-
सिंगल- न्यूक्लियस आरएनए सिक्वेन्सिंग
सिंगल सेल कॅप्चरिंग आणि वैयक्तिक लायब्ररी बांधकाम तंत्रात प्रगती उच्च-थ्रूपुट सिक्वेन्सिंगसह एकत्रित केल्याने सेल-बाय-सेल आधारावर जनुक अभिव्यक्तीचा अभ्यास करता येतो.हे जटिल पेशींच्या लोकसंख्येवर एक सखोल आणि संपूर्ण प्रणाली विश्लेषण सक्षम करते, ज्यामध्ये ते सर्व पेशींची सरासरी घेऊन त्यांच्या विषमतेचे मुखवटा टाळते.
तथापि, काही पेशी सिंगल-सेल सस्पेंशनमध्ये बनविण्यास योग्य नाहीत, म्हणून इतर नमुना तयार करण्याच्या पद्धती - ऊतींमधून न्यूक्लियस काढणे आवश्यक आहे, म्हणजेच, न्यूक्लियस थेट ऊतक किंवा पेशींमधून काढले जाते आणि एकल-केंद्रीय निलंबनामध्ये तयार केले जाते. सेल अनुक्रम.
BMK 10× Genomics ChromiumTM आधारित सिंगल-सेल RNA सिक्वेन्सिंग सेवा प्रदान करते.रोगाशी संबंधित अभ्यास, जसे की रोगप्रतिकारक पेशी भिन्नता, ट्यूमर विषमता, ऊतक विकास इ.
अवकाशीय ट्रान्सक्रिप्टोम चिप: 10× जीनोमिक्स
प्लॅटफॉर्म: Illumina NovaSeq प्लॅटफॉर्म
-
वनस्पती/प्राणी संपूर्ण जीनोम अनुक्रमणिका
संपूर्ण जीनोम री-सिक्वेंसिंग, ज्याला WGS असेही म्हणतात, सिंगल न्यूक्लियोटाइड पॉलिमॉर्फिज्म (SNP), इन्सर्शन डिलीशन (InDel), स्ट्रक्चर व्हेरिएशन (SV), आणि कॉपी नंबर व्हेरिएशन (CNV) यासह संपूर्ण जीनोमवरील सामान्य आणि दुर्मिळ दोन्ही उत्परिवर्तन उघड करण्यास सक्षम करते. ).SVs SNPs पेक्षा भिन्नता बेसचा एक मोठा भाग बनवतात आणि त्यांचा जीनोमवर जास्त प्रभाव असतो, ज्याचा सजीवांवर लक्षणीय परिणाम होतो.लाँग-रीड रिक्वेंसिंग मोठ्या तुकड्यांची आणि गुंतागुंतीची भिन्नता अधिक अचूक ओळखण्यास अनुमती देते कारण दीर्घ वाचनामुळे टॅन्डम रिपीट, GC/AT-समृद्ध प्रदेश आणि हायपर-व्हेरिएबल प्रदेश यांसारख्या क्लिष्ट प्रदेशांवर गुणसूत्र ओलांडणे खूप सोपे होते.
प्लॅटफॉर्म: Illumina, PacBio, Nanopore
-
BMKMANU S1000 Spatial Transscriptome
अवकाशीय ट्रान्स्क्रिप्टॉमिक्स हे वैज्ञानिक नवोपक्रमात आघाडीवर आहे, संशोधकांना त्यांचे अवकाशीय संदर्भ जपून टिशूंमधील गुंतागुंतीच्या जनुक अभिव्यक्ती नमुन्यांचा शोध घेण्यास सक्षम करते.विविध प्लॅटफॉर्ममध्ये, BMKGene ने BMKManu S1000 Spatial Transscriptome चिप विकसित केली आहे, ज्याचा अभिमान आहेवर्धित रिझोल्यूशन5µM चे, सबसेल्युलर श्रेणीपर्यंत पोहोचणे आणि सक्षम करणेबहु-स्तरीय रिझोल्यूशन सेटिंग्ज.S1000 चिप, अंदाजे 2 दशलक्ष स्पॉट्स वैशिष्ट्यीकृत, स्थानिक बारकोडेड कॅप्चर प्रोबसह लोड केलेल्या मणीसह स्तरित मायक्रोवेल्स वापरते.स्थानिक बारकोडसह समृद्ध असलेली एक cDNA लायब्ररी, S1000 चिप वरून तयार केली जाते आणि त्यानंतर Illumina NovaSeq प्लॅटफॉर्मवर अनुक्रमित केली जाते.अवकाशीय बारकोड केलेले नमुने आणि UMI चे संयोजन व्युत्पन्न केलेल्या डेटाची अचूकता आणि विशिष्टता सुनिश्चित करते.BMKManu S1000 चीपची अद्वितीय विशेषता त्याच्या अष्टपैलुत्वामध्ये आहे, बहु-स्तरीय रिझोल्यूशन सेटिंग्ज ऑफर करते जी विविध टिश्यूज आणि तपशीलांच्या स्तरांवर बारीकपणे ट्यून केली जाऊ शकते.ही अनुकूलता चिपला विविध अवकाशीय ट्रान्सक्रिप्टॉमिक्स अभ्यासासाठी उत्कृष्ट पर्याय म्हणून स्थान देते, कमीतकमी आवाजासह अचूक अवकाशीय क्लस्टरिंग सुनिश्चित करते.
BMKManu S1000 चिप आणि इतर अवकाशीय ट्रान्स्क्रिप्टॉमिक्स तंत्रज्ञानाचा वापर करून, संशोधक पेशींच्या अवकाशीय संघटनेची आणि ऊतींमध्ये होणार्‍या जटिल आण्विक परस्परसंवादाबद्दल अधिक चांगल्या प्रकारे समजून घेऊ शकतात, ज्यामुळे विविध क्षेत्रांमध्ये जैविक प्रक्रियांच्या अंतर्निहित यंत्रणेबद्दल अमूल्य अंतर्दृष्टी मिळते. ऑन्कोलॉजी, न्यूरोसायन्स, डेव्हलपमेंटल बायोलॉजी, इम्युनोलॉजी आणि वनस्पतिशास्त्र अभ्यास.
प्लॅटफॉर्म: BMKManu S1000 चिप आणि Illumina NovaSeq
-
10x जीनोमिक्स व्हिजियम स्पेशियल ट्रान्सक्रिप्टोम
अवकाशीय ट्रान्सक्रिप्टॉमिक्स हे एक अत्याधुनिक तंत्रज्ञान आहे जे संशोधकांना त्यांचे अवकाशीय संदर्भ जपून ऊतींमधील जनुक अभिव्यक्ती नमुन्यांची तपासणी करण्यास अनुमती देते.या डोमेनमधील एक शक्तिशाली प्लॅटफॉर्म म्हणजे 10x जेनोमिक्स व्हिजिअम आणि इलुमिना सिक्वेन्सिंग.10X व्हिजिअमचे तत्त्व एका विशिष्ट चिपवर आहे ज्यामध्ये एक नियुक्त कॅप्चर क्षेत्र आहे जेथे ऊतक विभाग ठेवलेले आहेत.या कॅप्चर क्षेत्रामध्ये बारकोड केलेले स्पॉट्स असतात, प्रत्येक टिश्यूमधील एका अद्वितीय अवकाशीय स्थानाशी संबंधित असतात.रिव्हर्स ट्रान्सक्रिप्शन प्रक्रियेदरम्यान टिश्यूमधून कॅप्चर केलेले आरएनए रेणू नंतर अद्वितीय आण्विक अभिज्ञापक (यूएमआय) सह लेबल केले जातात.हे बारकोड केलेले स्पॉट्स आणि UMIs अचूक स्थानिक मॅपिंग आणि एकल-सेल रिझोल्यूशनवर जनुक अभिव्यक्तीचे प्रमाणीकरण सक्षम करतात.अवकाशीय बारकोड केलेले नमुने आणि UMI चे संयोजन व्युत्पन्न केलेल्या डेटाची अचूकता आणि विशिष्टता सुनिश्चित करते.या अवकाशीय ट्रान्सक्रिप्टॉमिक्स तंत्रज्ञानाचा वापर करून, संशोधक पेशींच्या अवकाशीय संघटनेची आणि ऊतींमध्ये होणार्‍या जटिल आण्विक परस्परसंवादाची सखोल माहिती मिळवू शकतात, ऑन्कोलॉजी, न्यूरोसायन्स, डेव्हलपमेंटल बायोलॉजी, इम्युनोलॉजी यासह अनेक क्षेत्रांमध्ये जैविक प्रक्रियांच्या अंतर्निहित यंत्रणेबद्दल अमूल्य अंतर्दृष्टी देऊ शकतात. , आणि वनस्पतिशास्त्र अभ्यास.
प्लॅटफॉर्म: 10X जीनोमिक्स व्हिजियम आणि इलुमिना नोव्हासेक
-
पूर्ण-लांबीचे mRNA अनुक्रम-नॅनोपोर
NGS-आधारित mRNA अनुक्रम जनुक अभिव्यक्ती प्रमाणीकरणासाठी एक अष्टपैलू साधन म्हणून काम करते, तर लहान वाचनांवर त्याचा अवलंबित्व जटिल ट्रान्सक्रिप्टोमिक विश्लेषणांमध्ये त्याची परिणामकारकता मर्यादित करते.नॅनोपोर सिक्वेन्सिंग, दुसरीकडे, दीर्घ-वाचनीय तंत्रज्ञानाचा वापर करते, पूर्ण-लांबीच्या mRNA प्रतिलेखांचे अनुक्रम सक्षम करते.हा दृष्टीकोन पर्यायी स्प्लिसिंग, जीन फ्यूजन, पॉली-एडेनिलेशन आणि mRNA isoforms च्या प्रमाणीकरणाचा व्यापक शोध सुलभ करतो.
नॅनोपोर सिक्वेन्सिंग नॅनोपोर सिंगल-मॉलिक्युल रिअल-टाइम इलेक्ट्रिकल सिग्नलवर अवलंबून असते.मोटर प्रथिनांच्या मार्गदर्शनाखाली, दुहेरी अडकलेला DNA बायोफिल्ममध्ये एम्बेड केलेल्या नॅनोपोर प्रथिनांशी बांधला जातो, जेव्हा तो व्होल्टेजच्या फरकाखाली नॅनोपोर चॅनेलमधून जातो तेव्हा तो बंद होतो.DNA स्ट्रँडवर वेगवेगळ्या पायांद्वारे व्युत्पन्न केलेले विशिष्ट विद्युत सिग्नल रीअल-टाइममध्ये शोधले जातात आणि त्यांचे वर्गीकरण केले जाते, अचूक आणि सतत न्यूक्लियोटाइड अनुक्रम सुलभ करते.हा अभिनव दृष्टीकोन अल्प-वाचण्याच्या मर्यादांवर मात करतो आणि क्लिष्ट जीनोमिक विश्लेषणासाठी डायनॅमिक प्लॅटफॉर्म प्रदान करतो, ज्यामध्ये जटिल ट्रान्सक्रिप्टॉमिक अभ्यासांचा समावेश होतो.
प्लॅटफॉर्म: नॅनोपोर प्रोमेथिऑन P48
-
पूर्ण-लांबीचे mRNA अनुक्रम -PacBio
NGS-आधारित mRNA अनुक्रम हे जनुक अभिव्यक्तीचे प्रमाण निश्चित करण्यासाठी एक बहुमुखी साधन आहे, परंतु लहान वाचनांवर त्याचा अवलंबित्व जटिल ट्रान्सक्रिप्टोमिक विश्लेषणांमध्ये त्याचा वापर प्रतिबंधित करते.दुसरीकडे PacBio सिक्वेन्सिंग (Iso-Seq), पूर्ण-लांबीच्या mRNA प्रतिलेखांचे अनुक्रम सक्षम करून, दीर्घ-वाचनीय तंत्रज्ञान वापरते.हा दृष्टीकोन पर्यायी स्प्लिसिंग, जीन फ्यूजन आणि पॉली-एडेनिलेशनचा सर्वसमावेशक शोध सुलभ करतो, जरी हा जनुक अभिव्यक्ती प्रमाणीकरणासाठी प्राथमिक पर्याय नसला तरी, आवश्यक डेटाच्या मोठ्या प्रमाणामुळे.
PacBio सिक्वेन्सिंग तंत्रज्ञान सिंगल-मॉलिक्युल, रीअल-टाइम (SMRT) सिक्वेन्सिंगवर अवलंबून आहे, जे पूर्ण-लांबीच्या mRNA ट्रान्सक्रिप्ट्स कॅप्चर करण्यात एक वेगळा फायदा प्रदान करते.या नाविन्यपूर्ण पध्दतीमध्ये शून्य-मोड वेव्हगाइड्स (ZMWs), मायक्रोफॅब्रिकेटेड विहिरींचा वापर समाविष्ट आहे जे अनुक्रम दरम्यान डीएनए पॉलिमरेझ क्रियाकलापांचे वास्तविक-वेळ निरीक्षण करण्यास सक्षम करतात.या ZMWs मध्ये, PacBio चे DNA पॉलिमरेझ DNA च्या पूरक स्ट्रँडचे संश्लेषण करते, जे संपूर्ण mRNA प्रतिलेखांमध्ये पसरलेले दीर्घ वाचन तयार करते.सर्कुलर कन्सेन्सस सिक्वेन्सिंग (CCS) मोडमधील PacBio ऑपरेशन समान रेणू वारंवार अनुक्रम करून अचूकता वाढवते.व्युत्पन्न केलेल्या HiFi रीड्समध्ये NGS शी तुलना करता येण्याजोगी अचूकता आहे, पुढे जटिल ट्रान्सक्रिप्टोमिक वैशिष्ट्यांच्या सर्वसमावेशक आणि विश्वासार्ह विश्लेषणामध्ये योगदान देते.प्लॅटफॉर्म: PacBio सिक्वेल II
-
युकेरियोटिक एमआरएनए सिक्वेन्सिंग-इलुमिना
mRNA अनुक्रमणिका विशिष्ट परिस्थितीत पेशींमधील सर्व mRNA प्रतिलेखांच्या सर्वसमावेशक प्रोफाइलिंगला सक्षम करते.हे अत्याधुनिक तंत्रज्ञान एक शक्तिशाली साधन म्हणून काम करते, विविध जैविक प्रक्रियांशी संबंधित जटिल जनुक अभिव्यक्ती प्रोफाइल, जनुक संरचना आणि आण्विक यंत्रणा उघड करते.मूलभूत संशोधन, क्लिनिकल डायग्नोस्टिक्स आणि ड्रग डेव्हलपमेंटमध्ये व्यापकपणे स्वीकारले गेलेले, mRNA अनुक्रम सेल्युलर डायनॅमिक्स आणि अनुवांशिक नियमनाच्या गुंतागुंतीमध्ये अंतर्दृष्टी देते.
प्लॅटफॉर्म: Illumina NovaSeq X
-
गैर-संदर्भ आधारित mRNA सिक्वेन्सिंग-इलुमिना
mRNA अनुक्रमणिका विशिष्ट परिस्थितीत पेशींमधील सर्व mRNA प्रतिलेखांच्या सर्वसमावेशक प्रोफाइलिंगला सक्षम करते.हे अत्याधुनिक तंत्रज्ञान एक शक्तिशाली साधन म्हणून काम करते, विविध जैविक प्रक्रियांशी संबंधित जटिल जनुक अभिव्यक्ती प्रोफाइल, जनुक संरचना आणि आण्विक यंत्रणा उघड करते.मूलभूत संशोधन, क्लिनिकल डायग्नोस्टिक्स आणि ड्रग डेव्हलपमेंटमध्ये व्यापकपणे स्वीकारले गेलेले, mRNA अनुक्रम सेल्युलर डायनॅमिक्स आणि अनुवांशिक नियमनाच्या गुंतागुंतीमध्ये अंतर्दृष्टी देते.
प्लॅटफॉर्म: Illumina NovaSeq X
-
लांब नॉन-कोडिंग अनुक्रम-इलुमिना
लाँग नॉन-कोडिंग RNAs (lncRNAs) हे 200 nucleotides पेक्षा मोठे RNA असतात ज्यात किमान कोडींग क्षमता असते आणि ते नॉन-कोडिंग RNA मध्ये महत्त्वाचे घटक असतात.न्यूक्लियस आणि सायटोप्लाझममध्ये आढळणारे, हे आरएनए एपिजेनेटिक, ट्रान्सक्रिप्शनल आणि पोस्ट-ट्रान्सक्रिप्शनल रेग्युलेशनमध्ये महत्त्वपूर्ण भूमिका बजावतात, सेल्युलर आणि आण्विक प्रक्रियांना आकार देण्यामध्ये त्यांचे महत्त्व अधोरेखित करतात.LncRNA अनुक्रम हे सेल डिफरेंशन, ऑन्टोजेनेसिस आणि मानवी रोगांचे एक शक्तिशाली साधन आहे.
प्लॅटफॉर्म: Illumina NovaSeq
-
लहान आरएनए अनुक्रम-इलुमिना
लहान RNA (sRNA) रेणू, विशेषत: लांबीच्या 200 न्यूक्लियोटाइड्सपेक्षा कमी, मायक्रोआरएनए (miRNAs), लहान हस्तक्षेप करणारे RNAs (siRNAs), आणि piwi-interacting RNAs (piRNAs) यांचा समावेश होतो.यापैकी, miRNAs, सुमारे 20-24 न्यूक्लियोटाइड्स लांब, विविध सेल्युलर प्रक्रियांमध्ये त्यांच्या महत्त्वपूर्ण नियामक भूमिकांसाठी विशेषतः उल्लेखनीय आहेत.टिश्यू-विशिष्ट आणि स्टेज-विशिष्ट अभिव्यक्ती नमुन्यांसह, miRNAs विविध प्रजातींमध्ये उच्च संवर्धन प्रदर्शित करतात.
प्लॅटफॉर्म: Illumina NovaSeq
-
circRNA अनुक्रम-इलुमिना
वर्तुळाकार आरएनए सिक्वेन्सिंग (circRNA-seq) म्हणजे वर्तुळाकार RNA चे प्रोफाइल आणि विश्लेषण करणे, RNA रेणूंचा एक वर्ग जो नॉन-कॅनोनिकल स्प्लिसिंग इव्हेंट्समुळे बंद लूप बनवतो, ज्यामुळे या RNA वाढीव स्थिरता मिळते.काही circRNAs microRNA स्पंज म्हणून काम करतात, microRNAs वेगळे करतात आणि त्यांना त्यांच्या लक्ष्य mRNA चे नियमन करण्यापासून प्रतिबंधित करतात असे दर्शविले गेले आहे, तर इतर circRNA प्रथिनांशी संवाद साधू शकतात, जनुक अभिव्यक्ती सुधारू शकतात किंवा सेल्युलर प्रक्रियेत त्यांची भूमिका असू शकते.circRNA अभिव्यक्ती विश्लेषण या रेणूंच्या नियामक भूमिका आणि विविध सेल्युलर प्रक्रिया, विकासाचे टप्पे आणि रोग परिस्थितींमध्ये त्यांचे महत्त्व याबद्दल अंतर्दृष्टी प्रदान करते, जीन अभिव्यक्तीच्या संदर्भात RNA नियमनाच्या जटिलतेच्या सखोल समजून घेण्यास योगदान देते.
-
संपूर्ण ट्रान्सक्रिप्टोम सिक्वेन्सिंग - इलुमिना
संपूर्ण ट्रान्सक्रिप्टोम सिक्वेन्सिंग विविध आरएनए रेणूंच्या प्रोफाइलिंगसाठी एक व्यापक दृष्टीकोन प्रदान करते, ज्यामध्ये कोडिंग (mRNA) आणि नॉन-कोडिंग RNAs (lncRNA, circRNA आणि miRNA) दोन्ही समाविष्ट आहेत.हे तंत्र दिलेल्या क्षणी विशिष्ट पेशींचे संपूर्ण ट्रान्सक्रिप्टम कॅप्चर करते, ज्यामुळे सेल्युलर प्रक्रियेची समग्र समज मिळते."एकूण RNA अनुक्रम" म्हणूनही ओळखले जाते, हे ट्रान्सक्रिप्टोम स्तरावर क्लिष्ट नियामक नेटवर्कचे अनावरण करण्याचे उद्दिष्ट ठेवते, स्पर्धात्मक अंतर्जात RNA (ceRNA) आणि संयुक्त RNA विश्लेषण यासारखे सखोल विश्लेषण सक्षम करणे.विशेषत: circRNA-miRNA-mRNA-आधारित ceRNA परस्परसंवादांचा समावेश असलेल्या नियामक नेटवर्कचा उलगडा करण्यासाठी हे कार्यात्मक वैशिष्ट्यीकरणाच्या दिशेने प्रारंभिक पाऊल चिन्हांकित करते.
