वनस्पती/प्राणी संपूर्ण जीनोम अनुक्रमणिका
1.सेवा फायदे
1000 पेक्षा जास्त प्रजातींसाठी जीनोम सिक्वेन्सिंगचा विस्तृत अनुभव.
4000 हून अधिक संचयी प्रभाव घटकांसह 800 हून अधिक प्रकाशित प्रकरणे.
व्हेरिएशन कॉलिंग आणि फंक्शन अॅनालिसिसवर सर्वसमावेशक बायोइन्फॉरमॅटिक्स विश्लेषण.
2. सेवा तपशील
| प्लॅटफॉर्म | लायब्ररी | शिफारस केलेली seq खोली | |
| इल्युमिना | PE 150 | SNP साठी, InDel कॉलिंग ≥ 10x SV साठी, CNY कॉलिंग ≥ 30x
| |
| नानोपोर
| 8 kb | SV साठी, CNY कॉलिंग ≥ 20x | |
| पॅकबिओ | CCS | 15 kb | SNP, InDel, SV, CNY कॉलिंग ≥ 10x साठी |
3. नमुना आवश्यकता
| प्लॅटफॉर्म | conc.(ng/μL)
| रक्कम (एनजी)
| पवित्रता
| ऍग्रोज जेल
| ||
| OD260/280 | OD260/230 | 1. मुख्य बँड नाही किंवा मर्यादित साफ कराजेलवर ऱ्हास दिसून आला. 2. नाही किंवा मर्यादित RNA किंवा प्रथिने दूषित
| ||||
| इल्युमिना | ≥१ | ≥३०
| - | - | ||
| नानोपोर
| ≥३० | डेटा उत्पन्नावर अवलंबून आहे 10μg/सेल | १.७-२.२ | ≥१.५ | ||
| पॅकबिओ | CCS | ≥५० | १.७-२.२ | 1.8-2.5 | ||
4. जैव माहिती विश्लेषण
5. सेवा कार्य प्रवाह
नमुना वितरण
डीएनए काढणे
ग्रंथालय बांधकाम
अनुक्रम
डेटा विश्लेषण
डेटा वितरण
1) जीनोम मॅपिंगची आकडेवारी
तक्ता 1 मॅपिंग निकालाची आकडेवारी
आकृती 1 घाला आकार आणि वाचन कव्हरेजचे वितरण.
२) वैरिएट डिटेक्शन
आकृती 2 नमुन्यांमधील SNP/INDEL/SV ची आकडेवारी आणि भाष्य
आकृती 3 जीनोम-विस्तृत वितरण
3) भिन्नतेचे कार्यात्मक भाष्य
| 2019 | निसर्ग संप्रेषण | संपूर्ण-जीनोम रिक्वेंसिंग ब्रॅसिका नॅपस मूळ आणि त्याच्या सुधारणेमध्ये गुंतलेली अनुवांशिक लोकी प्रकट करते |
| 2020 | PNAS | गोल्डफिश (कॅरॅसियस ऑरॅटस) चे उत्क्रांती मूळ आणि पाळीव इतिहास |
| 2021 | प्लांट बायोटेक्नॉलॉजी जर्नल | दोन लागवड केलेल्या ताग प्रजातींचे संदर्भ जीनोम |
| 2021 | प्लांट बायोटेक्नॉलॉजी जर्नल | भाजीपाला आणि तेलबिया अॅलोपॉलीप्लॉइड ब्रॅसिकाजुन्सिया आणि ग्लुकोसिनोलेट्सचे संचय नियंत्रित करणारे अनुवांशिक लोकी यांच्या जीनोमिक स्वाक्षरी |
| 2019 | आण्विक वनस्पती | रेपसीड ऍक्सेसन्सच्या जगभरातील संग्रहाचे संपूर्ण-जीनोम रिसक्वेंसिंग त्यांच्या इकोटाइप विचलनाचा अनुवांशिक आधार प्रकट करते |
| 2022 | फलोत्पादन संशोधन | जीनोम-वाइड असोसिएशन विश्लेषण टरबूज बियाण्याच्या आकाराच्या नैसर्गिक भिन्नतेबद्दल आण्विक अंतर्दृष्टी प्रदान करते |
| 2021 | जर्नल ऑफ एक्सपेरिमेंटल बॉटनी | जीनोम-वाइड असोसिएशन स्टडी GhSAD1 चे प्रकार ओळखतात जे कापसात थंड सहिष्णुता देतात |
| 2021 | जर्नल ऑफ एक्सपेरिमेंटल बॉटनी | जीनोम-वाइड असोसिएशन अभ्यास आणि ट्रान्सक्रिप्टोम तुलना कादंबरी QTL आणि उमेदवार जीन्स प्रकट करतात जे रेपसीडमध्ये पाकळ्या आकार नियंत्रित करतात |
