बातम्या

ट्रान्सपोजेबल एलिमेंट (TE) प्रवर्धन हे जीनोम आकाराचा विस्तार आणि उत्क्रांती मध्यस्थी करणारी प्रेरक शक्ती म्हणून ओळखले गेले आहे, परंतु 3D जीनोमिक आर्किटेक्चरला आकार देण्याचे परिणाम वनस्पतींमध्ये मोठ्या प्रमाणात अज्ञात आहेत.येथे, आम्ही कापसाच्या तीन प्रजातींसाठी संदर्भ-श्रेणीच्या जीनोम असेंब्लीचा अहवाल देतो, जीनोमच्या आकारात तिप्पट आहे, म्हणजेगॉसिपियम रोटुंडिफोलियम(K2),जी. आर्बोरियम(A2), आणिजी. रायमंडी(D5), Oxford Nanopore Technologies वापरून.तुलनात्मक जीनोमचे विश्लेषण मोठ्या जीनोम आकारातील फरकांमध्ये योगदान देणारे वंश-विशिष्ट TE प्रवर्धनाचे तपशील दस्तऐवजीकरण करतात (K2, 2.44 Gb; A2, 1.62 Gb; D5, 750.19 Mb), आणि जीनोममधील तुलनेने संरक्षित जनुक सामग्री आणि सिंटनी संबंध सूचित करतात.आम्हाला आढळले की अंदाजे 17% सिंटेनिक जीन्स सक्रिय (“A”) आणि निष्क्रिय (“B”) कंपार्टमेंटमध्ये क्रोमॅटिन स्थितीत बदल दर्शवतात आणि TE प्रवर्धक जनुकांच्या क्षेत्रांमध्ये (~ 7,000 जीन्स) ए कंपार्टमेंटचे प्रमाण वाढण्याशी संबंधित होते. ) D5 च्या सापेक्ष K2 आणि A2 मध्ये.तीन जीनोममध्ये केवळ 42% टोपोलॉजिकल असोसिएटिंग डोमेन (टीएडी) सीमा संरक्षित केल्या गेल्या.आमचा डेटा वंश-विशिष्ट TAD सीमांच्या निर्मितीनंतर TEs च्या अलीकडील प्रवर्धनास सूचित करतो.हा अभ्यास वनस्पतींमध्ये उच्च-क्रम क्रोमॅटिन संरचनेच्या उत्क्रांतीमध्ये ट्रान्सपोसॉन-मध्यस्थ जीनोम विस्ताराच्या भूमिकेवर प्रकाश टाकतो.