-
BSA
बल्क्ड सेग्रेगंट अॅनालिसिस प्लॅटफॉर्ममध्ये एक-चरण मानक विश्लेषण आणि सानुकूलित पॅरामीटर सेटिंगसह प्रगत विश्लेषण समाविष्ट आहे.BSA हे फिनोटाइपशी संबंधित अनुवांशिक मार्कर पटकन ओळखण्यासाठी वापरले जाणारे तंत्र आहे.BSA च्या मुख्य कार्यप्रवाहामध्ये हे समाविष्ट आहे: 1. अत्यंत विरोधी फिनोटाइप असलेल्या व्यक्तींचे दोन गट निवडणे;2. सर्व व्यक्तींचे DNA, RNA किंवा SLAF-seq (बायोमार्करने विकसित केलेले) एकत्र करून दोन मोठ्या प्रमाणात DNA तयार करणे;3. संदर्भ जीनोमच्या विरूद्ध किंवा दरम्यानच्या विभेदक अनुक्रमांची ओळख करणे, 4. ED आणि SNP-इंडेक्स अल्गोरिदमद्वारे उमेदवार जोडलेल्या प्रदेशांचा अंदाज लावणे;5. उमेदवार प्रदेशातील जनुकांवर कार्यात्मक विश्लेषण आणि संवर्धन इ. आनुवंशिक मार्कर स्क्रीनिंग आणि प्राइमर डिझाइनसह डेटामध्ये अधिक प्रगत खाणकाम देखील उपलब्ध आहे.
-
अँप्लिकॉन (16S/18S/ITS)
Amplicon (16S/18S/ITS) प्लॅटफॉर्म मायक्रोबियल विविधता प्रकल्प विश्लेषणाच्या अनेक वर्षांच्या अनुभवासह विकसित केले आहे, ज्यामध्ये प्रमाणित मूलभूत विश्लेषण आणि वैयक्तिक विश्लेषण समाविष्ट आहे: मूलभूत विश्लेषणामध्ये सध्याच्या सूक्ष्मजीव संशोधनाच्या मुख्य प्रवाहातील विश्लेषण सामग्रीचा समावेश आहे, विश्लेषण सामग्री समृद्ध आणि व्यापक आहे, आणि विश्लेषण परिणाम प्रकल्प अहवाल स्वरूपात सादर केले जातात;वैयक्तिक विश्लेषणाची सामग्री वैविध्यपूर्ण आहे.वैयक्तिक गरजा लक्षात घेऊन नमुने निवडले जाऊ शकतात आणि मूलभूत विश्लेषण अहवाल आणि संशोधन उद्देशानुसार पॅरामीटर्स लवचिकपणे सेट केले जाऊ शकतात.विंडोज ऑपरेटिंग सिस्टम, साधी आणि जलद.
-
उत्क्रांती आनुवंशिकी
उत्क्रांती आनुवंशिकी ही SNPs, InDels, SVs आणि CNVs सह अनुवांशिक भिन्नतेवर आधारित दिलेल्या सामग्रीच्या उत्क्रांतीविषयक माहितीचे सर्वसमावेशक अर्थ प्रदान करण्यासाठी डिझाइन केलेली एक पॅक सिक्वेन्सिंग सेवा आहे.हे उत्क्रांतीवादी बदल आणि लोकसंख्येच्या अनुवांशिक वैशिष्ट्यांचे वर्णन करण्यासाठी आवश्यक असलेले सर्व मूलभूत विश्लेषण प्रदान करते, जसे की लोकसंख्येची रचना, अनुवांशिक विविधता, फायलोजेनी संबंध, इ. यात जनुक प्रवाहावरील अभ्यास देखील समाविष्ट आहेत, जे प्रभावी लोकसंख्येच्या आकाराचे, विचलनाच्या वेळेचा अंदाज घेण्यास सक्षम करते.
-
तुलनात्मक जीनोमिक्स
तुलनात्मक जीनोमिक्सचा शाब्दिक अर्थ आहे भिन्न प्रजातींच्या संपूर्ण जीनोम अनुक्रम आणि संरचनांची तुलना करणे.या शिस्तीचे उद्दिष्ट प्रजाती उत्क्रांती, जनुक कार्य, जीनोम स्तरावर जनुक नियामक यंत्रणा प्रकट करणे हे अनुक्रम संरचना आणि घटक ओळखून विविध प्रजातींमध्ये संरक्षित किंवा वेगळे केले जाते.ठराविक तुलनात्मक जीनोमिक्स अभ्यासामध्ये जीन कुटुंबातील विश्लेषणे, उत्क्रांती विकास, संपूर्ण जीनोम डुप्लिकेशन, निवडक दाब इ.
-
उत्क्रांती आनुवंशिकी
लोकसंख्या आणि उत्क्रांती अनुवांशिक विश्लेषण प्लॅटफॉर्मची स्थापना बीएमके आर अँड डी टीममध्ये वर्षानुवर्षे जमा झालेल्या प्रचंड अनुभवाच्या आधारे केली जाते.हे विशेषत: बायोइन्फॉरमॅटिक्समध्ये प्रमुख नसलेल्या संशोधकांसाठी वापरकर्ता अनुकूल साधन आहे.हे प्लॅटफॉर्म फायलोजेनेटिक ट्री कन्स्ट्रक्शन, लिंकेज असमतोल विश्लेषण, अनुवांशिक विविधता मूल्यांकन, निवडक स्वीप विश्लेषण, नातेसंबंध विश्लेषण, PCA, लोकसंख्या संरचना विश्लेषण इत्यादीसह मूलभूत उत्क्रांती अनुवांशिकतेशी संबंधित मूलभूत विश्लेषण सक्षम करते.
-
हाय-सी आधारित जीनोम असेंब्ली
हाय-सी ही प्रोबिंग प्रॉक्सिमिटी-आधारित परस्परसंवाद आणि उच्च-थ्रूपुट अनुक्रम एकत्र करून गुणसूत्र कॉन्फिगरेशन कॅप्चर करण्यासाठी डिझाइन केलेली पद्धत आहे.या परस्परसंवादाची तीव्रता गुणसूत्रावरील भौतिक अंतराशी नकारात्मक संबंध असल्याचे मानले जाते.म्हणून, हाय-सी डेटा ड्राफ्ट जीनोममध्ये एकत्रित केलेल्या अनुक्रमांचे क्लस्टरिंग, क्रम आणि ओरिएंटिंग आणि विशिष्ट संख्येच्या गुणसूत्रांवर अँकरिंग करण्यासाठी मार्गदर्शन करू शकतो.हे तंत्रज्ञान लोकसंख्या-आधारित अनुवांशिक नकाशाच्या अनुपस्थितीत गुणसूत्र-स्तरीय जीनोम असेंब्ली सक्षम करते.प्रत्येक जीनोमला हाय-सी आवश्यक आहे.
प्लॅटफॉर्म: इलुमिना नोव्हासेक प्लॅटफॉर्म / DNBSEQ
-
वनस्पती/प्राणी डी नोव्हो जीनोम सिक्वेन्सिंग
डी नोव्होसिक्वेन्सिंग म्हणजे संदर्भ जीनोम नसतानाही, सिक्वेन्सिंग तंत्रज्ञान, उदा. PacBio, Nanopore, NGS, इ. वापरून प्रजातीच्या संपूर्ण जीनोमचे बांधकाम.तिसऱ्या पिढीच्या सिक्वेन्सिंग तंत्रज्ञानाच्या वाचनाच्या लांबीमध्ये उल्लेखनीय सुधारणा केल्यामुळे जटिल जीनोम एकत्र करण्यासाठी नवीन संधी उपलब्ध झाल्या आहेत, जसे की उच्च विषमता, पुनरावृत्ती क्षेत्रांचे उच्च गुणोत्तर, पॉलीप्लॉइड्स इ. पुनरावृत्ती घटकांचे निराकरण करणे, असामान्य GC सामग्री असलेले प्रदेश आणि इतर अत्यंत जटिल प्रदेश.
प्लॅटफॉर्म: PacBio सिक्वेल II / Nanopore PromethION P48 / Illumina NovaSeq प्लॅटफॉर्म
-
मानवी संपूर्ण एक्सोम सिक्वेन्सिंग
संपूर्ण एक्सोम सिक्वेन्सिंग (डब्ल्यूईएस) हा रोग-उद्भवणारे उत्परिवर्तन ओळखण्यासाठी एक किफायतशीर अनुक्रम धोरण मानला जातो.जरी एक्सॉन्स संपूर्ण जीनोमच्या केवळ अंदाजे 1.7% घेतात, तरीही ते एकूण प्रथिने कार्यांचे प्रोफाइल थेट दर्शवते.मानवी जीनोममध्ये, असे नोंदवले गेले आहे की 85% पेक्षा जास्त रोग संबंधित उत्परिवर्तन प्रथिने कोडिंग क्षेत्रामध्ये होतात.
BMKGENE विविध संशोधन उद्दिष्टे पूर्ण करण्यासाठी उपलब्ध विविध एक्सॉन कॅप्चरिंग धोरणांसह सर्वसमावेशक आणि लवचिक मानवी संपूर्ण एक्सोम सिक्वेन्सिंग सेवा देते.
प्लॅटफॉर्म: Illumina NovaSeq प्लॅटफॉर्म
-
स्पेसिफिक-लोकस अॅम्प्लीफाइड फ्रॅगमेंट सिक्वेन्सिंग (SLAF-Seq)
उच्च-थ्रूपुट जीनोटाइपिंग, विशेषत: मोठ्या प्रमाणावरील लोकसंख्येवर, अनुवांशिक संबंध अभ्यासातील एक मूलभूत पायरी आहे, जी कार्यात्मक जनुक शोध, उत्क्रांती विश्लेषण इ. साठी अनुवांशिक आधार प्रदान करते. संपूर्ण जीनोम पुन्हा अनुक्रमित करण्याऐवजी, कमी प्रतिनिधित्व जीनोम अनुक्रम (RGS) ) अनुवांशिक मार्कर शोधावर वाजवी कार्यक्षमता राखून, प्रति नमुना अनुक्रम खर्च कमी करण्यासाठी सादर केला आहे.हे सामान्यतः दिलेल्या आकाराच्या श्रेणीमध्ये प्रतिबंध तुकडा काढण्याद्वारे प्राप्त केले जाते, ज्याला कमी प्रतिनिधित्व लायब्ररी (RRL) असे नाव दिले जाते.स्पेसिफिक-लोकस अॅम्प्लीफाइड फ्रॅगमेंट सिक्वेन्सिंग (SLAF-Seq) हे संदर्भ जीनोमसह किंवा त्याशिवाय SNP जीनोटाइपिंगसाठी स्वयं-विकसित धोरण आहे.
प्लॅटफॉर्म: Illumina NovaSeq प्लॅटफॉर्म -
इलुमिना आणि बीजीआय
इलुमिना सिक्वेन्सिंग तंत्रज्ञान, सिक्वेन्सिंग बाय सिंथेसिस (SBS) वर आधारित, हे जागतिक स्तरावर स्वीकारलेले NGS नावीन्य आहे, जे जगातील 90% पेक्षा जास्त अनुक्रम डेटा तयार करण्यासाठी जबाबदार आहे.SBS च्या तत्त्वामध्ये इमेजिंग फ्लोरोसेंटली लेबल केलेले रिव्हर्सिबल टर्मिनेटर समाविष्ट आहे कारण प्रत्येक dNTP जोडला जातो आणि नंतर पुढील बेसच्या समावेशास अनुमती देण्यासाठी क्लीव्ह केले जाते.प्रत्येक अनुक्रम चक्रामध्ये सर्व चार उलट करता येण्याजोगे टर्मिनेटर-बाउंड डीएनटीपी उपस्थित असल्याने, नैसर्गिक स्पर्धा निगमन पूर्वाग्रह कमी करते.हे अष्टपैलू तंत्रज्ञान एकल-वाचनीय आणि पेअर-एंड लायब्ररींना समर्थन देते, जीनोमिक ऍप्लिकेशन्सची श्रेणी पुरवते.इल्युमिना सिक्वेन्सिंगची उच्च-थ्रूपुट क्षमता आणि अचूकता याला जीनोमिक्स संशोधनातील आधारस्तंभ म्हणून स्थान देते, शास्त्रज्ञांना अतुलनीय तपशील आणि कार्यक्षमतेसह जीनोमची गुंतागुंत उलगडण्यास सक्षम करते.
DNBSEQ, BGI ने विकसित केलेले, हे आणखी एक नाविन्यपूर्ण NGS तंत्रज्ञान आहे ज्याने अनुक्रमिक खर्च आणखी कमी केला आणि थ्रुपुट वाढवला.DNBSEQ लायब्ररीच्या तयारीमध्ये DNA फ्रॅगमेंटेशन, ssDNA तयार करणे आणि DNA नॅनोबॉल्स (DNB) मिळविण्यासाठी रोलिंग सर्कल अॅम्प्लिफिकेशन यांचा समावेश होतो.हे नंतर घन पृष्ठभागावर लोड केले जातात आणि नंतर कॉम्बिनेटोरियल प्रोब-अँकर सिंथेसिस (cPAS) द्वारे अनुक्रमित केले जातात.
आमची प्री-मेड लायब्ररी सिक्वेन्सिंग सेवा ग्राहकांना विविध स्रोतांमधून (mRNA, संपूर्ण जीनोम, amplicon, इतर) मधून त्यांची अनुक्रमिक लायब्ररी तयार करण्यात मदत करते.त्यानंतर, ही लायब्ररी इलुमिना किंवा BGI प्लॅटफॉर्ममध्ये गुणवत्ता नियंत्रण आणि अनुक्रमासाठी आमच्या अनुक्रमण केंद्रांवर पाठविली जाऊ शकते.
