जीनोम क्रम जागतिक विखुरण्याचे मार्ग प्रकट करतात आणि समुद्री घोडे उत्क्रांतीमध्ये अभिसरण अनुवांशिक रूपांतर सुचवतात

जीनोम उत्क्रांती

निसर्ग
कम्युनिकेशन्स

जीनोम क्रम जागतिक विखुरण्याचे मार्ग प्रकट करतात आणि समुद्री घोडे उत्क्रांतीमध्ये अभिसरण अनुवांशिक रूपांतर सुचवतात

बायोमार्कर टेक्नॉलॉजीज द्वारे पॅकबिओ सिक्वेन्सिंग, जीनोम डी नोव्हो असेंब्ली आणि भाष्य सेवा प्रदान केल्या गेल्या.

ठळक मुद्दे

1.15.5 Mb चे contig N50 सह उच्च दर्जाचे क्रोमोसोम-लेव्हल सीहॉर्स (हिप्पोकॅम्पस इरेक्टस) जीनोम प्राप्त झाले.

2.जगभरातील 21 समुद्री घोड्यांच्या प्रजातींमधून एकूण 358 जीनोम्सची पुनरावृत्ती करण्यात आली.

3. ओलिगोसीनच्या उत्तरार्धात उत्क्रांत झालेले समुद्री घोडे आणि त्यानंतरच्या परिक्रमा-जागतिक वसाहतीचे मार्ग ओळखले जातात आणि सागरी प्रवाह आणि पॅलेओटेम्पोरल सीवे ओपनिंगमधील बदलत्या गतिशीलतेशी जोडलेले आहेत.

4. आवर्ती "बोनी स्पाइन्स" अनुकूली फिनोटाइपचा अनुवांशिक आधार मुख्य विकासात्मक जीनमधील स्वतंत्र प्रतिस्थापनांशी जोडलेला आहे.

5.समुद्री प्रवाहांद्वारे राफ्टिंग खराब विखुरण्याची भरपाई करते आणि जलद अनुकूलन नवीन अधिवासांना वसाहत करणे सुलभ करते

उपलब्धी

अंजीर. 358 समुद्री घोड्याच्या नमुन्यांची अनुवांशिक विविधता आणि फिलोजेनेटिक संबंध

a22 गुणसूत्रांमधील 21 सीहॉर्स प्रजातींच्या न्यूक्लियोटाइड विविधता (π) च्या नमुन्यांसह नमुना केलेल्या समुद्री घोड्यांची भौगोलिक नमुने घेण्याची ठिकाणे.b 358 समुद्री घोड्यांच्या जीनोम-व्यापी SNP सह बांधलेले शेजारील झाड.(a) मधील स्थान पिन चिन्हे आणि (b) मधील शाखा पार्श्वभूमी एकमेकांशी सुसंगत आहेत.

अंजीर. 2 समुद्री घोड्यांची वसाहत आणि लोकसंख्याशास्त्रीय इतिहास

a21 सीहॉर्स प्रजातींसाठी फिलोजेनेटिक झाड आणि विचलन वेळ अंदाज.शाखा रेषेची जाडी ही लोकसंख्येच्या आकारमानाच्या अंदाजानुसार (Ne) आणि रंग भिन्न वंश दर्शवतात.I–III चिन्हे कॅलिब्रेशन बिंदू दर्शवतात.b–d विचलन वेळ, वितरण, विकारीयन्स इव्हेंट्स आणि सागरी प्रवाह (पांढरे बाण) यावर आधारित समुद्री घोड्यांच्या वसाहतीच्या मार्गांचा (रंगीत बाण) अंदाज.b इंडो-ऑस्ट्रेलियन द्वीपसमूह हे हिप्पोकॅम्पस वंशाचे उत्पत्तीचे केंद्र (लाल चिन्हांकित) होते, ज्यापूर्वी समुद्रातील घोडे 18-23 Ma मध्ये वैविध्यपूर्ण आणि जगभर पसरले होते.c सीहॉर्सेसने सुरुवातीला टेथ्यान सीवेद्वारे अटलांटिक महासागरावर वसाहत केली, जी बंद झाल्यानंतर (7-13 Ma दरम्यान टर्मिनल इव्हेंट), या टेथियन वंशाला त्याच्या हिंदी महासागरातील बहिणी वंशापासून वेगळे केले.नंतरचे, नंतर अरबी समुद्रात वेगाने वैविध्यपूर्ण (पिवळे चिन्हांकन), समुद्री घोडे विविधीकरणाचे दुसरे केंद्र स्थापित केले.d अटलांटिक महासागराची दुसरी सीहॉर्स वसाहतीची घटना हिंद महासागरातून सुमारे 5Ma च्या सुमारास दक्षिण आफ्रिकेचे टोक पार करून आणि शेवटी पनामा समुद्रमार्गे सुमारे 3.6 Ma वर पूर्व पॅसिफिक महासागरात पोहोचली.

अंजीर. 3 प्रभावी लोकसंख्येच्या आकारात जनुक प्रवाह आणि चढ-उतार

aदक्षिण अटलांटिक महासागरात राहणार्‍या प्रजातींमध्ये जनुक प्रवाह आढळला.G-PhoCS द्वारे काढलेले स्थलांतर दर म्हणून जीन प्रवाह पांढर्‍या रेषांजवळ दर्शविला जातो.बाणांची जाडी आणि दिशा अनुक्रमे जनुक प्रवाहाच्या दर आणि दिशा यांच्याशी संबंधित आहेत.b PSMC द्वारे प्रभावी लोकसंख्येच्या आकारात चढ-उतार.x अक्ष हा सध्याच्या वर्षापूर्वीचा काळ दर्शवतो तर y अक्ष प्रभावी लोकसंख्येचा आकार दर्शवतो.तक्ते प्रामुख्याने वेगवेगळ्या वितरण क्षेत्रांसह प्रत्येक प्रजातीच्या भौगोलिक वितरणानुसार आयोजित केले जातात.c मागील 1 दशलक्ष वर्षांमध्ये समुद्राची पातळी 33 मीटरमध्ये बदलते.पिवळी रेषा शेवटची जागतिक आंतरहिमशिखर दर्शवते तर निळसर सावली शेवटची हिमनदी कमाल कालावधी दर्शवते.

अंजीर 4 मणक्याची उत्क्रांती.

aडावीकडे, समुद्री घोड्यांमधील मणक्याची स्वतंत्र उत्क्रांती प्रदर्शित करणारे प्रजातींचे झाड.शाखेची लांबी प्रति साइट प्रतिस्थापनांची संख्या दर्शवते.चार काटेरी समुद्री घोड्यांच्या प्रजाती निळ्या रंगात हायलाइट केल्या आहेत.जाड शाखा bmp3 जनुकासाठी समानार्थी-ते-समानार्थी प्रतिस्थापनांच्या (dN/dS) उच्च दरांशी संबंधित आहेत.bmp3 जनुकासाठी कॅनोनिकल आणि सामान्यीकृत मॅकडोनाल्ड आणि क्रेटमॅन चाचणी (MKT) पार्श्वभूमी रंगांद्वारे ठळक केलेल्या भिन्न काटेरी आणि काटेरी नसलेल्या वैशिष्ट्यांसह तीन जोडीच्या भगिनी प्रजातींसाठी केली गेली, ज्यांचे महत्त्व पातळी अनुक्रमे निळ्या आणि लाल फॉन्टसह p मूल्याद्वारे दर्शविली गेली.बरोबर, bmp3 प्रोटीनमधील अमीनो ऍसिड प्रतिस्थापनांची तुलना, काटेरी सीहॉर्समधील पॉलीमॉर्फिक आणि निश्चित प्रतिस्थापन अनुक्रमे लाल आणि निळ्या वर्तुळांसह दर्शविलेले आहेत.b काटेरी समुद्री घोड्यांमध्ये काटेरी नसलेल्या प्रजातींच्या तुलनेत bmp3 मध्ये dN/dS मूल्यांचे वितरण.c bmp3 द्वारे एन्कोड केलेल्या प्रथिनांसाठी पुनर्रचना केलेल्या फायलोजेनेटिक झाडातील स्वतंत्र उत्क्रांती.d हिप्पोकॅम्पस इरेक्टसमध्ये bmp3 चे संकरीत संपूर्ण माउंट.

संदर्भ

ली सी आणि इतर.जीनोम अनुक्रम जागतिक विखुरण्याचे मार्ग प्रकट करतात आणि समुद्री घोडे उत्क्रांतीमध्ये अभिसरण अनुवांशिक रूपांतर सुचवतात.नॅट कम्युन.2021 फेब्रुवारी 17;12(1):1094.

बातम्या आणि ठळक बातम्या बायोमार्कर टेक्नॉलॉजीजसह नवीनतम यशस्वी प्रकरणे सामायिक करणे, नवीन वैज्ञानिक कामगिरी तसेच अभ्यासादरम्यान लागू केलेली प्रमुख तंत्रे कॅप्चर करणे हे उद्दिष्ट आहे.

पोस्ट वेळ: जानेवारी-06-2022