase, SIPHT, Rfam), sRNA दुय्यम संरचना अंदाज, sRNA लक्ष्य जनुक अंदाज;
(8) ट्रान्स्क्रिप्ट स्ट्रक्चर विश्लेषण: ऑपेरॉन विश्लेषण, ट्रान्सक्रिप्शन प्रारंभ आणि समाप्ती साइट्सचा अंदाज, UTR भाष्य आणि विश्लेषण, प्रमोटर अनुक्रम अंदाज, SNP/InDel विश्लेषण (SNP/InDel भाष्य, SNP/InDel प्रादेशिक वितरण, SNP आकडेवारी).